Protein–RNA interactions for Protein: O60832

DKC1, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKC1O60832 MAGED2-202ENST00000347546 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.461e-323■■■■■ 30.9
DKC1O60832 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC4.09□□□□□ -1.751e-323■■■■■ 30.9
DKC1O60832 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.177e-9■■■■■ 30.8
DKC1O60832 ELL-202ENST00000594635 4074 ntTSL 1 (best)15.13■□□□□ 0.017e-9■■■■■ 30.8
DKC1O60832 TRAPPC9-214ENST00000523777 705 ntTSL 318.23■□□□□ 0.515e-7■■■■■ 30.8
DKC1O60832 BMF-204ENST00000557870 505 ntTSL 319.82■□□□□ 0.763e-8■■■■■ 30.8
DKC1O60832 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.763e-8■■■■■ 30.8
DKC1O60832 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.42e-18■■■■■ 30.8
DKC1O60832 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.355e-15■■■■■ 30.8
DKC1O60832 BMF-208ENST00000560430 490 ntTSL 315.85■□□□□ 0.133e-8■■■■■ 30.8
DKC1O60832 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.023e-8■■■■■ 30.8
DKC1O60832 BMF-206ENST00000558774 671 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.073e-8■■■■■ 30.8
DKC1O60832 WDR27-202ENST00000441385 683 ntTSL 313.7□□□□□ -0.227e-8■■■■■ 30.7
DKC1O60832 RNF213-201ENST00000319921 5316 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.193e-6■■■■■ 30.6
DKC1O60832 RNF213-220ENST00000582970 21055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.163e-6■■■■■ 30.6
DKC1O60832 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.423e-6■■■■■ 30.6
DKC1O60832 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.726e-10■■■■■ 30.6
DKC1O60832 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.56e-10■■■■■ 30.6
DKC1O60832 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.486e-10■■■■■ 30.6
DKC1O60832 CLPTM1L-214ENST00000513250 567 ntTSL 316.08■□□□□ 0.166e-10■■■■■ 30.6
DKC1O60832 CLPTM1L-203ENST00000503151 627 ntTSL 314.86□□□□□ -0.036e-10■■■■■ 30.6
DKC1O60832 CLPTM1L-210ENST00000508765 631 ntTSL 314.36□□□□□ -0.116e-10■■■■■ 30.6
DKC1O60832 CLPTM1L-202ENST00000503042 3540 ntTSL 212.06□□□□□ -0.486e-10■■■■■ 30.6
DKC1O60832 GAK-221ENST00000515868 3903 ntTSL 212.75□□□□□ -0.371e-6■■■■■ 30.5
DKC1O60832 GCNT2-215ENST00000489819 409 ntTSL 1 (best)16.18■□□□□ 0.182e-7■■■■■ 30.5
DKC1O60832 GCNT2-205ENST00000410107 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.422e-7■■■■■ 30.5
DKC1O60832 GCNT2-214ENST00000489225 932 ntTSL 1 (best)11.29□□□□□ -0.62e-7■■■■■ 30.5
DKC1O60832 GCNT2-212ENST00000485764 608 ntTSL 59.86□□□□□ -0.832e-7■■■■■ 30.5
DKC1O60832 GCNT2-216ENST00000495262 2214 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.012e-7■■■■■ 30.5
DKC1O60832 GCNT2-202ENST00000316170 4381 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.012e-7■■■■■ 30.5
DKC1O60832 GCNT2-206ENST00000459872 779 ntTSL 38.17□□□□□ -1.12e-7■■■■■ 30.5
DKC1O60832 GCNT2-207ENST00000461400 320 ntTSL 37.87□□□□□ -1.152e-7■■■■■ 30.5
DKC1O60832 GCNT2-203ENST00000379597 4525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.262e-7■■■■■ 30.5
DKC1O60832 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.312e-7■■■■■ 30.5
DKC1O60832 GCNT2-204ENST00000397423 3528 ntTSL 1 (best)6.57□□□□□ -1.362e-7■■■■■ 30.5
DKC1O60832 GCNT2-210ENST00000475577 547 ntTSL 44.74□□□□□ -1.652e-7■■■■■ 30.5
DKC1O60832 GCNT2-208ENST00000474518 580 ntTSL 44.61□□□□□ -1.672e-7■■■■■ 30.5
DKC1O60832 TRAPPC9-215ENST00000524162 591 ntTSL 423.52■■□□□ 1.366e-7■■■■■ 30.5
DKC1O60832 TRAPPC9-213ENST00000522504 665 ntTSL 317.02■□□□□ 0.326e-7■■■■■ 30.5
DKC1O60832 TRAPPC9-206ENST00000519482 551 ntTSL 413.97□□□□□ -0.176e-7■■■■■ 30.5
DKC1O60832 TNS1-216ENST00000480665 758 ntTSL 216.77■□□□□ 0.284e-7■■■■■ 30.5
DKC1O60832 MSI2-216ENST00000582772 398 ntTSL 35.17□□□□□ -1.581e-8■■■■■ 30.4
DKC1O60832 SNORA2C-201ENST00000408564 137 ntBASIC8.46□□□□□ -1.066e-74■■■■■ 30.4
DKC1O60832 TCF3-210ENST00000587235 986 ntTSL 528.31■■■□□ 2.124e-7■■■■■ 30.4
DKC1O60832 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.254e-7■■■■■ 30.4
DKC1O60832 TCF3-208ENST00000586318 631 ntTSL 318.68■□□□□ 0.584e-7■■■■■ 30.4
DKC1O60832 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.474e-7■■■■■ 30.4
DKC1O60832 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.414e-7■■■■■ 30.4
DKC1O60832 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.054e-7■■■■■ 30.4
DKC1O60832 TCF3-220ENST00000611869 4409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.094e-7■■■■■ 30.4
DKC1O60832 TCF3-202ENST00000344749 4289 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.124e-7■■■■■ 30.4
DKC1O60832 SMG1-203ENST00000532700 1259 ntTSL 219.86■□□□□ 0.774e-9■■■■■ 30.3
DKC1O60832 SMG1-205ENST00000561947 2664 ntTSL 510.69□□□□□ -0.74e-9■■■■■ 30.3
DKC1O60832 SMG1-216ENST00000569122 562 ntTSL 59.71□□□□□ -0.864e-9■■■■■ 30.3
DKC1O60832 SMG1-202ENST00000446231 16115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.054e-9■■■■■ 30.3
DKC1O60832 SMG1-210ENST00000565224 2372 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.184e-9■■■■■ 30.3
DKC1O60832 SMG1-201ENST00000330588 1588 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.274e-9■■■■■ 30.3
DKC1O60832 SMG1-211ENST00000565324 12465 ntTSL 1 (best)5.63□□□□□ -1.514e-9■■■■■ 30.3
DKC1O60832 FGFR1-205ENST00000397090 777 ntTSL 224.13■■□□□ 1.455e-19■■■■■ 30.2
DKC1O60832 FGFR1-223ENST00000496296 1898 ntTSL 1 (best)23.3■■□□□ 1.325e-19■■■■■ 30.2
DKC1O60832 FGFR1-217ENST00000470826 2281 ntTSL 1 (best)22.16■■□□□ 1.145e-19■■■■■ 30.2
DKC1O60832 FGFR1-210ENST00000413133 587 ntTSL 417.21■□□□□ 0.355e-19■■■■■ 30.2
DKC1O60832 FGFR1-221ENST00000484370 826 ntTSL 1 (best)15.3■□□□□ 0.045e-19■■■■■ 30.2
DKC1O60832 FGFR1-226ENST00000525001 1155 ntTSL 514.94□□□□□ -0.025e-19■■■■■ 30.2
DKC1O60832 FGFR1-231ENST00000527203 556 ntTSL 312.76□□□□□ -0.375e-19■■■■■ 30.2
DKC1O60832 FGFR1-234ENST00000530568 467 ntTSL 311.31□□□□□ -0.65e-19■■■■■ 30.2
DKC1O60832 FGFR1-229ENST00000526742 657 ntTSL 411.11□□□□□ -0.635e-19■■■■■ 30.2
DKC1O60832 FGFR1-212ENST00000434187 529 ntTSL 411.11□□□□□ -0.635e-19■■■■■ 30.2
DKC1O60832 FGFR1-233ENST00000529552 688 ntTSL 410.26□□□□□ -0.775e-19■■■■■ 30.2
DKC1O60832 FGFR1-240ENST00000533668 571 ntTSL 59.11□□□□□ -0.955e-19■■■■■ 30.2
DKC1O60832 SYNJ2-208ENST00000640338 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.251e-6■■■■■ 30.2
DKC1O60832 SYNJ2-201ENST00000355585 7378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.51e-6■■■■■ 30.2
DKC1O60832 SYNJ2-207ENST00000638626 7332 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.561e-6■■■■■ 30.2
DKC1O60832 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.795e-9■■■■■ 30.2
DKC1O60832 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.775e-9■■■■■ 30.2
DKC1O60832 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.65e-9■■■■■ 30.2
DKC1O60832 PTTG1IP-207ENST00000494690 612 ntTSL 513.83□□□□□ -0.25e-9■■■■■ 30.2
DKC1O60832 RXRA-201ENST00000356384 5770 ntTSL 517.79■□□□□ 0.445e-7■■■■■ 30.1
DKC1O60832 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.154e-6■■■■■ 30.1
DKC1O60832 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.134e-6■■■■■ 30.1
DKC1O60832 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.314e-6■■■■■ 30.1
DKC1O60832 SUMO3-206ENST00000479153 1736 ntTSL 214.66□□□□□ -0.064e-6■■■■■ 30.1
DKC1O60832 SUMO3-202ENST00000397893 520 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.194e-6■■■■■ 30.1
DKC1O60832 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.412e-8■■■■■ 30.1
DKC1O60832 MACROD1-208ENST00000545464 899 ntTSL 327.39■■□□□ 1.982e-8■■■■■ 30.1
DKC1O60832 MACROD1-206ENST00000542359 459 ntTSL 317.43■□□□□ 0.382e-8■■■■■ 30.1
DKC1O60832 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.31e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 RAP1GAP-203ENST00000374757 1328 ntTSL 527.31■■□□□ 1.961e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 IFITM10-203ENST00000482459 1563 ntTSL 1 (best)26.9■■□□□ 1.91e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 MYCBP2-209ENST00000491491 649 ntTSL 526.54■■□□□ 1.842e-12■■■■■ 30
DKC1O60832 TBC1D5-223ENST00000471679 435 ntTSL 426.13■■□□□ 1.771e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 ARMC6-211ENST00000538663 552 ntTSL 426.12■■□□□ 1.771e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.761e-8■■■■■ 30
DKC1O60832 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.681e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 MTMR3-212ENST00000495098 461 ntTSL 424.4■■□□□ 1.51e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 TBC1D5-227ENST00000485432 566 ntTSL 423.38■■□□□ 1.331e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.281e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.271e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 GMDS-AS1-203ENST00000524770 565 ntTSL 322.46■■□□□ 1.191e-6■■■■■ 30
DKC1O60832 GMDS-AS1-209ENST00000532124 629 ntTSL 422.46■■□□□ 1.191e-6■■■■■ 30
Retrieved 100 of 8,567 protein–RNA pairs in 91.1 ms