Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP8A1Q9Y2Q0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP8A1Q9Y2Q0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP8A1Q9Y2Q0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP8A1Q9Y2Q0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP8A1Q9Y2Q0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP8A1Q9Y2Q0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP8A1Q9Y2Q0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP8A1Q9Y2Q0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP8A1Q9Y2Q0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP8A1Q9Y2Q0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP8A1Q9Y2Q0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP8A1Q9Y2Q0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP8A1Q9Y2Q0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP8A1Q9Y2Q0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP8A1Q9Y2Q0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP8A1Q9Y2Q0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP8A1Q9Y2Q0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP8A1Q9Y2Q0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP8A1Q9Y2Q0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP8A1Q9Y2Q0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP8A1Q9Y2Q0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP8A1Q9Y2Q0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP8A1Q9Y2Q0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP8A1Q9Y2Q0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP8A1Q9Y2Q0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP8A1Q9Y2Q0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP8A1Q9Y2Q0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP8A1Q9Y2Q0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP8A1Q9Y2Q0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP8A1Q9Y2Q0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP8A1Q9Y2Q0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP8A1Q9Y2Q0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP8A1Q9Y2Q0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP8A1Q9Y2Q0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP8A1Q9Y2Q0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP8A1Q9Y2Q0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP8A1Q9Y2Q0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP8A1Q9Y2Q0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP8A1Q9Y2Q0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP8A1Q9Y2Q0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP8A1Q9Y2Q0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP8A1Q9Y2Q0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP8A1Q9Y2Q0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP8A1Q9Y2Q0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP8A1Q9Y2Q0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP8A1Q9Y2Q0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP8A1Q9Y2Q0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP8A1Q9Y2Q0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP8A1Q9Y2Q0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP8A1Q9Y2Q0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP8A1Q9Y2Q0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP8A1Q9Y2Q0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP8A1Q9Y2Q0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP8A1Q9Y2Q0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP8A1Q9Y2Q0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP8A1Q9Y2Q0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP8A1Q9Y2Q0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP8A1Q9Y2Q0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP8A1Q9Y2Q0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP8A1Q9Y2Q0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP8A1Q9Y2Q0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP8A1Q9Y2Q0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP8A1Q9Y2Q0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP8A1Q9Y2Q0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP8A1Q9Y2Q0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP8A1Q9Y2Q0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATP8A1Q9Y2Q0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP8A1Q9Y2Q0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP8A1Q9Y2Q0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP8A1Q9Y2Q0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP8A1Q9Y2Q0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP8A1Q9Y2Q0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP8A1Q9Y2Q0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP8A1Q9Y2Q0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP8A1Q9Y2Q0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP8A1Q9Y2Q0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP8A1Q9Y2Q0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP8A1Q9Y2Q0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP8A1Q9Y2Q0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP8A1Q9Y2Q0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP8A1Q9Y2Q0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP8A1Q9Y2Q0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP8A1Q9Y2Q0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP8A1Q9Y2Q0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP8A1Q9Y2Q0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP8A1Q9Y2Q0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP8A1Q9Y2Q0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP8A1Q9Y2Q0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP8A1Q9Y2Q0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP8A1Q9Y2Q0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP8A1Q9Y2Q0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP8A1Q9Y2Q0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP8A1Q9Y2Q0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP8A1Q9Y2Q0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.9 ms