Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GUJ8

PNMA8C, Paraneoplastic antigen-like protein 8C, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8CA0A1B0GUJ8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PNMA8CA0A1B0GUJ8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PNMA8CA0A1B0GUJ8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PNMA8CA0A1B0GUJ8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PNMA8CA0A1B0GUJ8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PNMA8CA0A1B0GUJ8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PNMA8CA0A1B0GUJ8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PNMA8CA0A1B0GUJ8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PNMA8CA0A1B0GUJ8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PNMA8CA0A1B0GUJ8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PNMA8CA0A1B0GUJ8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PNMA8CA0A1B0GUJ8 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PNMA8CA0A1B0GUJ8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PNMA8CA0A1B0GUJ8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PNMA8CA0A1B0GUJ8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PNMA8CA0A1B0GUJ8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PNMA8CA0A1B0GUJ8 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PNMA8CA0A1B0GUJ8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PNMA8CA0A1B0GUJ8 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PNMA8CA0A1B0GUJ8 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PNMA8CA0A1B0GUJ8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PNMA8CA0A1B0GUJ8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PNMA8CA0A1B0GUJ8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PNMA8CA0A1B0GUJ8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNMA8CA0A1B0GUJ8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNMA8CA0A1B0GUJ8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNMA8CA0A1B0GUJ8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNMA8CA0A1B0GUJ8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNMA8CA0A1B0GUJ8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PNMA8CA0A1B0GUJ8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PNMA8CA0A1B0GUJ8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNMA8CA0A1B0GUJ8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PNMA8CA0A1B0GUJ8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PNMA8CA0A1B0GUJ8 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PNMA8CA0A1B0GUJ8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PNMA8CA0A1B0GUJ8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PNMA8CA0A1B0GUJ8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PNMA8CA0A1B0GUJ8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNMA8CA0A1B0GUJ8 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNMA8CA0A1B0GUJ8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PNMA8CA0A1B0GUJ8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PNMA8CA0A1B0GUJ8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PNMA8CA0A1B0GUJ8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PNMA8CA0A1B0GUJ8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PNMA8CA0A1B0GUJ8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PNMA8CA0A1B0GUJ8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PNMA8CA0A1B0GUJ8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PNMA8CA0A1B0GUJ8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PNMA8CA0A1B0GUJ8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PNMA8CA0A1B0GUJ8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PNMA8CA0A1B0GUJ8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PNMA8CA0A1B0GUJ8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PNMA8CA0A1B0GUJ8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PNMA8CA0A1B0GUJ8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PNMA8CA0A1B0GUJ8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PNMA8CA0A1B0GUJ8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PNMA8CA0A1B0GUJ8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PNMA8CA0A1B0GUJ8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PNMA8CA0A1B0GUJ8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNMA8CA0A1B0GUJ8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNMA8CA0A1B0GUJ8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNMA8CA0A1B0GUJ8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNMA8CA0A1B0GUJ8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PNMA8CA0A1B0GUJ8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PNMA8CA0A1B0GUJ8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PNMA8CA0A1B0GUJ8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PNMA8CA0A1B0GUJ8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PNMA8CA0A1B0GUJ8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PNMA8CA0A1B0GUJ8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PNMA8CA0A1B0GUJ8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PNMA8CA0A1B0GUJ8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PNMA8CA0A1B0GUJ8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNMA8CA0A1B0GUJ8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PNMA8CA0A1B0GUJ8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PNMA8CA0A1B0GUJ8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNMA8CA0A1B0GUJ8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNMA8CA0A1B0GUJ8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNMA8CA0A1B0GUJ8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNMA8CA0A1B0GUJ8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PNMA8CA0A1B0GUJ8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.43
PNMA8CA0A1B0GUJ8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNMA8CA0A1B0GUJ8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PNMA8CA0A1B0GUJ8 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PNMA8CA0A1B0GUJ8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PNMA8CA0A1B0GUJ8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PNMA8CA0A1B0GUJ8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PNMA8CA0A1B0GUJ8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PNMA8CA0A1B0GUJ8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PNMA8CA0A1B0GUJ8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PNMA8CA0A1B0GUJ8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PNMA8CA0A1B0GUJ8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PNMA8CA0A1B0GUJ8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PNMA8CA0A1B0GUJ8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PNMA8CA0A1B0GUJ8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PNMA8CA0A1B0GUJ8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PNMA8CA0A1B0GUJ8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PNMA8CA0A1B0GUJ8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PNMA8CA0A1B0GUJ8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PNMA8CA0A1B0GUJ8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PNMA8CA0A1B0GUJ8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms