Protein–RNA interactions for Protein: O60333

KIF1B, Kinesin-like protein KIF1B, humanhuman

Predictions only

Length 1,816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF1BO60333 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.94
KIF1BO60333 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC39.63■■■■□ 3.94
KIF1BO60333 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
KIF1BO60333 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC39.62■■■■□ 3.93
KIF1BO60333 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
KIF1BO60333 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
KIF1BO60333 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC39.58■■■■□ 3.93
KIF1BO60333 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
KIF1BO60333 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
KIF1BO60333 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
KIF1BO60333 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.56■■■■□ 3.92
KIF1BO60333 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
KIF1BO60333 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
KIF1BO60333 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
KIF1BO60333 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.52■■■■□ 3.92
KIF1BO60333 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.52■■■■□ 3.92
KIF1BO60333 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.51■■■■□ 3.92
KIF1BO60333 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.48■■■■□ 3.91
KIF1BO60333 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC39.48■■■■□ 3.91
KIF1BO60333 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC39.45■■■■□ 3.91
KIF1BO60333 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
KIF1BO60333 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC39.44■■■■□ 3.9
KIF1BO60333 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
KIF1BO60333 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
KIF1BO60333 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
KIF1BO60333 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC39.41■■■■□ 3.9
KIF1BO60333 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC39.4■■■■□ 3.9
KIF1BO60333 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
KIF1BO60333 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
KIF1BO60333 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC39.4■■■■□ 3.9
KIF1BO60333 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
KIF1BO60333 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
KIF1BO60333 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC39.38■■■■□ 3.89
KIF1BO60333 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC39.37■■■■□ 3.89
KIF1BO60333 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
KIF1BO60333 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC39.36■■■■□ 3.89
KIF1BO60333 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC39.36■■■■□ 3.89
KIF1BO60333 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC39.36■■■■□ 3.89
KIF1BO60333 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC39.36■■■■□ 3.89
KIF1BO60333 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC39.36■■■■□ 3.89
KIF1BO60333 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC39.35■■■■□ 3.89
KIF1BO60333 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.35■■■■□ 3.89
KIF1BO60333 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
KIF1BO60333 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
KIF1BO60333 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
KIF1BO60333 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
KIF1BO60333 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC39.32■■■■□ 3.88
KIF1BO60333 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
KIF1BO60333 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC39.31■■■■□ 3.88
KIF1BO60333 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
KIF1BO60333 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC39.3■■■■□ 3.88
KIF1BO60333 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
KIF1BO60333 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
KIF1BO60333 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC39.26■■■■□ 3.88
KIF1BO60333 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.87
KIF1BO60333 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.87
KIF1BO60333 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
KIF1BO60333 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC39.25■■■■□ 3.87
KIF1BO60333 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.25■■■■□ 3.87
KIF1BO60333 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
KIF1BO60333 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
KIF1BO60333 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
KIF1BO60333 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
KIF1BO60333 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
KIF1BO60333 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
KIF1BO60333 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC39.18■■■■□ 3.86
KIF1BO60333 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
KIF1BO60333 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
KIF1BO60333 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC39.14■■■■□ 3.86
KIF1BO60333 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
KIF1BO60333 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.86
KIF1BO60333 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC39.13■■■■□ 3.85
KIF1BO60333 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
KIF1BO60333 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC39.12■■■■□ 3.85
KIF1BO60333 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
KIF1BO60333 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC39.12■■■■□ 3.85
KIF1BO60333 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC39.12■■■■□ 3.85
KIF1BO60333 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC39.12■■■■□ 3.85
KIF1BO60333 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
KIF1BO60333 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC39.1■■■■□ 3.85
KIF1BO60333 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
KIF1BO60333 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
KIF1BO60333 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
KIF1BO60333 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
KIF1BO60333 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
KIF1BO60333 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
KIF1BO60333 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
KIF1BO60333 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.07■■■■□ 3.84
KIF1BO60333 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC39.05■■■■□ 3.84
KIF1BO60333 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
KIF1BO60333 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
KIF1BO60333 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC39.03■■■■□ 3.84
KIF1BO60333 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
KIF1BO60333 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC39.01■■■■□ 3.84
KIF1BO60333 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
KIF1BO60333 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
KIF1BO60333 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
KIF1BO60333 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC38.98■■■■□ 3.83
KIF1BO60333 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
KIF1BO60333 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms