Protein–RNA interactions for Protein: A0A599

TCRBV5S2, T-cell receptor beta variable 5-6 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCRBV5S2A0A599 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TCRBV5S2A0A599 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TCRBV5S2A0A599 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TCRBV5S2A0A599 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TCRBV5S2A0A599 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TCRBV5S2A0A599 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TCRBV5S2A0A599 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TCRBV5S2A0A599 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TCRBV5S2A0A599 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TCRBV5S2A0A599 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCRBV5S2A0A599 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCRBV5S2A0A599 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TCRBV5S2A0A599 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TCRBV5S2A0A599 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCRBV5S2A0A599 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCRBV5S2A0A599 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TCRBV5S2A0A599 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TCRBV5S2A0A599 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TCRBV5S2A0A599 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TCRBV5S2A0A599 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TCRBV5S2A0A599 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TCRBV5S2A0A599 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TCRBV5S2A0A599 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TCRBV5S2A0A599 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCRBV5S2A0A599 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TCRBV5S2A0A599 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCRBV5S2A0A599 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCRBV5S2A0A599 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TCRBV5S2A0A599 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TCRBV5S2A0A599 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TCRBV5S2A0A599 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCRBV5S2A0A599 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCRBV5S2A0A599 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCRBV5S2A0A599 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TCRBV5S2A0A599 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TCRBV5S2A0A599 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCRBV5S2A0A599 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCRBV5S2A0A599 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCRBV5S2A0A599 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TCRBV5S2A0A599 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TCRBV5S2A0A599 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TCRBV5S2A0A599 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TCRBV5S2A0A599 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TCRBV5S2A0A599 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TCRBV5S2A0A599 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TCRBV5S2A0A599 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TCRBV5S2A0A599 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TCRBV5S2A0A599 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCRBV5S2A0A599 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCRBV5S2A0A599 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCRBV5S2A0A599 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCRBV5S2A0A599 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCRBV5S2A0A599 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCRBV5S2A0A599 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCRBV5S2A0A599 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCRBV5S2A0A599 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCRBV5S2A0A599 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCRBV5S2A0A599 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TCRBV5S2A0A599 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCRBV5S2A0A599 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCRBV5S2A0A599 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCRBV5S2A0A599 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCRBV5S2A0A599 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCRBV5S2A0A599 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TCRBV5S2A0A599 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TCRBV5S2A0A599 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TCRBV5S2A0A599 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TCRBV5S2A0A599 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TCRBV5S2A0A599 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TCRBV5S2A0A599 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TCRBV5S2A0A599 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TCRBV5S2A0A599 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCRBV5S2A0A599 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCRBV5S2A0A599 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCRBV5S2A0A599 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCRBV5S2A0A599 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TCRBV5S2A0A599 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TCRBV5S2A0A599 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TCRBV5S2A0A599 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TCRBV5S2A0A599 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TCRBV5S2A0A599 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TCRBV5S2A0A599 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TCRBV5S2A0A599 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TCRBV5S2A0A599 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TCRBV5S2A0A599 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TCRBV5S2A0A599 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TCRBV5S2A0A599 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCRBV5S2A0A599 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCRBV5S2A0A599 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCRBV5S2A0A599 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCRBV5S2A0A599 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCRBV5S2A0A599 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCRBV5S2A0A599 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCRBV5S2A0A599 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TCRBV5S2A0A599 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TCRBV5S2A0A599 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TCRBV5S2A0A599 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TCRBV5S2A0A599 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TCRBV5S2A0A599 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TCRBV5S2A0A599 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
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