RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356384.4

RXRA-201, Transcript of retinoid X receptor alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RXRA, Length 5,770 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRA-201ENST00000356384 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.64■■■□□ 2.02
RXRA-201ENST00000356384 NISCHQ9Y2I1 1504 aa26.51■■□□□ 1.83
RXRA-201ENST00000356384 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
RXRA-201ENST00000356384 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
RXRA-201ENST00000356384 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.7■■□□□ 1.7
RXRA-201ENST00000356384 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.32■■□□□ 1.64
RXRA-201ENST00000356384 APLP2Q06481 763 aa25.17■■□□□ 1.62
RXRA-201ENST00000356384 ERICH6Q7L0X2 663 aa24.93■■□□□ 1.58
RXRA-201ENST00000356384 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
RXRA-201ENST00000356384 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
RXRA-201ENST00000356384 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
RXRA-201ENST00000356384 PCGF6Q9BYE7 350 aa24.66■■□□□ 1.54
RXRA-201ENST00000356384 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
RXRA-201ENST00000356384 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
RXRA-201ENST00000356384 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
RXRA-201ENST00000356384 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
RXRA-201ENST00000356384 NEFLP07196 543 aa24.22■■□□□ 1.47
RXRA-201ENST00000356384 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
RXRA-201ENST00000356384 TRIM41Q8WV44 630 aa23.99■■□□□ 1.43
RXRA-201ENST00000356384 MYT1Q01538 1121 aa23.94■■□□□ 1.42
RXRA-201ENST00000356384 UBTFP17480 764 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
RXRA-201ENST00000356384 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
RXRA-201ENST00000356384 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
RXRA-201ENST00000356384 POLR3GLQ9BT43 218 aa23.58■■□□□ 1.36
RXRA-201ENST00000356384 MYT1LQ9UL68 1186 aa23.45■■□□□ 1.35
RXRA-201ENST00000356384 ITGAEP38570 1179 aa23.41■■□□□ 1.34
RXRA-201ENST00000356384 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
RXRA-201ENST00000356384 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
RXRA-201ENST00000356384 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
RXRA-201ENST00000356384 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
RXRA-201ENST00000356384 HRCP23327 699 aa23.24■■□□□ 1.31
RXRA-201ENST00000356384 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.22■■□□□ 1.31
RXRA-201ENST00000356384 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
RXRA-201ENST00000356384 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
RXRA-201ENST00000356384 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
RXRA-201ENST00000356384 CLSPNQ9HAW4 1339 aa23.13■■□□□ 1.29
RXRA-201ENST00000356384 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa22.86■■□□□ 1.25
RXRA-201ENST00000356384 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
RXRA-201ENST00000356384 ABCC9O60706 1549 aa22.73■■□□□ 1.23
RXRA-201ENST00000356384 BCANQ96GW7 911 aa22.72■■□□□ 1.23
RXRA-201ENST00000356384 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
RXRA-201ENST00000356384 TRIM52Q96A61 297 aa22.63■■□□□ 1.21
RXRA-201ENST00000356384 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
RXRA-201ENST00000356384 NEUROD1Q13562 356 aa22.58■■□□□ 1.21
RXRA-201ENST00000356384 BCL11AQ9H165 835 aa22.55■■□□□ 1.2
RXRA-201ENST00000356384 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
RXRA-201ENST00000356384 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
RXRA-201ENST00000356384 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa22.46■■□□□ 1.19
RXRA-201ENST00000356384 SLC24A1O60721 1099 aa22.46■■□□□ 1.19
RXRA-201ENST00000356384 ANP32CO43423 234 aa22.44■■□□□ 1.18
RXRA-201ENST00000356384 CANXP27824 592 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
RXRA-201ENST00000356384 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP22.36■■□□□ 1.17
RXRA-201ENST00000356384 FBLN2P98095 1184 aa22.32■■□□□ 1.16
RXRA-201ENST00000356384 NEFMP07197 916 aa22.22■■□□□ 1.15
RXRA-201ENST00000356384 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
RXRA-201ENST00000356384 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
RXRA-201ENST00000356384 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa22.15■■□□□ 1.14
RXRA-201ENST00000356384 ARID3CA6NKF2 412 aa22.13■■□□□ 1.13
RXRA-201ENST00000356384 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
RXRA-201ENST00000356384 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
RXRA-201ENST00000356384 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
RXRA-201ENST00000356384 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
RXRA-201ENST00000356384 PLPPR3Q6T4P5 718 aa21.96■■□□□ 1.11
RXRA-201ENST00000356384 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
RXRA-201ENST00000356384 P3H3Q8IVL6 736 aa21.94■■□□□ 1.1
RXRA-201ENST00000356384 SCRIBQ14160 1630 aa21.9■■□□□ 1.1
RXRA-201ENST00000356384 FKBP8Q14318 412 aa21.86■■□□□ 1.09
RXRA-201ENST00000356384 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
RXRA-201ENST00000356384 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
RXRA-201ENST00000356384 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa21.75■■□□□ 1.07
RXRA-201ENST00000356384 ARXQ96QS3 562 aa21.74■■□□□ 1.07
RXRA-201ENST00000356384 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
RXRA-201ENST00000356384 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP21.73■■□□□ 1.07
RXRA-201ENST00000356384 CHGAP10645 457 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
RXRA-201ENST00000356384 FAM9BQ8IZU0 186 aa21.71■■□□□ 1.07
RXRA-201ENST00000356384 NBR1Q14596 966 aa21.69■■□□□ 1.06
RXRA-201ENST00000356384 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
RXRA-201ENST00000356384 STAG3Q9UJ98 1225 aa21.67■■□□□ 1.06
RXRA-201ENST00000356384 TONSLQ96HA7 1378 aa21.6■■□□□ 1.05
RXRA-201ENST00000356384 CCDC136Q96JN2 1154 aa21.6■■□□□ 1.05
RXRA-201ENST00000356384 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
RXRA-201ENST00000356384 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
RXRA-201ENST00000356384 TMC1Q8TDI8 760 aa21.51■■□□□ 1.03
RXRA-201ENST00000356384 CSRNP3Q8WYN3 585 aa21.49■■□□□ 1.03
RXRA-201ENST00000356384 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
RXRA-201ENST00000356384 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP21.47■■□□□ 1.03
RXRA-201ENST00000356384 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa21.43■■□□□ 1.02
RXRA-201ENST00000356384 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
RXRA-201ENST00000356384 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
RXRA-201ENST00000356384 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
RXRA-201ENST00000356384 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP21.4■■□□□ 1.02
RXRA-201ENST00000356384 PLEKHG5O94827 1062 aa21.39■■□□□ 1.01
RXRA-201ENST00000356384 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP21.39■■□□□ 1.01
RXRA-201ENST00000356384 MYH16Q9H6N6 1097 aa21.38■■□□□ 1.01
RXRA-201ENST00000356384 MRS2Q9HD23 443 aa21.38■■□□□ 1.01
RXRA-201ENST00000356384 A0A0G2JS52 829 aa21.37■■□□□ 1.01
RXRA-201ENST00000356384 CHIC2Q9UKJ5 165 aa21.35■■□□□ 1.01
RXRA-201ENST00000356384 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa21.33■■□□□ 1.01
RXRA-201ENST00000356384 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
RXRA-201ENST00000356384 NACADO15069 1562 aa21.28■■□□□ 1
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