Protein–RNA interactions for Protein: O95202

LETM1, Mitochondrial proton/calcium exchanger protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM1O95202 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
LETM1O95202 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
LETM1O95202 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
LETM1O95202 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
LETM1O95202 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
LETM1O95202 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
LETM1O95202 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
LETM1O95202 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
LETM1O95202 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
LETM1O95202 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
LETM1O95202 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
LETM1O95202 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
LETM1O95202 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
LETM1O95202 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
LETM1O95202 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
LETM1O95202 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
LETM1O95202 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
LETM1O95202 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
LETM1O95202 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
LETM1O95202 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
LETM1O95202 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
LETM1O95202 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
LETM1O95202 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
LETM1O95202 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
LETM1O95202 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
LETM1O95202 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
LETM1O95202 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
LETM1O95202 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
LETM1O95202 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
LETM1O95202 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
LETM1O95202 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
LETM1O95202 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
LETM1O95202 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
LETM1O95202 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
LETM1O95202 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
LETM1O95202 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
LETM1O95202 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
LETM1O95202 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
LETM1O95202 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
LETM1O95202 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
LETM1O95202 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
LETM1O95202 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
LETM1O95202 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
LETM1O95202 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
LETM1O95202 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
LETM1O95202 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
LETM1O95202 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
LETM1O95202 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
LETM1O95202 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
LETM1O95202 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
LETM1O95202 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
LETM1O95202 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
LETM1O95202 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
LETM1O95202 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
LETM1O95202 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
LETM1O95202 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
LETM1O95202 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
LETM1O95202 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
LETM1O95202 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
LETM1O95202 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
LETM1O95202 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
LETM1O95202 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
LETM1O95202 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
LETM1O95202 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
LETM1O95202 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
LETM1O95202 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
LETM1O95202 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
LETM1O95202 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
LETM1O95202 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
LETM1O95202 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
LETM1O95202 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
LETM1O95202 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
LETM1O95202 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
LETM1O95202 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
LETM1O95202 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
LETM1O95202 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
LETM1O95202 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
LETM1O95202 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
LETM1O95202 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
LETM1O95202 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
LETM1O95202 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
LETM1O95202 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
LETM1O95202 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
LETM1O95202 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
LETM1O95202 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
LETM1O95202 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
LETM1O95202 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
LETM1O95202 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
LETM1O95202 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
LETM1O95202 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
LETM1O95202 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
LETM1O95202 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
LETM1O95202 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
LETM1O95202 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
LETM1O95202 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
LETM1O95202 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
LETM1O95202 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
LETM1O95202 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
LETM1O95202 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
LETM1O95202 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms