RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495098.5

MTMR3-212, Transcript of myotubularin related protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene MTMR3, Length 461 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3-212ENST00000495098 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.93■■■■■ 6.22
MTMR3-212ENST00000495098 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa48.28■■■■■ 5.32
MTMR3-212ENST00000495098 ABCC9O60706 1549 aa48.17■■■■■ 5.3
MTMR3-212ENST00000495098 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.87■■■■■ 4.93
MTMR3-212ENST00000495098 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.66■■■■■ 4.9
MTMR3-212ENST00000495098 NACADO15069 1562 aa45.58■■■■■ 4.89
MTMR3-212ENST00000495098 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.94■■■■■ 4.78
MTMR3-212ENST00000495098 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.94■■■■■ 4.78
MTMR3-212ENST00000495098 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.93■■■■■ 4.78
MTMR3-212ENST00000495098 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.91■■■■■ 4.78
MTMR3-212ENST00000495098 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.72■■■■■ 4.75
MTMR3-212ENST00000495098 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.52■■■■■ 4.72
MTMR3-212ENST00000495098 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa44.46■■■■■ 4.71
MTMR3-212ENST00000495098 SCRIBQ14160 1630 aa44.14■■■■■ 4.66
MTMR3-212ENST00000495098 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.8■■■■■ 4.6
MTMR3-212ENST00000495098 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.49■■■■■ 4.55
MTMR3-212ENST00000495098 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.41■■■■■ 4.54
MTMR3-212ENST00000495098 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.32■■■■■ 4.52
MTMR3-212ENST00000495098 SMARCA4P51532 1647 aa42.06■■■■■ 4.32
MTMR3-212ENST00000495098 NCAPD3P42695 1498 aa42.04■■■■■ 4.32
MTMR3-212ENST00000495098 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42■■■■■ 4.31
MTMR3-212ENST00000495098 SMARCA2P51531 1590 aa41.9■■■■■ 4.3
MTMR3-212ENST00000495098 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.84■■■■■ 4.29
MTMR3-212ENST00000495098 HMGXB3Q12766 1538 aa41.77■■■■■ 4.28
MTMR3-212ENST00000495098 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.65■■■■■ 4.26
MTMR3-212ENST00000495098 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.61■■■■■ 4.25
MTMR3-212ENST00000495098 ERCC6Q03468 1493 aa41.57■■■■■ 4.25
MTMR3-212ENST00000495098 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.54■■■■■ 4.24
MTMR3-212ENST00000495098 NESP48681 1621 aa41.44■■■■■ 4.22
MTMR3-212ENST00000495098 CUX2O14529 1486 aa41.29■■■■■ 4.2
MTMR3-212ENST00000495098 WIZO95785 1651 aa41.18■■■■■ 4.18
MTMR3-212ENST00000495098 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.11■■■■■ 4.17
MTMR3-212ENST00000495098 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.04■■■■■ 4.16
MTMR3-212ENST00000495098 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.94■■■■■ 4.15
MTMR3-212ENST00000495098 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.91■■■■■ 4.14
MTMR3-212ENST00000495098 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.87■■■■■ 4.13
MTMR3-212ENST00000495098 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.83■■■■■ 4.13
MTMR3-212ENST00000495098 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.8■■■■■ 4.12
MTMR3-212ENST00000495098 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.58■■■■■ 4.09
MTMR3-212ENST00000495098 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.51■■■■■ 4.08
MTMR3-212ENST00000495098 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.43■■■■■ 4.06
MTMR3-212ENST00000495098 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.4■■■■■ 4.06
MTMR3-212ENST00000495098 CFTRP13569 1480 aa40.39■■■■■ 4.06
MTMR3-212ENST00000495098 WDR62O43379 1518 aa40.37■■■■■ 4.05
MTMR3-212ENST00000495098 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.16■■■■■ 4.02
MTMR3-212ENST00000495098 PRDM2Q13029 1718 aa40.11■■■■■ 4.01
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MTMR3-212ENST00000495098 TOPBP1Q92547 1522 aa39.66■■■■□ 3.94
MTMR3-212ENST00000495098 IFT140Q96RY7 1462 aa39.57■■■■□ 3.93
MTMR3-212ENST00000495098 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.55■■■■□ 3.92
MTMR3-212ENST00000495098 OSCARQ8IYS5 282 aa39.53■■■■□ 3.92
MTMR3-212ENST00000495098 ABCC8Q09428 1581 aa39.53■■■■□ 3.92
MTMR3-212ENST00000495098 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.53■■■■□ 3.92
MTMR3-212ENST00000495098 TRIM41Q8WV44 630 aa39.52■■■■□ 3.92
MTMR3-212ENST00000495098 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.37■■■■□ 3.89
MTMR3-212ENST00000495098 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.33■■■■□ 3.89
MTMR3-212ENST00000495098 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.27■■■■□ 3.88
MTMR3-212ENST00000495098 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.26■■■■□ 3.88
MTMR3-212ENST00000495098 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.23■■■■□ 3.87
MTMR3-212ENST00000495098 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.17■■■■□ 3.86
MTMR3-212ENST00000495098 SOGA1O94964 1423 aa39.12■■■■□ 3.85
MTMR3-212ENST00000495098 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.08■■■■□ 3.85
MTMR3-212ENST00000495098 CUX1P39880 1505 aa39.08■■■■□ 3.85
MTMR3-212ENST00000495098 CHD1O14646 1710 aa39.06■■■■□ 3.84
MTMR3-212ENST00000495098 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.04■■■■□ 3.84
MTMR3-212ENST00000495098 FBLN2P98095 1184 aa39.03■■■■□ 3.84
MTMR3-212ENST00000495098 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.01■■■■□ 3.84
MTMR3-212ENST00000495098 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.01■■■■□ 3.84
MTMR3-212ENST00000495098 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.01■■■■□ 3.84
MTMR3-212ENST00000495098 ARHGEF11O15085 1522 aa38.88■■■■□ 3.81
MTMR3-212ENST00000495098 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.82■■■■□ 3.81
MTMR3-212ENST00000495098 WDR97A6NE52 1622 aa38.81■■■■□ 3.8
MTMR3-212ENST00000495098 GRIN2BQ13224 1484 aa38.72■■■■□ 3.79
MTMR3-212ENST00000495098 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.7■■■■□ 3.79
MTMR3-212ENST00000495098 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.66■■■■□ 3.78
MTMR3-212ENST00000495098 PBRM1Q86U86 1689 aa38.66■■■■□ 3.78
MTMR3-212ENST00000495098 CYB5RLQ6IPT4 315 aa38.66■■■■□ 3.78
MTMR3-212ENST00000495098 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.64■■■■□ 3.78
MTMR3-212ENST00000495098 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.59■■■■□ 3.77
MTMR3-212ENST00000495098 SYNJ2O15056 1496 aa38.55■■■■□ 3.76
MTMR3-212ENST00000495098 SYNJ1O43426 1573 aa38.54■■■■□ 3.76
MTMR3-212ENST00000495098 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.53■■■■□ 3.76
MTMR3-212ENST00000495098 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.52■■■■□ 3.769e-6■■■■■ 50.1
MTMR3-212ENST00000495098 ARAP1Q96P48 1450 aa38.51■■■■□ 3.76
MTMR3-212ENST00000495098 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.5■■■■□ 3.75
MTMR3-212ENST00000495098 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.5■■■■□ 3.75
MTMR3-212ENST00000495098 TOP2BQ02880 1626 aa38.49■■■■□ 3.75
MTMR3-212ENST00000495098 ADAMTS12P58397 1594 aa38.24■■■■□ 3.71
MTMR3-212ENST00000495098 GRIN2AQ12879 1464 aa38.22■■■■□ 3.71
MTMR3-212ENST00000495098 TRHP20396 242 aaPredicted RBP38.21■■■■□ 3.71
MTMR3-212ENST00000495098 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.12■■■■□ 3.69
MTMR3-212ENST00000495098 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.11■■■■□ 3.69
MTMR3-212ENST00000495098 CEP170Q5SW79 1584 aa38.1■■■■□ 3.69
MTMR3-212ENST00000495098 NUP160Q12769 1436 aa38.04■■■■□ 3.68
MTMR3-212ENST00000495098 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38■■■■□ 3.67
MTMR3-212ENST00000495098 SHROOM2Q13796 1616 aa37.87■■■■□ 3.65
MTMR3-212ENST00000495098 KIF27Q86VH2 1401 aa37.76■■■■□ 3.63
MTMR3-212ENST00000495098 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP37.74■■■■□ 3.63
MTMR3-212ENST00000495098 JPH4Q96JJ6 628 aa37.74■■■■□ 3.63
MTMR3-212ENST00000495098 IGF1RP08069 1367 aa37.7■■■■□ 3.63
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