RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524770.5

GMDS-AS1-203, humanhuman

TSL 3

Gene GMDS-AS1, Length 565 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-203ENST00000524770 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.74■■■■■ 5.39
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GMDS-AS1-203ENST00000524770 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.72■■■■■ 4.11
GMDS-AS1-203ENST00000524770 NACADO15069 1562 aa40.69■■■■■ 4.11
GMDS-AS1-203ENST00000524770 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.68■■■■■ 4.1
GMDS-AS1-203ENST00000524770 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.51■■■■■ 4.08
GMDS-AS1-203ENST00000524770 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.42■■■■■ 4.06
GMDS-AS1-203ENST00000524770 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.38■■■■■ 4.06
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GMDS-AS1-203ENST00000524770 SCRIBQ14160 1630 aa39.55■■■■□ 3.92
GMDS-AS1-203ENST00000524770 BICRAQ9NZM4 1560 aa39.53■■■■□ 3.92
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GMDS-AS1-203ENST00000524770 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.26■■■■□ 3.71
GMDS-AS1-203ENST00000524770 CECR2Q9BXF3 1484 aa37.93■■■■□ 3.66
GMDS-AS1-203ENST00000524770 SMARCA4P51532 1647 aa37.87■■■■□ 3.65
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GMDS-AS1-203ENST00000524770 SMARCA2P51531 1590 aa37.55■■■■□ 3.6
GMDS-AS1-203ENST00000524770 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.54■■■■□ 3.6
GMDS-AS1-203ENST00000524770 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.5■■■■□ 3.59
GMDS-AS1-203ENST00000524770 NCAPD3P42695 1498 aa37.49■■■■□ 3.59
GMDS-AS1-203ENST00000524770 HMGXB3Q12766 1538 aa37.42■■■■□ 3.58
GMDS-AS1-203ENST00000524770 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.26■■■■□ 3.55
GMDS-AS1-203ENST00000524770 WIZO95785 1651 aa37.21■■■■□ 3.55
GMDS-AS1-203ENST00000524770 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.13■■■■□ 3.53
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GMDS-AS1-203ENST00000524770 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.57■■■■□ 3.44
GMDS-AS1-203ENST00000524770 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.37■■■■□ 3.41
GMDS-AS1-203ENST00000524770 ERCC6Q03468 1493 aa36.37■■■■□ 3.41
GMDS-AS1-203ENST00000524770 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.31■■■■□ 3.4
GMDS-AS1-203ENST00000524770 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.28■■■■□ 3.4
GMDS-AS1-203ENST00000524770 CFTRP13569 1480 aa36.23■■■■□ 3.39
GMDS-AS1-203ENST00000524770 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.2■■■■□ 3.39
GMDS-AS1-203ENST00000524770 PRDM2Q13029 1718 aa36.19■■■■□ 3.38
GMDS-AS1-203ENST00000524770 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.13■■■■□ 3.37
GMDS-AS1-203ENST00000524770 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.12■■■■□ 3.37
GMDS-AS1-203ENST00000524770 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36■■■■□ 3.35
GMDS-AS1-203ENST00000524770 CUX2O14529 1486 aa35.99■■■■□ 3.35
GMDS-AS1-203ENST00000524770 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.98■■■■□ 3.35
GMDS-AS1-203ENST00000524770 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.9■■■■□ 3.34
GMDS-AS1-203ENST00000524770 WDR62O43379 1518 aa35.83■■■■□ 3.33
GMDS-AS1-203ENST00000524770 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.67■■■■□ 3.3
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GMDS-AS1-203ENST00000524770 TOPBP1Q92547 1522 aa35.47■■■■□ 3.27
GMDS-AS1-203ENST00000524770 ABCC8Q09428 1581 aa35.43■■■■□ 3.26
GMDS-AS1-203ENST00000524770 CUX1P39880 1505 aa35.27■■■■□ 3.24
GMDS-AS1-203ENST00000524770 IFT140Q96RY7 1462 aa35.19■■■■□ 3.22
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GMDS-AS1-203ENST00000524770 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.06■■■■□ 3.2
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GMDS-AS1-203ENST00000524770 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.01■■■■□ 3.2
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GMDS-AS1-203ENST00000524770 WDR97A6NE52 1622 aa34.96■■■■□ 3.19
GMDS-AS1-203ENST00000524770 SOGA1O94964 1423 aa34.94■■■■□ 3.18
GMDS-AS1-203ENST00000524770 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.78■■■■□ 3.16
GMDS-AS1-203ENST00000524770 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.77■■■■□ 3.16
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GMDS-AS1-203ENST00000524770 PBRM1Q86U86 1689 aa34.67■■■■□ 3.14
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GMDS-AS1-203ENST00000524770 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.59■■■■□ 3.13
GMDS-AS1-203ENST00000524770 GRIN2BQ13224 1484 aa34.58■■■■□ 3.13
GMDS-AS1-203ENST00000524770 CHD1O14646 1710 aa34.57■■■■□ 3.12
GMDS-AS1-203ENST00000524770 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.54■■■■□ 3.12
GMDS-AS1-203ENST00000524770 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.52■■■■□ 3.12
GMDS-AS1-203ENST00000524770 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.37■■■■□ 3.09
GMDS-AS1-203ENST00000524770 ADAMTS12P58397 1594 aa34.36■■■■□ 3.09
GMDS-AS1-203ENST00000524770 SYNJ2O15056 1496 aa34.35■■■■□ 3.09
GMDS-AS1-203ENST00000524770 OSCARQ8IYS5 282 aa34.35■■■■□ 3.09
GMDS-AS1-203ENST00000524770 KIF27Q86VH2 1401 aa34.26■■■■□ 3.07
GMDS-AS1-203ENST00000524770 FBLN2P98095 1184 aa34.24■■■■□ 3.07
GMDS-AS1-203ENST00000524770 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.19■■■■□ 3.06
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GMDS-AS1-203ENST00000524770 CUL7Q14999 1698 aa34.14■■■■□ 3.06
GMDS-AS1-203ENST00000524770 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.14■■■■□ 3.06
GMDS-AS1-203ENST00000524770 TRIM41Q8WV44 630 aa34.12■■■■□ 3.05
GMDS-AS1-203ENST00000524770 IGF1RP08069 1367 aa34.06■■■■□ 3.04
GMDS-AS1-203ENST00000524770 CEP170Q5SW79 1584 aa34.03■■■■□ 3.04
GMDS-AS1-203ENST00000524770 NUP160Q12769 1436 aa34■■■■□ 3.03
GMDS-AS1-203ENST00000524770 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa34■■■■□ 3.03
GMDS-AS1-203ENST00000524770 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa34■■■■□ 3.03
GMDS-AS1-203ENST00000524770 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa34■■■■□ 3.03
GMDS-AS1-203ENST00000524770 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.99■■■■□ 3.03
GMDS-AS1-203ENST00000524770 ARHGEF11O15085 1522 aa33.97■■■■□ 3.03
GMDS-AS1-203ENST00000524770 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa33.86■■■■□ 3.01
GMDS-AS1-203ENST00000524770 SHROOM2Q13796 1616 aa33.82■■■■□ 3.01
GMDS-AS1-203ENST00000524770 CHIC1Q5VXU3 224 aa33.81■■■■□ 3
GMDS-AS1-203ENST00000524770 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa33.73■■■□□ 2.99
GMDS-AS1-203ENST00000524770 ARAP1Q96P48 1450 aa33.7■■■□□ 2.99
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