Protein–RNA interactions for Protein: P05014

IFNA4, Interferon alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA4P05014 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFNA4P05014 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNA4P05014 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNA4P05014 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNA4P05014 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNA4P05014 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNA4P05014 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNA4P05014 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNA4P05014 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFNA4P05014 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFNA4P05014 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFNA4P05014 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNA4P05014 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNA4P05014 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNA4P05014 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
IFNA4P05014 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFNA4P05014 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFNA4P05014 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFNA4P05014 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFNA4P05014 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFNA4P05014 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFNA4P05014 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFNA4P05014 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFNA4P05014 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFNA4P05014 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFNA4P05014 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFNA4P05014 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFNA4P05014 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFNA4P05014 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IFNA4P05014 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFNA4P05014 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
IFNA4P05014 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFNA4P05014 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFNA4P05014 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFNA4P05014 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IFNA4P05014 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IFNA4P05014 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IFNA4P05014 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IFNA4P05014 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
IFNA4P05014 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IFNA4P05014 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IFNA4P05014 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IFNA4P05014 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFNA4P05014 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFNA4P05014 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFNA4P05014 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFNA4P05014 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFNA4P05014 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFNA4P05014 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFNA4P05014 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IFNA4P05014 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IFNA4P05014 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IFNA4P05014 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IFNA4P05014 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IFNA4P05014 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IFNA4P05014 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IFNA4P05014 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IFNA4P05014 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
IFNA4P05014 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
IFNA4P05014 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
IFNA4P05014 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IFNA4P05014 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IFNA4P05014 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IFNA4P05014 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IFNA4P05014 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IFNA4P05014 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IFNA4P05014 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IFNA4P05014 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFNA4P05014 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFNA4P05014 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IFNA4P05014 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IFNA4P05014 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IFNA4P05014 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IFNA4P05014 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IFNA4P05014 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IFNA4P05014 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IFNA4P05014 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IFNA4P05014 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IFNA4P05014 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IFNA4P05014 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IFNA4P05014 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IFNA4P05014 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IFNA4P05014 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IFNA4P05014 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFNA4P05014 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFNA4P05014 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFNA4P05014 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFNA4P05014 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFNA4P05014 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IFNA4P05014 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IFNA4P05014 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IFNA4P05014 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
IFNA4P05014 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IFNA4P05014 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IFNA4P05014 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IFNA4P05014 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IFNA4P05014 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IFNA4P05014 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IFNA4P05014 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IFNA4P05014 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms