Protein–RNA interactions for Protein: P01891

HLA-A, HLA class I histocompatibility antigen, A-68 alpha chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-AP01891 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HLA-AP01891 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HLA-AP01891 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-AP01891 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-AP01891 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-AP01891 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HLA-AP01891 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HLA-AP01891 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-AP01891 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-AP01891 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-AP01891 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-AP01891 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-AP01891 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-AP01891 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-AP01891 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-AP01891 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-AP01891 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-AP01891 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-AP01891 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-AP01891 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-AP01891 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-AP01891 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-AP01891 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-AP01891 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-AP01891 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-AP01891 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HLA-AP01891 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HLA-AP01891 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-AP01891 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-AP01891 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HLA-AP01891 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HLA-AP01891 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HLA-AP01891 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HLA-AP01891 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-AP01891 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-AP01891 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-AP01891 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HLA-AP01891 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HLA-AP01891 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HLA-AP01891 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HLA-AP01891 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HLA-AP01891 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HLA-AP01891 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HLA-AP01891 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HLA-AP01891 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HLA-AP01891 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HLA-AP01891 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HLA-AP01891 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HLA-AP01891 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLA-AP01891 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HLA-AP01891 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-AP01891 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-AP01891 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-AP01891 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-AP01891 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HLA-AP01891 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HLA-AP01891 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-AP01891 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-AP01891 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-AP01891 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-AP01891 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HLA-AP01891 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HLA-AP01891 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HLA-AP01891 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HLA-AP01891 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HLA-AP01891 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HLA-AP01891 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HLA-AP01891 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HLA-AP01891 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HLA-AP01891 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HLA-AP01891 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HLA-AP01891 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-AP01891 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-AP01891 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-AP01891 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-AP01891 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-AP01891 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-AP01891 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-AP01891 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HLA-AP01891 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HLA-AP01891 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HLA-AP01891 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-AP01891 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-AP01891 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-AP01891 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-AP01891 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-AP01891 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-AP01891 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-AP01891 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-AP01891 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-AP01891 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-AP01891 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-AP01891 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-AP01891 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-AP01891 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-AP01891 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-AP01891 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-AP01891 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-AP01891 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-AP01891 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms