Protein–RNA interactions for Protein: A0PJX4

SHISA3, Protein shisa-3 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA3A0PJX4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHISA3A0PJX4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHISA3A0PJX4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHISA3A0PJX4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHISA3A0PJX4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHISA3A0PJX4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHISA3A0PJX4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHISA3A0PJX4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHISA3A0PJX4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHISA3A0PJX4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHISA3A0PJX4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHISA3A0PJX4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHISA3A0PJX4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SHISA3A0PJX4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SHISA3A0PJX4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SHISA3A0PJX4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHISA3A0PJX4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SHISA3A0PJX4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SHISA3A0PJX4 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SHISA3A0PJX4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SHISA3A0PJX4 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SHISA3A0PJX4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SHISA3A0PJX4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SHISA3A0PJX4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SHISA3A0PJX4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SHISA3A0PJX4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SHISA3A0PJX4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SHISA3A0PJX4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SHISA3A0PJX4 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SHISA3A0PJX4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SHISA3A0PJX4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SHISA3A0PJX4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SHISA3A0PJX4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SHISA3A0PJX4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SHISA3A0PJX4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SHISA3A0PJX4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SHISA3A0PJX4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SHISA3A0PJX4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SHISA3A0PJX4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SHISA3A0PJX4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SHISA3A0PJX4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SHISA3A0PJX4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SHISA3A0PJX4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SHISA3A0PJX4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SHISA3A0PJX4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SHISA3A0PJX4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SHISA3A0PJX4 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SHISA3A0PJX4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHISA3A0PJX4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHISA3A0PJX4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHISA3A0PJX4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHISA3A0PJX4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHISA3A0PJX4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SHISA3A0PJX4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SHISA3A0PJX4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SHISA3A0PJX4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SHISA3A0PJX4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SHISA3A0PJX4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHISA3A0PJX4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHISA3A0PJX4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHISA3A0PJX4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHISA3A0PJX4 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHISA3A0PJX4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHISA3A0PJX4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHISA3A0PJX4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHISA3A0PJX4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHISA3A0PJX4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SHISA3A0PJX4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHISA3A0PJX4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHISA3A0PJX4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHISA3A0PJX4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHISA3A0PJX4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHISA3A0PJX4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHISA3A0PJX4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHISA3A0PJX4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHISA3A0PJX4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHISA3A0PJX4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHISA3A0PJX4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHISA3A0PJX4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHISA3A0PJX4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHISA3A0PJX4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHISA3A0PJX4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHISA3A0PJX4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHISA3A0PJX4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHISA3A0PJX4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHISA3A0PJX4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHISA3A0PJX4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHISA3A0PJX4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHISA3A0PJX4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHISA3A0PJX4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHISA3A0PJX4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHISA3A0PJX4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHISA3A0PJX4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHISA3A0PJX4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHISA3A0PJX4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHISA3A0PJX4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHISA3A0PJX4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SHISA3A0PJX4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHISA3A0PJX4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHISA3A0PJX4 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms