RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538663.5

ARMC6-211, Transcript of armadillo repeat containing 6, humanhuman

TSL 4

Gene ARMC6, Length 552 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARMC6-211ENST00000538663 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.42■■■■■ 6.94
ARMC6-211ENST00000538663 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52.35■■■■■ 5.97
ARMC6-211ENST00000538663 ABCC9O60706 1549 aa52.28■■■■■ 5.96
ARMC6-211ENST00000538663 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.78■■■■■ 5.56
ARMC6-211ENST00000538663 NACADO15069 1562 aa49.46■■■■■ 5.51
ARMC6-211ENST00000538663 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.26■■■■■ 5.48
ARMC6-211ENST00000538663 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.95■■■■■ 5.43
ARMC6-211ENST00000538663 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.81■■■■■ 5.4
ARMC6-211ENST00000538663 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.7■■■■■ 5.39
ARMC6-211ENST00000538663 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.68■■■■■ 5.38
ARMC6-211ENST00000538663 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.44■■■■■ 5.35
ARMC6-211ENST00000538663 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.36■■■■■ 5.33
ARMC6-211ENST00000538663 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.23■■■■■ 5.31
ARMC6-211ENST00000538663 SCRIBQ14160 1630 aa47.75■■■■■ 5.23
ARMC6-211ENST00000538663 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.67■■■■■ 5.22
ARMC6-211ENST00000538663 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.22■■■■■ 5.15
ARMC6-211ENST00000538663 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.15■■■■■ 5.14
ARMC6-211ENST00000538663 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.08■■■■■ 5.13
ARMC6-211ENST00000538663 NCAPD3P42695 1498 aa45.67■■■■■ 4.9
ARMC6-211ENST00000538663 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.56■■■■■ 4.88
ARMC6-211ENST00000538663 SMARCA4P51532 1647 aa45.55■■■■■ 4.88
ARMC6-211ENST00000538663 SMARCA2P51531 1590 aa45.42■■■■■ 4.86
ARMC6-211ENST00000538663 HMGXB3Q12766 1538 aa45.35■■■■■ 4.85
ARMC6-211ENST00000538663 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.33■■■■■ 4.85
ARMC6-211ENST00000538663 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.12■■■■■ 4.81
ARMC6-211ENST00000538663 ERCC6Q03468 1493 aa45.11■■■■■ 4.81
ARMC6-211ENST00000538663 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.09■■■■■ 4.81
ARMC6-211ENST00000538663 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.03■■■■■ 4.8
ARMC6-211ENST00000538663 CUX2O14529 1486 aa44.98■■■■■ 4.79
ARMC6-211ENST00000538663 NESP48681 1621 aa44.96■■■■■ 4.79
ARMC6-211ENST00000538663 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.83■■■■■ 4.77
ARMC6-211ENST00000538663 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.62■■■■■ 4.73
ARMC6-211ENST00000538663 WIZO95785 1651 aa44.5■■■■■ 4.71
ARMC6-211ENST00000538663 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.46■■■■■ 4.71
ARMC6-211ENST00000538663 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.37■■■■■ 4.69
ARMC6-211ENST00000538663 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.35■■■■■ 4.69
ARMC6-211ENST00000538663 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.3■■■■■ 4.68
ARMC6-211ENST00000538663 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.14■■■■■ 4.66
ARMC6-211ENST00000538663 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.98■■■■■ 4.63
ARMC6-211ENST00000538663 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.93■■■■■ 4.62
ARMC6-211ENST00000538663 WDR62O43379 1518 aa43.87■■■■■ 4.61
ARMC6-211ENST00000538663 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.83■■■■■ 4.61
ARMC6-211ENST00000538663 CFTRP13569 1480 aa43.82■■■■■ 4.6
ARMC6-211ENST00000538663 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.8■■■■■ 4.6
ARMC6-211ENST00000538663 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.45■■■■■ 4.55
ARMC6-211ENST00000538663 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.44■■■■■ 4.54
ARMC6-211ENST00000538663 PRDM2Q13029 1718 aa43.38■■■■■ 4.53
ARMC6-211ENST00000538663 TOPBP1Q92547 1522 aa42.99■■■■■ 4.47
ARMC6-211ENST00000538663 IFT140Q96RY7 1462 aa42.94■■■■■ 4.47
ARMC6-211ENST00000538663 OSCARQ8IYS5 282 aa42.94■■■■■ 4.46
ARMC6-211ENST00000538663 TRIM41Q8WV44 630 aa42.94■■■■■ 4.46
ARMC6-211ENST00000538663 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.9■■■■■ 4.46
ARMC6-211ENST00000538663 ABCC8Q09428 1581 aa42.86■■■■■ 4.45
ARMC6-211ENST00000538663 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.84■■■■■ 4.45
ARMC6-211ENST00000538663 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.66■■■■■ 4.42
ARMC6-211ENST00000538663 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.6■■■■■ 4.41
ARMC6-211ENST00000538663 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.56■■■■■ 4.4
ARMC6-211ENST00000538663 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.52■■■■■ 4.44e-6■■■■□ 23.2
ARMC6-211ENST00000538663 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.42■■■■■ 4.38
ARMC6-211ENST00000538663 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.41■■■■■ 4.38
ARMC6-211ENST00000538663 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.41■■■■■ 4.38
ARMC6-211ENST00000538663 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.41■■■■■ 4.38
ARMC6-211ENST00000538663 SOGA1O94964 1423 aa42.36■■■■■ 4.37
ARMC6-211ENST00000538663 CHD1O14646 1710 aa42.32■■■■■ 4.36
ARMC6-211ENST00000538663 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.31■■■■■ 4.36
ARMC6-211ENST00000538663 CUX1P39880 1505 aa42.3■■■■■ 4.36
ARMC6-211ENST00000538663 ARHGEF11O15085 1522 aa42.28■■■■■ 4.36
ARMC6-211ENST00000538663 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.27■■■■■ 4.36
ARMC6-211ENST00000538663 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.27■■■■■ 4.36
ARMC6-211ENST00000538663 FBLN2P98095 1184 aa42.21■■■■■ 4.35
ARMC6-211ENST00000538663 WDR97A6NE52 1622 aa42.14■■■■■ 4.34
ARMC6-211ENST00000538663 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.09■■■■■ 4.33
ARMC6-211ENST00000538663 GRIN2BQ13224 1484 aa41.98■■■■■ 4.31
ARMC6-211ENST00000538663 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.96■■■■■ 4.31
ARMC6-211ENST00000538663 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.95■■■■■ 4.31
ARMC6-211ENST00000538663 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.9■■■■■ 4.3
ARMC6-211ENST00000538663 ARAP1Q96P48 1450 aa41.88■■■■■ 4.29
ARMC6-211ENST00000538663 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.85■■■■■ 4.29
ARMC6-211ENST00000538663 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.84■■■■■ 4.29
ARMC6-211ENST00000538663 SYNJ2O15056 1496 aa41.83■■■■■ 4.29
ARMC6-211ENST00000538663 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.83■■■■■ 4.29
ARMC6-211ENST00000538663 PBRM1Q86U86 1689 aa41.83■■■■■ 4.29
ARMC6-211ENST00000538663 SYNJ1O43426 1573 aa41.8■■■■■ 4.28
ARMC6-211ENST00000538663 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.77■■■■■ 4.28
ARMC6-211ENST00000538663 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.68■■■■■ 4.26
ARMC6-211ENST00000538663 TOP2BQ02880 1626 aa41.64■■■■■ 4.26
ARMC6-211ENST00000538663 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.64■■■■■ 4.26
ARMC6-211ENST00000538663 TRHP20396 242 aaPredicted RBP41.45■■■■■ 4.23
ARMC6-211ENST00000538663 ADAMTS12P58397 1594 aa41.45■■■■■ 4.23
ARMC6-211ENST00000538663 GRIN2AQ12879 1464 aa41.44■■■■■ 4.22
ARMC6-211ENST00000538663 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.32■■■■■ 4.21
ARMC6-211ENST00000538663 CEP170Q5SW79 1584 aa41.31■■■■■ 4.2
ARMC6-211ENST00000538663 NUP160Q12769 1436 aa41.3■■■■■ 4.2
ARMC6-211ENST00000538663 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.29■■■■■ 4.2
ARMC6-211ENST00000538663 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.22■■■■■ 4.19
ARMC6-211ENST00000538663 SHROOM2Q13796 1616 aa41.11■■■■■ 4.17
ARMC6-211ENST00000538663 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.9■■■■■ 4.14
ARMC6-211ENST00000538663 JPH4Q96JJ6 628 aa40.87■■■■■ 4.13
ARMC6-211ENST00000538663 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.87■■■■■ 4.13
ARMC6-211ENST00000538663 KIF27Q86VH2 1401 aa40.82■■■■■ 4.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.6 ms