Protein–RNA interactions for Protein: O94782

USP1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP1O94782 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP1O94782 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP1O94782 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP1O94782 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP1O94782 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP1O94782 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP1O94782 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP1O94782 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP1O94782 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP1O94782 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP1O94782 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP1O94782 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP1O94782 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP1O94782 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP1O94782 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP1O94782 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP1O94782 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP1O94782 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP1O94782 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP1O94782 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP1O94782 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP1O94782 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP1O94782 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP1O94782 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP1O94782 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP1O94782 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
USP1O94782 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP1O94782 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP1O94782 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP1O94782 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP1O94782 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP1O94782 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP1O94782 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP1O94782 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP1O94782 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP1O94782 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP1O94782 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP1O94782 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP1O94782 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP1O94782 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP1O94782 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP1O94782 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
USP1O94782 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP1O94782 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP1O94782 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP1O94782 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP1O94782 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP1O94782 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP1O94782 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP1O94782 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP1O94782 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP1O94782 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP1O94782 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP1O94782 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP1O94782 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP1O94782 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP1O94782 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP1O94782 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP1O94782 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP1O94782 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP1O94782 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP1O94782 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP1O94782 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP1O94782 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP1O94782 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP1O94782 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP1O94782 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP1O94782 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP1O94782 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP1O94782 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP1O94782 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP1O94782 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP1O94782 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP1O94782 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP1O94782 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP1O94782 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP1O94782 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP1O94782 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP1O94782 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP1O94782 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP1O94782 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP1O94782 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP1O94782 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP1O94782 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP1O94782 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP1O94782 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
USP1O94782 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
USP1O94782 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
USP1O94782 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP1O94782 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP1O94782 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP1O94782 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP1O94782 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
USP1O94782 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP1O94782 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP1O94782 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP1O94782 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP1O94782 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP1O94782 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP1O94782 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms