RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545464.5

MACROD1-208, Transcript of MACRO domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene MACROD1, Length 899 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MACROD1-208ENST00000545464 NISCHQ9Y2I1 1504 aa61.78■■■■■ 7.48
MACROD1-208ENST00000545464 ABCC9O60706 1549 aa56.13■■■■■ 6.58
MACROD1-208ENST00000545464 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa55.5■■■■■ 6.48
MACROD1-208ENST00000545464 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa53.13■■■■■ 6.1
MACROD1-208ENST00000545464 DNAJC5BQ9UF47 199 aa53.02■■■■■ 6.08
MACROD1-208ENST00000545464 DCAF8L2P0C7V8 631 aa52.66■■■■■ 6.02
MACROD1-208ENST00000545464 NACADO15069 1562 aa52.64■■■■■ 6.02
MACROD1-208ENST00000545464 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP52.29■■■■■ 5.96
MACROD1-208ENST00000545464 UNC13AQ9UPW8 1703 aa51.86■■■■■ 5.89
MACROD1-208ENST00000545464 MYO15BQ96JP2 1530 aa51.69■■■■■ 5.86
MACROD1-208ENST00000545464 BICRAQ9NZM4 1560 aa51.56■■■■■ 5.84
MACROD1-208ENST00000545464 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP51.08■■■■■ 5.77
MACROD1-208ENST00000545464 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.9■■■■■ 5.74
MACROD1-208ENST00000545464 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa50.74■■■■■ 5.71
MACROD1-208ENST00000545464 SCRIBQ14160 1630 aa50.73■■■■■ 5.71
MACROD1-208ENST00000545464 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa50.59■■■■■ 5.69
MACROD1-208ENST00000545464 CECR2Q9BXF3 1484 aa50.56■■■■■ 5.68
MACROD1-208ENST00000545464 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP50.37■■■■■ 5.65
MACROD1-208ENST00000545464 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa48.95■■■■■ 5.43
MACROD1-208ENST00000545464 NCAPD3P42695 1498 aa48.61■■■■■ 5.37
MACROD1-208ENST00000545464 ERCC6Q03468 1493 aa48.51■■■■■ 5.36
MACROD1-208ENST00000545464 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa48.45■■■■■ 5.35
MACROD1-208ENST00000545464 CUX2O14529 1486 aa48.42■■■■■ 5.34
MACROD1-208ENST00000545464 SMARCA2P51531 1590 aa48.26■■■■■ 5.32
MACROD1-208ENST00000545464 SMARCA4P51532 1647 aa48.26■■■■■ 5.32
MACROD1-208ENST00000545464 HMGXB3Q12766 1538 aa48.17■■■■■ 5.3
MACROD1-208ENST00000545464 NESP48681 1621 aa48.08■■■■■ 5.29
MACROD1-208ENST00000545464 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP48■■■■■ 5.27
MACROD1-208ENST00000545464 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP47.98■■■■■ 5.27
MACROD1-208ENST00000545464 PEG3Q9GZU2 1588 aa47.71■■■■■ 5.23
MACROD1-208ENST00000545464 MROH2BQ7Z745 1585 aa47.64■■■■■ 5.22
MACROD1-208ENST00000545464 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa47.57■■■■■ 5.21
MACROD1-208ENST00000545464 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP47.54■■■■■ 5.2
MACROD1-208ENST00000545464 PDS5BQ9NTI5 1447 aa47.4■■■■■ 5.18
MACROD1-208ENST00000545464 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa47.36■■■■■ 5.17
MACROD1-208ENST00000545464 CADPSQ9ULU8 1353 aa47.18■■■■■ 5.14
MACROD1-208ENST00000545464 WIZO95785 1651 aa47.05■■■■■ 5.12
MACROD1-208ENST00000545464 MRC2Q9UBG0 1479 aa46.99■■■■■ 5.11
MACROD1-208ENST00000545464 TRIM41Q8WV44 630 aa46.82■■■■■ 5.09
MACROD1-208ENST00000545464 WDR62O43379 1518 aa46.82■■■■■ 5.09
MACROD1-208ENST00000545464 CEP164Q9UPV0 1460 aa46.75■■■■■ 5.07
MACROD1-208ENST00000545464 FANCD2Q9BXW9 1451 aa46.66■■■■■ 5.06
MACROD1-208ENST00000545464 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP46.52■■■■■ 5.04
MACROD1-208ENST00000545464 CFTRP13569 1480 aa46.51■■■■■ 5.04
MACROD1-208ENST00000545464 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP46.38■■■■■ 5.02
MACROD1-208ENST00000545464 OSCARQ8IYS5 282 aa46.29■■■■■ 5
MACROD1-208ENST00000545464 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP46.28■■■■■ 5
MACROD1-208ENST00000545464 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.93■■■■■ 4.94
MACROD1-208ENST00000545464 PRDM2Q13029 1718 aa45.91■■■■■ 4.94
MACROD1-208ENST00000545464 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP45.81■■■■■ 4.92
MACROD1-208ENST00000545464 IFT140Q96RY7 1462 aa45.8■■■■■ 4.92
MACROD1-208ENST00000545464 TOPBP1Q92547 1522 aa45.71■■■■■ 4.91
MACROD1-208ENST00000545464 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa45.63■■■■■ 4.89
MACROD1-208ENST00000545464 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa45.63■■■■■ 4.89
MACROD1-208ENST00000545464 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa45.63■■■■■ 4.89
MACROD1-208ENST00000545464 ABCC8Q09428 1581 aa45.55■■■■■ 4.88
MACROD1-208ENST00000545464 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP45.47■■■■■ 4.87
MACROD1-208ENST00000545464 DNMBPQ6XZF7 1577 aa45.47■■■■■ 4.87
MACROD1-208ENST00000545464 ARHGEF11O15085 1522 aa45.45■■■■■ 4.87
MACROD1-208ENST00000545464 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP45.38■■■■■ 4.86
MACROD1-208ENST00000545464 FBLN2P98095 1184 aa45.32■■■■■ 4.85
MACROD1-208ENST00000545464 CYB5RLQ6IPT4 315 aa45.3■■■■■ 4.84
MACROD1-208ENST00000545464 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP45.27■■■■■ 4.84
MACROD1-208ENST00000545464 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP45.21■■■■■ 4.83
MACROD1-208ENST00000545464 CHD1O14646 1710 aa45.21■■■■■ 4.83
MACROD1-208ENST00000545464 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa45.12■■■■■ 4.81
MACROD1-208ENST00000545464 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP45.07■■■■■ 4.81
MACROD1-208ENST00000545464 SOGA1O94964 1423 aa45.07■■■■■ 4.81
MACROD1-208ENST00000545464 TRHP20396 242 aaPredicted RBP44.99■■■■■ 4.79
MACROD1-208ENST00000545464 ARAP1Q96P48 1450 aa44.98■■■■■ 4.79
MACROD1-208ENST00000545464 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.9■■■■■ 4.78
MACROD1-208ENST00000545464 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa44.87■■■■■ 4.77
MACROD1-208ENST00000545464 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP44.84■■■■■ 4.77
MACROD1-208ENST00000545464 CUX1P39880 1505 aa44.78■■■■■ 4.76
MACROD1-208ENST00000545464 WDR97A6NE52 1622 aa44.72■■■■■ 4.75
MACROD1-208ENST00000545464 GRIN2BQ13224 1484 aa44.67■■■■■ 4.74
MACROD1-208ENST00000545464 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP44.67■■■■■ 4.74
MACROD1-208ENST00000545464 CLASP1Q7Z460 1538 aa44.65■■■■■ 4.74
MACROD1-208ENST00000545464 SYNJ1O43426 1573 aa44.64■■■■■ 4.74
MACROD1-208ENST00000545464 SYNJ2O15056 1496 aa44.56■■■■■ 4.72
MACROD1-208ENST00000545464 GAPVD1Q14C86 1478 aa44.48■■■■■ 4.71
MACROD1-208ENST00000545464 PBRM1Q86U86 1689 aa44.41■■■■■ 4.7
MACROD1-208ENST00000545464 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.39■■■■■ 4.7
MACROD1-208ENST00000545464 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa44.31■■■■■ 4.68
MACROD1-208ENST00000545464 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa44.24■■■■■ 4.67
MACROD1-208ENST00000545464 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP44.13■■■■■ 4.653e-6■■■■■ 50.1
MACROD1-208ENST00000545464 GRIN2AQ12879 1464 aa44.08■■■■■ 4.65
MACROD1-208ENST00000545464 ERCC6L2Q5T890 1561 aa44.01■■■■■ 4.64
MACROD1-208ENST00000545464 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP43.98■■■■■ 4.63
MACROD1-208ENST00000545464 ADAMTS12P58397 1594 aa43.97■■■■■ 4.63
MACROD1-208ENST00000545464 CEP170Q5SW79 1584 aa43.93■■■■■ 4.62
MACROD1-208ENST00000545464 NUP160Q12769 1436 aa43.91■■■■■ 4.62
MACROD1-208ENST00000545464 TOP2BQ02880 1626 aa43.9■■■■■ 4.62
MACROD1-208ENST00000545464 FHAD1B1AJZ9 1412 aa43.89■■■■■ 4.62
MACROD1-208ENST00000545464 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.88■■■■■ 4.61
MACROD1-208ENST00000545464 ERICH3Q5RHP9 1530 aa43.73■■■■■ 4.59
MACROD1-208ENST00000545464 SHROOM2Q13796 1616 aa43.71■■■■■ 4.59
MACROD1-208ENST00000545464 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP43.63■■■■■ 4.57
MACROD1-208ENST00000545464 JPH4Q96JJ6 628 aa43.6■■■■■ 4.57
MACROD1-208ENST00000545464 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP43.37■■■■■ 4.53
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