Protein–RNA interactions for Protein: O43581

SYT7, Synaptotagmin-7, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT7O43581 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYT7O43581 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SYT7O43581 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYT7O43581 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYT7O43581 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYT7O43581 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYT7O43581 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYT7O43581 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYT7O43581 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYT7O43581 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYT7O43581 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYT7O43581 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYT7O43581 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYT7O43581 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYT7O43581 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYT7O43581 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYT7O43581 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SYT7O43581 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYT7O43581 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYT7O43581 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYT7O43581 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYT7O43581 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYT7O43581 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYT7O43581 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYT7O43581 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYT7O43581 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYT7O43581 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYT7O43581 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYT7O43581 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYT7O43581 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYT7O43581 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYT7O43581 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYT7O43581 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYT7O43581 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYT7O43581 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYT7O43581 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYT7O43581 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SYT7O43581 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYT7O43581 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYT7O43581 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYT7O43581 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYT7O43581 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYT7O43581 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYT7O43581 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYT7O43581 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYT7O43581 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYT7O43581 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYT7O43581 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYT7O43581 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYT7O43581 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SYT7O43581 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SYT7O43581 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYT7O43581 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYT7O43581 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYT7O43581 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYT7O43581 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYT7O43581 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYT7O43581 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYT7O43581 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYT7O43581 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYT7O43581 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYT7O43581 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYT7O43581 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYT7O43581 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYT7O43581 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYT7O43581 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYT7O43581 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYT7O43581 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYT7O43581 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYT7O43581 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYT7O43581 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYT7O43581 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYT7O43581 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYT7O43581 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYT7O43581 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYT7O43581 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SYT7O43581 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYT7O43581 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYT7O43581 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYT7O43581 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYT7O43581 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYT7O43581 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYT7O43581 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYT7O43581 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYT7O43581 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYT7O43581 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYT7O43581 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYT7O43581 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYT7O43581 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYT7O43581 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYT7O43581 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SYT7O43581 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYT7O43581 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYT7O43581 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYT7O43581 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYT7O43581 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYT7O43581 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYT7O43581 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
SYT7O43581 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYT7O43581 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms