Protein–RNA interactions for Protein: H3BQ06

Uncharacterized protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQ06 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
H3BQ06 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
H3BQ06 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
H3BQ06 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
H3BQ06 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
H3BQ06 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
H3BQ06 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
H3BQ06 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
H3BQ06 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
H3BQ06 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
H3BQ06 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
H3BQ06 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
H3BQ06 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
H3BQ06 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
H3BQ06 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
H3BQ06 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
H3BQ06 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
H3BQ06 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
H3BQ06 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
H3BQ06 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
H3BQ06 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
H3BQ06 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
H3BQ06 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
H3BQ06 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
H3BQ06 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
H3BQ06 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
H3BQ06 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
H3BQ06 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
H3BQ06 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
H3BQ06 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
H3BQ06 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
H3BQ06 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
H3BQ06 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
H3BQ06 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
H3BQ06 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
H3BQ06 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
H3BQ06 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
H3BQ06 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
H3BQ06 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
H3BQ06 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
H3BQ06 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
H3BQ06 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
H3BQ06 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
H3BQ06 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
H3BQ06 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
H3BQ06 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
H3BQ06 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
H3BQ06 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
H3BQ06 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
H3BQ06 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
H3BQ06 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
H3BQ06 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
H3BQ06 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
H3BQ06 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
H3BQ06 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
H3BQ06 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
H3BQ06 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
H3BQ06 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
H3BQ06 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
H3BQ06 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
H3BQ06 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
H3BQ06 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
H3BQ06 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
H3BQ06 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
H3BQ06 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
H3BQ06 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
H3BQ06 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
H3BQ06 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
H3BQ06 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
H3BQ06 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
H3BQ06 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
H3BQ06 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
H3BQ06 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
H3BQ06 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
H3BQ06 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
H3BQ06 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
H3BQ06 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
H3BQ06 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
H3BQ06 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
H3BQ06 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
H3BQ06 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
H3BQ06 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
H3BQ06 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
H3BQ06 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
H3BQ06 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
H3BQ06 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
H3BQ06 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
H3BQ06 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
H3BQ06 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
H3BQ06 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
H3BQ06 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
H3BQ06 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
H3BQ06 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
H3BQ06 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
H3BQ06 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
H3BQ06 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
H3BQ06 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
H3BQ06 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
H3BQ06 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
H3BQ06 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms