RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479153.1

SUMO3-206, Transcript of small ubiquitin-like modifier 3, humanhuman

TSL 2

Gene SUMO3, Length 1,736 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3-206ENST00000479153 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.07■■■□□ 2.56
SUMO3-206ENST00000479153 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.43■■□□□ 1.98
SUMO3-206ENST00000479153 ABCC9O60706 1549 aa26.53■■□□□ 1.84
SUMO3-206ENST00000479153 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
SUMO3-206ENST00000479153 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.92■■□□□ 1.74
SUMO3-206ENST00000479153 NACADO15069 1562 aa25.67■■□□□ 1.7
SUMO3-206ENST00000479153 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.65■■□□□ 1.7
SUMO3-206ENST00000479153 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.63■■□□□ 1.69
SUMO3-206ENST00000479153 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.58■■□□□ 1.69
SUMO3-206ENST00000479153 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.17■■□□□ 1.62
SUMO3-206ENST00000479153 SCRIBQ14160 1630 aa25.16■■□□□ 1.62
SUMO3-206ENST00000479153 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.94■■□□□ 1.58
SUMO3-206ENST00000479153 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.88■■□□□ 1.57
SUMO3-206ENST00000479153 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.87■■□□□ 1.57
SUMO3-206ENST00000479153 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.21■■□□□ 1.47
SUMO3-206ENST00000479153 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
SUMO3-206ENST00000479153 SMARCA4P51532 1647 aa24.05■■□□□ 1.44
SUMO3-206ENST00000479153 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
SUMO3-206ENST00000479153 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24■■□□□ 1.43
SUMO3-206ENST00000479153 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.99■■□□□ 1.43
SUMO3-206ENST00000479153 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.98■■□□□ 1.43
SUMO3-206ENST00000479153 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
SUMO3-206ENST00000479153 WIZO95785 1651 aa23.8■■□□□ 1.4
SUMO3-206ENST00000479153 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.79■■□□□ 1.4
SUMO3-206ENST00000479153 SMARCA2P51531 1590 aa23.76■■□□□ 1.39
SUMO3-206ENST00000479153 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.74■■□□□ 1.39
SUMO3-206ENST00000479153 NCAPD3P42695 1498 aa23.67■■□□□ 1.38
SUMO3-206ENST00000479153 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
SUMO3-206ENST00000479153 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
SUMO3-206ENST00000479153 HMGXB3Q12766 1538 aa23.61■■□□□ 1.37
SUMO3-206ENST00000479153 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
SUMO3-206ENST00000479153 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.24■■□□□ 1.31
SUMO3-206ENST00000479153 NESP48681 1621 aa23.09■■□□□ 1.29
SUMO3-206ENST00000479153 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.03■■□□□ 1.28
SUMO3-206ENST00000479153 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.01■■□□□ 1.27
SUMO3-206ENST00000479153 CFTRP13569 1480 aa22.98■■□□□ 1.27
SUMO3-206ENST00000479153 PRDM2Q13029 1718 aa22.91■■□□□ 1.26
SUMO3-206ENST00000479153 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.85■■□□□ 1.25
SUMO3-206ENST00000479153 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.83■■□□□ 1.25
SUMO3-206ENST00000479153 ERCC6Q03468 1493 aa22.81■■□□□ 1.24
SUMO3-206ENST00000479153 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.8■■□□□ 1.24
SUMO3-206ENST00000479153 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.72■■□□□ 1.23
SUMO3-206ENST00000479153 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
SUMO3-206ENST00000479153 ABCC8Q09428 1581 aa22.59■■□□□ 1.21
SUMO3-206ENST00000479153 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.59■■□□□ 1.21
SUMO3-206ENST00000479153 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
SUMO3-206ENST00000479153 WDR62O43379 1518 aa22.49■■□□□ 1.19
SUMO3-206ENST00000479153 CUX1P39880 1505 aa22.48■■□□□ 1.19
SUMO3-206ENST00000479153 TOPBP1Q92547 1522 aa22.48■■□□□ 1.19
SUMO3-206ENST00000479153 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.48■■□□□ 1.19
SUMO3-206ENST00000479153 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.47■■□□□ 1.19
SUMO3-206ENST00000479153 SYNJ1O43426 1573 aa22.44■■□□□ 1.18
SUMO3-206ENST00000479153 TOP2BQ02880 1626 aa22.38■■□□□ 1.17
SUMO3-206ENST00000479153 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.38■■□□□ 1.17
SUMO3-206ENST00000479153 CUX2O14529 1486 aa22.34■■□□□ 1.17
SUMO3-206ENST00000479153 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.34■■□□□ 1.17
SUMO3-206ENST00000479153 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
SUMO3-206ENST00000479153 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.26■■□□□ 1.15
SUMO3-206ENST00000479153 TRIM41Q8WV44 630 aa22.26■■□□□ 1.15
SUMO3-206ENST00000479153 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.26■■□□□ 1.15
SUMO3-206ENST00000479153 SOGA1O94964 1423 aa22.23■■□□□ 1.15
SUMO3-206ENST00000479153 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
SUMO3-206ENST00000479153 IFT140Q96RY7 1462 aa22.2■■□□□ 1.14
SUMO3-206ENST00000479153 WDR97A6NE52 1622 aa22.14■■□□□ 1.14
SUMO3-206ENST00000479153 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
SUMO3-206ENST00000479153 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.1■■□□□ 1.13
SUMO3-206ENST00000479153 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SUMO3-206ENST00000479153 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.06■■□□□ 1.123e-7■■■□□ 16.9
SUMO3-206ENST00000479153 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
SUMO3-206ENST00000479153 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22■■□□□ 1.11
SUMO3-206ENST00000479153 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.98■■□□□ 1.11
SUMO3-206ENST00000479153 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.97■■□□□ 1.11
SUMO3-206ENST00000479153 PBRM1Q86U86 1689 aa21.96■■□□□ 1.11
SUMO3-206ENST00000479153 KIF27Q86VH2 1401 aa21.95■■□□□ 1.1
SUMO3-206ENST00000479153 GRIN2BQ13224 1484 aa21.9■■□□□ 1.1
SUMO3-206ENST00000479153 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
SUMO3-206ENST00000479153 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.86■■□□□ 1.09
SUMO3-206ENST00000479153 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.83■■□□□ 1.09
SUMO3-206ENST00000479153 IGF1RP08069 1367 aa21.82■■□□□ 1.08
SUMO3-206ENST00000479153 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
SUMO3-206ENST00000479153 ADAMTS12P58397 1594 aa21.77■■□□□ 1.08
SUMO3-206ENST00000479153 EEA1Q15075 1411 aa21.76■■□□□ 1.07
SUMO3-206ENST00000479153 FBLN2P98095 1184 aa21.75■■□□□ 1.07
SUMO3-206ENST00000479153 CHD1O14646 1710 aa21.75■■□□□ 1.07
SUMO3-206ENST00000479153 CUL7Q14999 1698 aa21.75■■□□□ 1.07
SUMO3-206ENST00000479153 CSRNP3Q8WYN3 585 aa21.74■■□□□ 1.07
SUMO3-206ENST00000479153 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.71■■□□□ 1.07
SUMO3-206ENST00000479153 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
SUMO3-206ENST00000479153 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.71■■□□□ 1.07
SUMO3-206ENST00000479153 SYNJ2O15056 1496 aa21.7■■□□□ 1.06
SUMO3-206ENST00000479153 EHMT2Q96KQ7 1210 aa21.63■■□□□ 1.05
SUMO3-206ENST00000479153 GRIN2AQ12879 1464 aa21.63■■□□□ 1.05
SUMO3-206ENST00000479153 PRXQ9BXM0 1461 aa21.63■■□□□ 1.05
SUMO3-206ENST00000479153 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa21.62■■□□□ 1.05
SUMO3-206ENST00000479153 KIF21BO75037 1637 aa21.56■■□□□ 1.04
SUMO3-206ENST00000479153 CEP170Q5SW79 1584 aa21.54■■□□□ 1.04
SUMO3-206ENST00000479153 OSCARQ8IYS5 282 aa21.53■■□□□ 1.04
SUMO3-206ENST00000479153 NUP160Q12769 1436 aa21.49■■□□□ 1.03
SUMO3-206ENST00000479153 GOLGA3Q08378 1498 aa21.47■■□□□ 1.03
SUMO3-206ENST00000479153 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa21.45■■□□□ 1.02
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