Protein–RNA interactions for Protein: O75844

ZMPSTE24, CAAX prenyl protease 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZMPSTE24O75844 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZMPSTE24O75844 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZMPSTE24O75844 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZMPSTE24O75844 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZMPSTE24O75844 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZMPSTE24O75844 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZMPSTE24O75844 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZMPSTE24O75844 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZMPSTE24O75844 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZMPSTE24O75844 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZMPSTE24O75844 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZMPSTE24O75844 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZMPSTE24O75844 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZMPSTE24O75844 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
ZMPSTE24O75844 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZMPSTE24O75844 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
ZMPSTE24O75844 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZMPSTE24O75844 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZMPSTE24O75844 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZMPSTE24O75844 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZMPSTE24O75844 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZMPSTE24O75844 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZMPSTE24O75844 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZMPSTE24O75844 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZMPSTE24O75844 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZMPSTE24O75844 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZMPSTE24O75844 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZMPSTE24O75844 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZMPSTE24O75844 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZMPSTE24O75844 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZMPSTE24O75844 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZMPSTE24O75844 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZMPSTE24O75844 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZMPSTE24O75844 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZMPSTE24O75844 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZMPSTE24O75844 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZMPSTE24O75844 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZMPSTE24O75844 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZMPSTE24O75844 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZMPSTE24O75844 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ZMPSTE24O75844 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZMPSTE24O75844 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZMPSTE24O75844 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZMPSTE24O75844 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZMPSTE24O75844 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZMPSTE24O75844 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZMPSTE24O75844 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZMPSTE24O75844 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZMPSTE24O75844 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZMPSTE24O75844 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZMPSTE24O75844 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZMPSTE24O75844 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZMPSTE24O75844 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZMPSTE24O75844 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZMPSTE24O75844 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZMPSTE24O75844 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZMPSTE24O75844 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZMPSTE24O75844 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZMPSTE24O75844 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZMPSTE24O75844 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZMPSTE24O75844 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZMPSTE24O75844 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ZMPSTE24O75844 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ZMPSTE24O75844 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZMPSTE24O75844 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZMPSTE24O75844 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZMPSTE24O75844 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZMPSTE24O75844 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ZMPSTE24O75844 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZMPSTE24O75844 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZMPSTE24O75844 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZMPSTE24O75844 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZMPSTE24O75844 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ZMPSTE24O75844 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZMPSTE24O75844 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZMPSTE24O75844 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZMPSTE24O75844 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZMPSTE24O75844 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZMPSTE24O75844 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZMPSTE24O75844 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZMPSTE24O75844 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZMPSTE24O75844 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZMPSTE24O75844 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ZMPSTE24O75844 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ZMPSTE24O75844 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ZMPSTE24O75844 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
ZMPSTE24O75844 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZMPSTE24O75844 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZMPSTE24O75844 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZMPSTE24O75844 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ZMPSTE24O75844 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZMPSTE24O75844 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZMPSTE24O75844 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZMPSTE24O75844 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZMPSTE24O75844 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZMPSTE24O75844 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZMPSTE24O75844 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZMPSTE24O75844 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZMPSTE24O75844 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZMPSTE24O75844 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms