Protein–RNA interactions for Protein: O75113

N4BP1, NEDD4-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 896 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP1O75113 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
N4BP1O75113 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
N4BP1O75113 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
N4BP1O75113 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
N4BP1O75113 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
N4BP1O75113 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
N4BP1O75113 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
N4BP1O75113 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
N4BP1O75113 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
N4BP1O75113 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.37
N4BP1O75113 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
N4BP1O75113 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
N4BP1O75113 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
N4BP1O75113 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
N4BP1O75113 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
N4BP1O75113 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
N4BP1O75113 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
N4BP1O75113 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
N4BP1O75113 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
N4BP1O75113 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
N4BP1O75113 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
N4BP1O75113 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
N4BP1O75113 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
N4BP1O75113 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
N4BP1O75113 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
N4BP1O75113 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
N4BP1O75113 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
N4BP1O75113 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
N4BP1O75113 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
N4BP1O75113 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
N4BP1O75113 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
N4BP1O75113 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
N4BP1O75113 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
N4BP1O75113 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
N4BP1O75113 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
N4BP1O75113 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
N4BP1O75113 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
N4BP1O75113 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
N4BP1O75113 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
N4BP1O75113 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
N4BP1O75113 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
N4BP1O75113 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
N4BP1O75113 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
N4BP1O75113 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
N4BP1O75113 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
N4BP1O75113 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
N4BP1O75113 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
N4BP1O75113 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
N4BP1O75113 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
N4BP1O75113 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
N4BP1O75113 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
N4BP1O75113 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
N4BP1O75113 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
N4BP1O75113 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
N4BP1O75113 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
N4BP1O75113 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
N4BP1O75113 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
N4BP1O75113 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
N4BP1O75113 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
N4BP1O75113 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
N4BP1O75113 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
N4BP1O75113 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
N4BP1O75113 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
N4BP1O75113 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
N4BP1O75113 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
N4BP1O75113 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
N4BP1O75113 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
N4BP1O75113 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
N4BP1O75113 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
N4BP1O75113 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
N4BP1O75113 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
N4BP1O75113 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
N4BP1O75113 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
N4BP1O75113 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
N4BP1O75113 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
N4BP1O75113 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
N4BP1O75113 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
N4BP1O75113 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
N4BP1O75113 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
N4BP1O75113 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
N4BP1O75113 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
N4BP1O75113 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
N4BP1O75113 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
N4BP1O75113 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
N4BP1O75113 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
N4BP1O75113 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
N4BP1O75113 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
N4BP1O75113 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
N4BP1O75113 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
N4BP1O75113 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
N4BP1O75113 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
N4BP1O75113 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
N4BP1O75113 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
N4BP1O75113 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
N4BP1O75113 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
N4BP1O75113 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
N4BP1O75113 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
N4BP1O75113 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
N4BP1O75113 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
N4BP1O75113 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms