Protein–RNA interactions for Protein: A2RU48

SMCO3, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO3A2RU48 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMCO3A2RU48 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMCO3A2RU48 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMCO3A2RU48 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMCO3A2RU48 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMCO3A2RU48 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMCO3A2RU48 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMCO3A2RU48 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMCO3A2RU48 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMCO3A2RU48 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMCO3A2RU48 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMCO3A2RU48 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMCO3A2RU48 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMCO3A2RU48 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMCO3A2RU48 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMCO3A2RU48 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMCO3A2RU48 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMCO3A2RU48 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMCO3A2RU48 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMCO3A2RU48 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMCO3A2RU48 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMCO3A2RU48 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMCO3A2RU48 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMCO3A2RU48 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMCO3A2RU48 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMCO3A2RU48 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMCO3A2RU48 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMCO3A2RU48 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMCO3A2RU48 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMCO3A2RU48 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMCO3A2RU48 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMCO3A2RU48 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SMCO3A2RU48 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMCO3A2RU48 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMCO3A2RU48 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMCO3A2RU48 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMCO3A2RU48 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMCO3A2RU48 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMCO3A2RU48 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMCO3A2RU48 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMCO3A2RU48 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMCO3A2RU48 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMCO3A2RU48 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMCO3A2RU48 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMCO3A2RU48 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMCO3A2RU48 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMCO3A2RU48 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMCO3A2RU48 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMCO3A2RU48 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SMCO3A2RU48 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMCO3A2RU48 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMCO3A2RU48 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMCO3A2RU48 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMCO3A2RU48 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMCO3A2RU48 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMCO3A2RU48 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMCO3A2RU48 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMCO3A2RU48 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMCO3A2RU48 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMCO3A2RU48 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMCO3A2RU48 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMCO3A2RU48 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMCO3A2RU48 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMCO3A2RU48 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMCO3A2RU48 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMCO3A2RU48 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMCO3A2RU48 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMCO3A2RU48 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMCO3A2RU48 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMCO3A2RU48 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMCO3A2RU48 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMCO3A2RU48 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMCO3A2RU48 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMCO3A2RU48 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMCO3A2RU48 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMCO3A2RU48 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMCO3A2RU48 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMCO3A2RU48 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMCO3A2RU48 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMCO3A2RU48 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMCO3A2RU48 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMCO3A2RU48 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMCO3A2RU48 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMCO3A2RU48 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMCO3A2RU48 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMCO3A2RU48 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMCO3A2RU48 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMCO3A2RU48 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMCO3A2RU48 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMCO3A2RU48 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMCO3A2RU48 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMCO3A2RU48 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMCO3A2RU48 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMCO3A2RU48 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMCO3A2RU48 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMCO3A2RU48 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMCO3A2RU48 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMCO3A2RU48 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SMCO3A2RU48 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMCO3A2RU48 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms