Protein–RNA interactions for Protein: O43617

TRAPPC3, Trafficking protein particle complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3O43617 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRAPPC3O43617 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRAPPC3O43617 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRAPPC3O43617 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRAPPC3O43617 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRAPPC3O43617 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
TRAPPC3O43617 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRAPPC3O43617 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRAPPC3O43617 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRAPPC3O43617 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRAPPC3O43617 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRAPPC3O43617 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRAPPC3O43617 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRAPPC3O43617 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRAPPC3O43617 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRAPPC3O43617 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRAPPC3O43617 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
TRAPPC3O43617 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
TRAPPC3O43617 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRAPPC3O43617 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRAPPC3O43617 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRAPPC3O43617 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRAPPC3O43617 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRAPPC3O43617 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRAPPC3O43617 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRAPPC3O43617 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRAPPC3O43617 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRAPPC3O43617 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRAPPC3O43617 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
TRAPPC3O43617 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRAPPC3O43617 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRAPPC3O43617 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRAPPC3O43617 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRAPPC3O43617 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRAPPC3O43617 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRAPPC3O43617 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRAPPC3O43617 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRAPPC3O43617 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
TRAPPC3O43617 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRAPPC3O43617 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRAPPC3O43617 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRAPPC3O43617 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRAPPC3O43617 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRAPPC3O43617 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRAPPC3O43617 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRAPPC3O43617 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRAPPC3O43617 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
TRAPPC3O43617 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRAPPC3O43617 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRAPPC3O43617 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRAPPC3O43617 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRAPPC3O43617 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRAPPC3O43617 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRAPPC3O43617 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRAPPC3O43617 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
TRAPPC3O43617 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRAPPC3O43617 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRAPPC3O43617 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRAPPC3O43617 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRAPPC3O43617 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRAPPC3O43617 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRAPPC3O43617 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
TRAPPC3O43617 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRAPPC3O43617 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRAPPC3O43617 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRAPPC3O43617 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRAPPC3O43617 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRAPPC3O43617 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRAPPC3O43617 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRAPPC3O43617 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRAPPC3O43617 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRAPPC3O43617 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRAPPC3O43617 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRAPPC3O43617 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRAPPC3O43617 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRAPPC3O43617 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRAPPC3O43617 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRAPPC3O43617 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
TRAPPC3O43617 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRAPPC3O43617 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRAPPC3O43617 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRAPPC3O43617 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRAPPC3O43617 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRAPPC3O43617 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
TRAPPC3O43617 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TRAPPC3O43617 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRAPPC3O43617 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRAPPC3O43617 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRAPPC3O43617 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRAPPC3O43617 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRAPPC3O43617 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRAPPC3O43617 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRAPPC3O43617 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRAPPC3O43617 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRAPPC3O43617 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRAPPC3O43617 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRAPPC3O43617 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TRAPPC3O43617 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRAPPC3O43617 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRAPPC3O43617 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms