Protein–RNA interactions for Protein: P04217

A1BG, Alpha-1B-glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A1BGP04217 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
A1BGP04217 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
A1BGP04217 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
A1BGP04217 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
A1BGP04217 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
A1BGP04217 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
A1BGP04217 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
A1BGP04217 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
A1BGP04217 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
A1BGP04217 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
A1BGP04217 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
A1BGP04217 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
A1BGP04217 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
A1BGP04217 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
A1BGP04217 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
A1BGP04217 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
A1BGP04217 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
A1BGP04217 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.18
A1BGP04217 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
A1BGP04217 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
A1BGP04217 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
A1BGP04217 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
A1BGP04217 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
A1BGP04217 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
A1BGP04217 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
A1BGP04217 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
A1BGP04217 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
A1BGP04217 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
A1BGP04217 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
A1BGP04217 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
A1BGP04217 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
A1BGP04217 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
A1BGP04217 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
A1BGP04217 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
A1BGP04217 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
A1BGP04217 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
A1BGP04217 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
A1BGP04217 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
A1BGP04217 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
A1BGP04217 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
A1BGP04217 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
A1BGP04217 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
A1BGP04217 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
A1BGP04217 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
A1BGP04217 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
A1BGP04217 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
A1BGP04217 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
A1BGP04217 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
A1BGP04217 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
A1BGP04217 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
A1BGP04217 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
A1BGP04217 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
A1BGP04217 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.16
A1BGP04217 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.16
A1BGP04217 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
A1BGP04217 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
A1BGP04217 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
A1BGP04217 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
A1BGP04217 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
A1BGP04217 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC34.74■■■■□ 3.15
A1BGP04217 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
A1BGP04217 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
A1BGP04217 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
A1BGP04217 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
A1BGP04217 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
A1BGP04217 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
A1BGP04217 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
A1BGP04217 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
A1BGP04217 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
A1BGP04217 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
A1BGP04217 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
A1BGP04217 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.15
A1BGP04217 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
A1BGP04217 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
A1BGP04217 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
A1BGP04217 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
A1BGP04217 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
A1BGP04217 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
A1BGP04217 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
A1BGP04217 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
A1BGP04217 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
A1BGP04217 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
A1BGP04217 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
A1BGP04217 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
A1BGP04217 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
A1BGP04217 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
A1BGP04217 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
A1BGP04217 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
A1BGP04217 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
A1BGP04217 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
A1BGP04217 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC34.57■■■■□ 3.12
A1BGP04217 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
A1BGP04217 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
A1BGP04217 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
A1BGP04217 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
A1BGP04217 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
A1BGP04217 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
A1BGP04217 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
A1BGP04217 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
A1BGP04217 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms