Protein–RNA interactions for Protein: O15198

SMAD9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD9O15198 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMAD9O15198 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMAD9O15198 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMAD9O15198 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMAD9O15198 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMAD9O15198 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMAD9O15198 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMAD9O15198 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMAD9O15198 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMAD9O15198 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMAD9O15198 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMAD9O15198 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMAD9O15198 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMAD9O15198 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMAD9O15198 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMAD9O15198 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMAD9O15198 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMAD9O15198 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMAD9O15198 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SMAD9O15198 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMAD9O15198 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SMAD9O15198 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SMAD9O15198 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SMAD9O15198 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SMAD9O15198 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMAD9O15198 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMAD9O15198 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMAD9O15198 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMAD9O15198 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMAD9O15198 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMAD9O15198 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMAD9O15198 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMAD9O15198 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMAD9O15198 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMAD9O15198 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMAD9O15198 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMAD9O15198 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SMAD9O15198 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMAD9O15198 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMAD9O15198 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMAD9O15198 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMAD9O15198 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMAD9O15198 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMAD9O15198 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMAD9O15198 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMAD9O15198 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMAD9O15198 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMAD9O15198 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMAD9O15198 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMAD9O15198 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMAD9O15198 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMAD9O15198 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMAD9O15198 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMAD9O15198 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMAD9O15198 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMAD9O15198 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMAD9O15198 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMAD9O15198 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMAD9O15198 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMAD9O15198 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMAD9O15198 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMAD9O15198 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMAD9O15198 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMAD9O15198 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMAD9O15198 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMAD9O15198 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMAD9O15198 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMAD9O15198 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMAD9O15198 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMAD9O15198 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMAD9O15198 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMAD9O15198 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMAD9O15198 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMAD9O15198 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMAD9O15198 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMAD9O15198 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMAD9O15198 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMAD9O15198 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMAD9O15198 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMAD9O15198 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMAD9O15198 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMAD9O15198 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMAD9O15198 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMAD9O15198 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMAD9O15198 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMAD9O15198 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMAD9O15198 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMAD9O15198 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMAD9O15198 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SMAD9O15198 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMAD9O15198 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SMAD9O15198 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMAD9O15198 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMAD9O15198 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SMAD9O15198 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMAD9O15198 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMAD9O15198 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SMAD9O15198 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMAD9O15198 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMAD9O15198 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms