Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
RFXAPO00287 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RFXAPO00287 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RFXAPO00287 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RFXAPO00287 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RFXAPO00287 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RFXAPO00287 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RFXAPO00287 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RFXAPO00287 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RFXAPO00287 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RFXAPO00287 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
RFXAPO00287 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RFXAPO00287 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RFXAPO00287 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
RFXAPO00287 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RFXAPO00287 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RFXAPO00287 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RFXAPO00287 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RFXAPO00287 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RFXAPO00287 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RFXAPO00287 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RFXAPO00287 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RFXAPO00287 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RFXAPO00287 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RFXAPO00287 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RFXAPO00287 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RFXAPO00287 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
RFXAPO00287 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RFXAPO00287 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
RFXAPO00287 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RFXAPO00287 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RFXAPO00287 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RFXAPO00287 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RFXAPO00287 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RFXAPO00287 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
RFXAPO00287 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RFXAPO00287 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RFXAPO00287 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RFXAPO00287 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RFXAPO00287 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
RFXAPO00287 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RFXAPO00287 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RFXAPO00287 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RFXAPO00287 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RFXAPO00287 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RFXAPO00287 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RFXAPO00287 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RFXAPO00287 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RFXAPO00287 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
RFXAPO00287 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
RFXAPO00287 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RFXAPO00287 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RFXAPO00287 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RFXAPO00287 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RFXAPO00287 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RFXAPO00287 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RFXAPO00287 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RFXAPO00287 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RFXAPO00287 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RFXAPO00287 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RFXAPO00287 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RFXAPO00287 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RFXAPO00287 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
RFXAPO00287 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
RFXAPO00287 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RFXAPO00287 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RFXAPO00287 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RFXAPO00287 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RFXAPO00287 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
RFXAPO00287 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RFXAPO00287 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RFXAPO00287 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
RFXAPO00287 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RFXAPO00287 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
RFXAPO00287 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RFXAPO00287 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RFXAPO00287 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
RFXAPO00287 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
RFXAPO00287 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
RFXAPO00287 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RFXAPO00287 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RFXAPO00287 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RFXAPO00287 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RFXAPO00287 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RFXAPO00287 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RFXAPO00287 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RFXAPO00287 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RFXAPO00287 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RFXAPO00287 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RFXAPO00287 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RFXAPO00287 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RFXAPO00287 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RFXAPO00287 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RFXAPO00287 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RFXAPO00287 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RFXAPO00287 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RFXAPO00287 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RFXAPO00287 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RFXAPO00287 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RFXAPO00287 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
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