Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RRA0

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 63 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RRA0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A0A0U1RRA0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A0A0U1RRA0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
A0A0U1RRA0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
A0A0U1RRA0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
A0A0U1RRA0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
A0A0U1RRA0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
A0A0U1RRA0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
A0A0U1RRA0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
A0A0U1RRA0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
A0A0U1RRA0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
A0A0U1RRA0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
A0A0U1RRA0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
A0A0U1RRA0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
A0A0U1RRA0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
A0A0U1RRA0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
A0A0U1RRA0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
A0A0U1RRA0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
A0A0U1RRA0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
A0A0U1RRA0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
A0A0U1RRA0 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
A0A0U1RRA0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
A0A0U1RRA0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
A0A0U1RRA0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
A0A0U1RRA0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
A0A0U1RRA0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
A0A0U1RRA0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
A0A0U1RRA0 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
A0A0U1RRA0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
A0A0U1RRA0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
A0A0U1RRA0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
A0A0U1RRA0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
A0A0U1RRA0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
A0A0U1RRA0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
A0A0U1RRA0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
A0A0U1RRA0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
A0A0U1RRA0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
A0A0U1RRA0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
A0A0U1RRA0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
A0A0U1RRA0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
A0A0U1RRA0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
A0A0U1RRA0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
A0A0U1RRA0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
A0A0U1RRA0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
A0A0U1RRA0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
A0A0U1RRA0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
A0A0U1RRA0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
A0A0U1RRA0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
A0A0U1RRA0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
A0A0U1RRA0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
A0A0U1RRA0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
A0A0U1RRA0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
A0A0U1RRA0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
A0A0U1RRA0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
A0A0U1RRA0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
A0A0U1RRA0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
A0A0U1RRA0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
A0A0U1RRA0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
A0A0U1RRA0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
A0A0U1RRA0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
A0A0U1RRA0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
A0A0U1RRA0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
A0A0U1RRA0 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
A0A0U1RRA0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
A0A0U1RRA0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
A0A0U1RRA0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
A0A0U1RRA0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
A0A0U1RRA0 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
A0A0U1RRA0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
A0A0U1RRA0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
A0A0U1RRA0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
A0A0U1RRA0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
A0A0U1RRA0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
A0A0U1RRA0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
A0A0U1RRA0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
A0A0U1RRA0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
A0A0U1RRA0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
A0A0U1RRA0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
A0A0U1RRA0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
A0A0U1RRA0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
A0A0U1RRA0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
A0A0U1RRA0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
A0A0U1RRA0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
A0A0U1RRA0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
A0A0U1RRA0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
A0A0U1RRA0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
A0A0U1RRA0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
A0A0U1RRA0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
A0A0U1RRA0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
A0A0U1RRA0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
A0A0U1RRA0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
A0A0U1RRA0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
A0A0U1RRA0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
A0A0U1RRA0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
A0A0U1RRA0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
A0A0U1RRA0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
A0A0U1RRA0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
A0A0U1RRA0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
A0A0U1RRA0 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
A0A0U1RRA0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms