Protein–RNA interactions for Protein: O75298

RTN2, Reticulon-2, humanhuman

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN2O75298 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RTN2O75298 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RTN2O75298 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
RTN2O75298 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RTN2O75298 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RTN2O75298 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RTN2O75298 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RTN2O75298 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RTN2O75298 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RTN2O75298 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RTN2O75298 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RTN2O75298 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RTN2O75298 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RTN2O75298 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RTN2O75298 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RTN2O75298 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RTN2O75298 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RTN2O75298 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RTN2O75298 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RTN2O75298 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RTN2O75298 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RTN2O75298 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RTN2O75298 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RTN2O75298 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RTN2O75298 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RTN2O75298 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RTN2O75298 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RTN2O75298 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RTN2O75298 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RTN2O75298 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
RTN2O75298 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RTN2O75298 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
RTN2O75298 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RTN2O75298 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RTN2O75298 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RTN2O75298 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RTN2O75298 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RTN2O75298 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RTN2O75298 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
RTN2O75298 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RTN2O75298 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RTN2O75298 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RTN2O75298 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RTN2O75298 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RTN2O75298 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RTN2O75298 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RTN2O75298 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RTN2O75298 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RTN2O75298 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RTN2O75298 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RTN2O75298 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RTN2O75298 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RTN2O75298 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RTN2O75298 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RTN2O75298 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RTN2O75298 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RTN2O75298 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RTN2O75298 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RTN2O75298 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RTN2O75298 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
RTN2O75298 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RTN2O75298 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RTN2O75298 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RTN2O75298 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RTN2O75298 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RTN2O75298 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RTN2O75298 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RTN2O75298 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RTN2O75298 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RTN2O75298 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RTN2O75298 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RTN2O75298 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RTN2O75298 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RTN2O75298 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RTN2O75298 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RTN2O75298 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RTN2O75298 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RTN2O75298 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
RTN2O75298 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RTN2O75298 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RTN2O75298 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
RTN2O75298 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RTN2O75298 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RTN2O75298 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RTN2O75298 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RTN2O75298 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RTN2O75298 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RTN2O75298 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RTN2O75298 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RTN2O75298 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RTN2O75298 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RTN2O75298 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RTN2O75298 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
RTN2O75298 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RTN2O75298 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RTN2O75298 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RTN2O75298 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RTN2O75298 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RTN2O75298 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RTN2O75298 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms