Protein–RNA interactions for Protein: O60832

DKC1, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKC1O60832 TRRAP-203ENST00000417523 550 ntTSL 418.33■□□□□ 0.521e-109■■■■■ 374.3
DKC1O60832 TRRAP-201ENST00000355540 12590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.071e-109■■■■■ 374.3
DKC1O60832 TRRAP-202ENST00000359863 12677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.111e-109■■■■■ 374.3
DKC1O60832 TRRAP-207ENST00000628380 12644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.131e-109■■■■■ 374.3
DKC1O60832 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.291e-109■■■■■ 374.3
DKC1O60832 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC0.8□□□□□ -2.281e-323■■■■■ 343.2
DKC1O60832 GTF2A1-201ENST00000298173 1677 ntTSL 227.43■■□□□ 1.987e-71■■■■■ 267.5
DKC1O60832 GTF2A1-203ENST00000553612 6306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.87e-71■■■■■ 267.5
DKC1O60832 GTF2A1-204ENST00000556268 864 ntTSL 59.95□□□□□ -0.827e-71■■■■■ 267.5
DKC1O60832 GTF2A1-202ENST00000434192 1199 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.187e-71■■■■■ 267.5
DKC1O60832 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC0.31□□□□□ -2.367e-71■■■■■ 267.5
DKC1O60832 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.361e-323■■■■■ 261.6
DKC1O60832 SEC14L1-206ENST00000561633 603 ntTSL 1 (best)16.18■□□□□ 0.181e-323■■■■■ 261.6
DKC1O60832 SEC14L1-207ENST00000561721 637 ntTSL 215.62■□□□□ 0.091e-323■■■■■ 261.6
DKC1O60832 SNHG20-203ENST00000565256 1234 ntTSL 1 (best)14.79□□□□□ -0.041e-323■■■■■ 261.6
DKC1O60832 SNHG20-205ENST00000568363 786 ntTSL 1 (best)14.72□□□□□ -0.051e-323■■■■■ 261.6
DKC1O60832 SEC14L1-209ENST00000564509 806 ntTSL 1 (best)14.43□□□□□ -0.11e-323■■■■■ 261.6
DKC1O60832 SEC14L1-224ENST00000589827 1791 ntTSL 213.45□□□□□ -0.261e-323■■■■■ 261.6
DKC1O60832 SEC14L1-211ENST00000569632 377 ntTSL 1 (best)13.37□□□□□ -0.271e-323■■■■■ 261.6
DKC1O60832 SEC14L1-202ENST00000430767 5283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.281e-323■■■■■ 261.6
DKC1O60832 SNHG20-202ENST00000434411 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.341e-323■■■■■ 261.6
DKC1O60832 SNHG20-201ENST00000366365 1028 ntTSL 211.79□□□□□ -0.521e-323■■■■■ 261.6
DKC1O60832 SEC14L1-201ENST00000392476 2957 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.631e-323■■■■■ 261.6
DKC1O60832 SCARNA16-201ENST00000515981 187 ntBASIC10.86□□□□□ -0.671e-323■■■■■ 261.6
DKC1O60832 SEC14L1-208ENST00000564414 528 ntTSL 1 (best)6.64□□□□□ -1.351e-323■■■■■ 261.6
DKC1O60832 SEC14L1-210ENST00000568056 424 ntTSL 1 (best)4.24□□□□□ -1.731e-323■■■■■ 261.6
DKC1O60832 RPSA-209ENST00000495394 2058 ntTSL 1 (best)9.94□□□□□ -0.825e-67■■■■■ 246.3
DKC1O60832 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC4.93□□□□□ -1.625e-67■■■■■ 246.3
DKC1O60832 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.462e-278■■■■■ 237
DKC1O60832 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.31■□□□□ 0.362e-278■■■■■ 237
DKC1O60832 SRGAP2B-204ENST00000612199 7120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.752e-278■■■■■ 237
DKC1O60832 SRGAP2B-206ENST00000621582 486 ntTSL 55.29□□□□□ -1.562e-278■■■■■ 237
DKC1O60832 TNS1-217ENST00000490566 1652 ntTSL 211.32□□□□□ -0.63e-8■■■■■ 230.9
DKC1O60832 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.681e-12■■■■■ 223.1
DKC1O60832 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC4.79□□□□□ -1.641e-323■■■■■ 207.8
DKC1O60832 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.031e-323■■■■■ 205.3
DKC1O60832 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.991e-323■■■■■ 205.3
DKC1O60832 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.341e-323■■■■■ 205.3
DKC1O60832 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.071e-323■■■■■ 205.3
DKC1O60832 SLC25A3-202ENST00000228318 1678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.051e-323■■■■■ 205.3
DKC1O60832 SLC25A3-212ENST00000549338 1285 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.191e-323■■■■■ 205.3
DKC1O60832 SLC25A3-214ENST00000551123 1417 ntTSL 1 (best)13.82□□□□□ -0.21e-323■■■■■ 205.3
DKC1O60832 SLC25A3-203ENST00000401722 6087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.371e-323■■■■■ 205.3
DKC1O60832 SLC25A3-204ENST00000546766 3236 ntTSL 1 (best)11.16□□□□□ -0.621e-323■■■■■ 205.3
DKC1O60832 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC0.64□□□□□ -2.311e-323■■■■■ 205.3
DKC1O60832 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC3.57□□□□□ -1.841e-108■■■■■ 204
DKC1O60832 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.531e-323■■■■■ 203.1
DKC1O60832 NCAPD2-207ENST00000539084 4290 ntTSL 212.46□□□□□ -0.421e-323■■■■■ 203.1
DKC1O60832 NCAPD2-202ENST00000382457 2844 ntTSL 511.13□□□□□ -0.631e-323■■■■■ 203.1
DKC1O60832 NCAPD2-208ENST00000539714 533 ntTSL 37.72□□□□□ -1.171e-323■■■■■ 203.1
DKC1O60832 NCAPD2-210ENST00000541399 584 ntTSL 57.57□□□□□ -1.21e-323■■■■■ 203.1
DKC1O60832 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC5.18□□□□□ -1.581e-323■■■■■ 203.1
DKC1O60832 SCARNA9-201ENST00000530422 353 ntBASIC8.86□□□□□ -0.992e-85■■■■■ 200.3
DKC1O60832 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.492e-85■■■■■ 200.3
DKC1O60832 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.692e-85■■■■■ 200.3
DKC1O60832 CEP295-203ENST00000530425 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 43.47□□□□□ -1.852e-85■■■■■ 200.3
DKC1O60832 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC2.49□□□□□ -2.011e-323■■■■■ 192.5
DKC1O60832 TNS3-204ENST00000428457 5070 ntTSL 1 (best)11.16□□□□□ -0.623e-42■■■■■ 186.7
DKC1O60832 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC5.77□□□□□ -1.491e-323■■■■■ 184.1
DKC1O60832 RPL39-202ENST00000468844 1915 ntTSL 1 (best)19.51■□□□□ 0.711e-242■■■■■ 180.2
DKC1O60832 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.581e-242■■■■■ 180.2
DKC1O60832 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC2.22□□□□□ -2.051e-242■■■■■ 180.2
DKC1O60832 KDM4B-206ENST00000588361 3039 ntTSL 216.16■□□□□ 0.185e-20■■■■■ 176
DKC1O60832 KDM4B-208ENST00000589104 3470 ntTSL 214.05□□□□□ -0.165e-20■■■■■ 176
DKC1O60832 GAK-204ENST00000504435 4346 ntTSL 212.62□□□□□ -0.391e-11■■■■■ 175.8
DKC1O60832 TNS1-209ENST00000446688 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.644e-8■■■■■ 175.1
DKC1O60832 RPSA-207ENST00000478027 1227 ntTSL 212.95□□□□□ -0.342e-67■■■■■ 174.2
DKC1O60832 RPSA-204ENST00000458478 874 ntTSL 212.62□□□□□ -0.392e-67■■■■■ 174.2
DKC1O60832 RPSA-201ENST00000301821 1171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.592e-67■■■■■ 174.2
DKC1O60832 RPSA-202ENST00000443003 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.092e-67■■■■■ 174.2
DKC1O60832 KPNA4-201ENST00000334256 8981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.181e-323■■■■■ 170.7
DKC1O60832 SCARNA7-201ENST00000458797 330 ntBASIC11.47□□□□□ -0.571e-323■■■■■ 170.7
DKC1O60832 KPNA4-203ENST00000483437 510 ntTSL 54.39□□□□□ -1.711e-323■■■■■ 170.7
DKC1O60832 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC4.95□□□□□ -1.621e-323■■■■■ 170.4
DKC1O60832 RERE-218ENST00000514428 273 ntTSL 31.77□□□□□ -2.134e-7■■■■■ 169.4
DKC1O60832 CWF19L1-206ENST00000478047 2694 ntTSL 211.27□□□□□ -0.61e-323■■■■■ 168.8
DKC1O60832 CWF19L1-204ENST00000468709 2402 ntTSL 210.73□□□□□ -0.691e-323■■■■■ 168.8
DKC1O60832 CWF19L1-201ENST00000354105 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.981e-323■■■■■ 168.8
DKC1O60832 CWF19L1-207ENST00000482452 1606 ntTSL 57.07□□□□□ -1.281e-323■■■■■ 168.8
DKC1O60832 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC1.79□□□□□ -2.121e-323■■■■■ 168.4
DKC1O60832 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC5.44□□□□□ -1.541e-323■■■■■ 165.7
DKC1O60832 RPL39-203ENST00000477403 405 ntTSL 33.95□□□□□ -1.781e-323■■■■■ 162.4
DKC1O60832 C14orf159-221ENST00000521334 909 ntTSL 321.53■■□□□ 1.046e-8■■■■■ 158.2
DKC1O60832 C14orf159-225ENST00000522837 558 ntTSL 414.24□□□□□ -0.136e-8■■■■■ 158.2
DKC1O60832 C14orf159-218ENST00000521064 544 ntTSL 414.06□□□□□ -0.166e-8■■■■■ 158.2
DKC1O60832 C14orf159-232ENST00000523894 862 ntTSL 1 (best)13.51□□□□□ -0.256e-8■■■■■ 158.2
DKC1O60832 C14orf159-214ENST00000519950 1060 ntTSL 313.51□□□□□ -0.256e-8■■■■■ 158.2
DKC1O60832 C14orf159-222ENST00000522170 853 ntTSL 313.27□□□□□ -0.296e-8■■■■■ 158.2
DKC1O60832 C14orf159-215ENST00000519994 1148 ntTSL 1 (best)12.82□□□□□ -0.366e-8■■■■■ 158.2
DKC1O60832 C14orf159-206ENST00000517362 583 ntTSL 412.63□□□□□ -0.396e-8■■■■■ 158.2
DKC1O60832 C14orf159-207ENST00000517518 1597 ntTSL 1 (best)11.63□□□□□ -0.556e-8■■■■■ 158.2
DKC1O60832 C14orf159-212ENST00000518871 484 ntTSL 411.42□□□□□ -0.586e-8■■■■■ 158.2
DKC1O60832 C14orf159-210ENST00000518665 959 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.976e-8■■■■■ 158.2
DKC1O60832 C14orf159-233ENST00000524232 550 ntTSL 28.67□□□□□ -1.026e-8■■■■■ 158.2
DKC1O60832 C14orf159-213ENST00000519019 834 ntTSL 3 BASIC8.21□□□□□ -1.16e-8■■■■■ 158.2
DKC1O60832 C14orf159-231ENST00000523879 650 ntTSL 57.35□□□□□ -1.236e-8■■■■■ 158.2
DKC1O60832 C14orf159-209ENST00000518649 555 ntTSL 46.57□□□□□ -1.366e-8■■■■■ 158.2
DKC1O60832 C14orf159-220ENST00000521081 622 ntTSL 26.49□□□□□ -1.376e-8■■■■■ 158.2
DKC1O60832 SH3BP2-229ENST00000515802 2247 ntTSL 216.41■□□□□ 0.227e-34■■■■■ 150.2
DKC1O60832 SH3BP2-217ENST00000510204 3617 ntTSL 212.48□□□□□ -0.417e-34■■■■■ 150.2
Retrieved 100 of 8,567 protein–RNA pairs in 34.3 ms