Protein–RNA interactions for Protein: O95219

SNX4, Sorting nexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX4O95219 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SNX4O95219 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNX4O95219 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNX4O95219 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX4O95219 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX4O95219 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX4O95219 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX4O95219 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX4O95219 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX4O95219 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX4O95219 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX4O95219 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNX4O95219 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNX4O95219 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNX4O95219 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNX4O95219 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX4O95219 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX4O95219 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX4O95219 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX4O95219 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNX4O95219 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNX4O95219 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNX4O95219 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNX4O95219 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX4O95219 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX4O95219 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX4O95219 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX4O95219 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX4O95219 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX4O95219 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX4O95219 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX4O95219 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX4O95219 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX4O95219 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX4O95219 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX4O95219 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX4O95219 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX4O95219 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX4O95219 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX4O95219 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX4O95219 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX4O95219 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX4O95219 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX4O95219 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX4O95219 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX4O95219 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX4O95219 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX4O95219 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SNX4O95219 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNX4O95219 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX4O95219 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX4O95219 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX4O95219 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX4O95219 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX4O95219 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX4O95219 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX4O95219 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX4O95219 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX4O95219 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX4O95219 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX4O95219 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX4O95219 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX4O95219 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX4O95219 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX4O95219 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX4O95219 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX4O95219 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX4O95219 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX4O95219 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX4O95219 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNX4O95219 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNX4O95219 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SNX4O95219 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX4O95219 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX4O95219 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX4O95219 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX4O95219 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX4O95219 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX4O95219 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX4O95219 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX4O95219 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX4O95219 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX4O95219 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNX4O95219 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX4O95219 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX4O95219 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX4O95219 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX4O95219 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX4O95219 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX4O95219 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX4O95219 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX4O95219 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX4O95219 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX4O95219 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX4O95219 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX4O95219 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX4O95219 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX4O95219 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX4O95219 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX4O95219 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.9 ms