Protein–RNA interactions for Protein: B3EWG3

FAM25A, Protein FAM25A, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM25AB3EWG3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM25AB3EWG3 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM25AB3EWG3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM25AB3EWG3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM25AB3EWG3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM25AB3EWG3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM25AB3EWG3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM25AB3EWG3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM25AB3EWG3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM25AB3EWG3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM25AB3EWG3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM25AB3EWG3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM25AB3EWG3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM25AB3EWG3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM25AB3EWG3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM25AB3EWG3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM25AB3EWG3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM25AB3EWG3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
FAM25AB3EWG3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM25AB3EWG3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM25AB3EWG3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM25AB3EWG3 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM25AB3EWG3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM25AB3EWG3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM25AB3EWG3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM25AB3EWG3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM25AB3EWG3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM25AB3EWG3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM25AB3EWG3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM25AB3EWG3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM25AB3EWG3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM25AB3EWG3 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM25AB3EWG3 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM25AB3EWG3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM25AB3EWG3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM25AB3EWG3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM25AB3EWG3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM25AB3EWG3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM25AB3EWG3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM25AB3EWG3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM25AB3EWG3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM25AB3EWG3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM25AB3EWG3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM25AB3EWG3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM25AB3EWG3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM25AB3EWG3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM25AB3EWG3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM25AB3EWG3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM25AB3EWG3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM25AB3EWG3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM25AB3EWG3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM25AB3EWG3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM25AB3EWG3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM25AB3EWG3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM25AB3EWG3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM25AB3EWG3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM25AB3EWG3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM25AB3EWG3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM25AB3EWG3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FAM25AB3EWG3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM25AB3EWG3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM25AB3EWG3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM25AB3EWG3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM25AB3EWG3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM25AB3EWG3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM25AB3EWG3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM25AB3EWG3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM25AB3EWG3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM25AB3EWG3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM25AB3EWG3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM25AB3EWG3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM25AB3EWG3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM25AB3EWG3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM25AB3EWG3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM25AB3EWG3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM25AB3EWG3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM25AB3EWG3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM25AB3EWG3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM25AB3EWG3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM25AB3EWG3 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM25AB3EWG3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM25AB3EWG3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM25AB3EWG3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM25AB3EWG3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM25AB3EWG3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM25AB3EWG3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM25AB3EWG3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM25AB3EWG3 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM25AB3EWG3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM25AB3EWG3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM25AB3EWG3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM25AB3EWG3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM25AB3EWG3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM25AB3EWG3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM25AB3EWG3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM25AB3EWG3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM25AB3EWG3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM25AB3EWG3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM25AB3EWG3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM25AB3EWG3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms