Protein–RNA interactions for Protein: O95716

RAB3D, Ras-related protein Rab-3D, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3DO95716 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB3DO95716 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB3DO95716 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB3DO95716 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB3DO95716 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB3DO95716 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB3DO95716 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB3DO95716 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB3DO95716 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB3DO95716 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB3DO95716 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB3DO95716 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB3DO95716 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB3DO95716 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB3DO95716 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB3DO95716 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB3DO95716 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB3DO95716 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB3DO95716 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB3DO95716 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RAB3DO95716 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB3DO95716 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB3DO95716 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB3DO95716 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB3DO95716 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB3DO95716 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB3DO95716 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB3DO95716 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB3DO95716 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB3DO95716 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB3DO95716 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB3DO95716 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB3DO95716 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB3DO95716 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB3DO95716 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB3DO95716 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB3DO95716 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB3DO95716 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB3DO95716 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB3DO95716 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB3DO95716 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB3DO95716 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB3DO95716 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB3DO95716 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB3DO95716 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB3DO95716 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB3DO95716 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB3DO95716 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB3DO95716 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB3DO95716 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB3DO95716 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB3DO95716 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RAB3DO95716 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB3DO95716 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB3DO95716 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB3DO95716 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB3DO95716 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB3DO95716 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB3DO95716 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB3DO95716 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB3DO95716 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB3DO95716 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB3DO95716 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB3DO95716 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB3DO95716 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB3DO95716 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB3DO95716 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB3DO95716 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB3DO95716 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB3DO95716 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB3DO95716 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB3DO95716 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB3DO95716 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB3DO95716 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB3DO95716 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB3DO95716 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB3DO95716 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB3DO95716 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB3DO95716 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB3DO95716 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB3DO95716 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB3DO95716 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB3DO95716 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB3DO95716 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB3DO95716 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB3DO95716 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB3DO95716 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB3DO95716 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB3DO95716 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB3DO95716 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB3DO95716 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB3DO95716 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB3DO95716 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB3DO95716 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB3DO95716 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB3DO95716 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB3DO95716 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB3DO95716 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB3DO95716 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB3DO95716 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms