Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLOCKO15516 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLOCKO15516 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLOCKO15516 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLOCKO15516 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLOCKO15516 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLOCKO15516 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLOCKO15516 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLOCKO15516 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLOCKO15516 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLOCKO15516 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLOCKO15516 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLOCKO15516 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLOCKO15516 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLOCKO15516 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CLOCKO15516 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLOCKO15516 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLOCKO15516 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLOCKO15516 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLOCKO15516 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLOCKO15516 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLOCKO15516 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLOCKO15516 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLOCKO15516 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLOCKO15516 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLOCKO15516 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLOCKO15516 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLOCKO15516 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLOCKO15516 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLOCKO15516 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLOCKO15516 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLOCKO15516 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLOCKO15516 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLOCKO15516 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLOCKO15516 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLOCKO15516 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLOCKO15516 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLOCKO15516 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLOCKO15516 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLOCKO15516 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLOCKO15516 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLOCKO15516 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLOCKO15516 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLOCKO15516 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLOCKO15516 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLOCKO15516 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLOCKO15516 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLOCKO15516 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLOCKO15516 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLOCKO15516 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLOCKO15516 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLOCKO15516 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLOCKO15516 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLOCKO15516 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLOCKO15516 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLOCKO15516 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLOCKO15516 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLOCKO15516 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLOCKO15516 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLOCKO15516 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLOCKO15516 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLOCKO15516 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CLOCKO15516 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLOCKO15516 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLOCKO15516 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLOCKO15516 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLOCKO15516 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLOCKO15516 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLOCKO15516 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLOCKO15516 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLOCKO15516 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLOCKO15516 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLOCKO15516 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLOCKO15516 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLOCKO15516 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLOCKO15516 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLOCKO15516 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLOCKO15516 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLOCKO15516 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CLOCKO15516 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CLOCKO15516 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CLOCKO15516 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLOCKO15516 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLOCKO15516 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLOCKO15516 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLOCKO15516 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLOCKO15516 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLOCKO15516 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLOCKO15516 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLOCKO15516 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLOCKO15516 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLOCKO15516 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLOCKO15516 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLOCKO15516 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CLOCKO15516 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLOCKO15516 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLOCKO15516 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLOCKO15516 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLOCKO15516 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLOCKO15516 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms