RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557052.1

SLC25A47-202, Transcript of solute carrier family 25 member 47, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC25A47, Length 1,552 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A47-202ENST00000557052 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.28■■■■■ 5.48
SLC25A47-202ENST00000557052 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa42.95■■■■■ 4.47
SLC25A47-202ENST00000557052 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.46■■■■■ 4.23
SLC25A47-202ENST00000557052 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.87■■■■■ 4.13
SLC25A47-202ENST00000557052 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.35■■■■■ 4.05
SLC25A47-202ENST00000557052 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.33■■■■■ 4.05
SLC25A47-202ENST00000557052 ABCC9O60706 1549 aa40.2■■■■■ 4.03
SLC25A47-202ENST00000557052 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.1■■■■■ 4.01
SLC25A47-202ENST00000557052 NACADO15069 1562 aa39.93■■■■□ 3.98
SLC25A47-202ENST00000557052 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa39.5■■■■□ 3.91
SLC25A47-202ENST00000557052 SCRIBQ14160 1630 aa39.35■■■■□ 3.89
SLC25A47-202ENST00000557052 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.71■■■■□ 3.79
SLC25A47-202ENST00000557052 UNC13AQ9UPW8 1703 aa38.65■■■■□ 3.78
SLC25A47-202ENST00000557052 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.28■■■■□ 3.72
SLC25A47-202ENST00000557052 BICRAQ9NZM4 1560 aa38.28■■■■□ 3.72
SLC25A47-202ENST00000557052 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.18■■■■□ 3.7
SLC25A47-202ENST00000557052 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.05■■■■□ 3.68
SLC25A47-202ENST00000557052 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.02■■■■□ 3.68
SLC25A47-202ENST00000557052 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP37.89■■■■□ 3.66
SLC25A47-202ENST00000557052 SMARCA4P51532 1647 aa37.82■■■■□ 3.65
SLC25A47-202ENST00000557052 WIZO95785 1651 aa37.7■■■■□ 3.63
SLC25A47-202ENST00000557052 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.45■■■■□ 3.58
SLC25A47-202ENST00000557052 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.41■■■■□ 3.58
SLC25A47-202ENST00000557052 CHIC1Q5VXU3 224 aa37.3■■■■□ 3.56
SLC25A47-202ENST00000557052 SMARCA2P51531 1590 aa37.18■■■■□ 3.54
SLC25A47-202ENST00000557052 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.14■■■■□ 3.54
SLC25A47-202ENST00000557052 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP37.09■■■■□ 3.53
SLC25A47-202ENST00000557052 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.97■■■■□ 3.51
SLC25A47-202ENST00000557052 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP36.93■■■■□ 3.5
SLC25A47-202ENST00000557052 NCAPD3P42695 1498 aa36.84■■■■□ 3.49
SLC25A47-202ENST00000557052 HMGXB3Q12766 1538 aa36.83■■■■□ 3.49
SLC25A47-202ENST00000557052 TRIM41Q8WV44 630 aa36.48■■■■□ 3.43
SLC25A47-202ENST00000557052 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa36.45■■■■□ 3.43
SLC25A47-202ENST00000557052 ABCC8Q09428 1581 aa36.19■■■■□ 3.38
SLC25A47-202ENST00000557052 CFTRP13569 1480 aa36.06■■■■□ 3.36
SLC25A47-202ENST00000557052 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.02■■■■□ 3.36
SLC25A47-202ENST00000557052 PRDM2Q13029 1718 aa35.92■■■■□ 3.34
SLC25A47-202ENST00000557052 CADPSQ9ULU8 1353 aa35.86■■■■□ 3.33
SLC25A47-202ENST00000557052 SYNJ1O43426 1573 aa35.84■■■■□ 3.33
SLC25A47-202ENST00000557052 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa35.76■■■■□ 3.32
SLC25A47-202ENST00000557052 TOP2BQ02880 1626 aa35.75■■■■□ 3.31
SLC25A47-202ENST00000557052 EEA1Q15075 1411 aa35.73■■■■□ 3.31
SLC25A47-202ENST00000557052 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.73■■■■□ 3.31
SLC25A47-202ENST00000557052 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP35.68■■■■□ 3.3
SLC25A47-202ENST00000557052 SOGA1O94964 1423 aa35.57■■■■□ 3.28
SLC25A47-202ENST00000557052 CUX1P39880 1505 aa35.55■■■■□ 3.28
SLC25A47-202ENST00000557052 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa35.55■■■■□ 3.28
SLC25A47-202ENST00000557052 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.44■■■■□ 3.26
SLC25A47-202ENST00000557052 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.4■■■■□ 3.26
SLC25A47-202ENST00000557052 CSRNP3Q8WYN3 585 aa35.38■■■■□ 3.25
SLC25A47-202ENST00000557052 NESP48681 1621 aa35.37■■■■□ 3.25
SLC25A47-202ENST00000557052 DNAJC5BQ9UF47 199 aa35.3■■■■□ 3.24
SLC25A47-202ENST00000557052 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.24■■■■□ 3.23
SLC25A47-202ENST00000557052 KIF21BO75037 1637 aa35.21■■■■□ 3.23
SLC25A47-202ENST00000557052 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.21■■■■□ 3.23
SLC25A47-202ENST00000557052 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.2■■■■□ 3.23
SLC25A47-202ENST00000557052 GOLGA3Q08378 1498 aa35.16■■■■□ 3.22
SLC25A47-202ENST00000557052 TNIKQ9UKE5 1360 aa35.12■■■■□ 3.21
SLC25A47-202ENST00000557052 KIF27Q86VH2 1401 aa35.11■■■■□ 3.21
SLC25A47-202ENST00000557052 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.11■■■■□ 3.21
SLC25A47-202ENST00000557052 TOPBP1Q92547 1522 aa35.09■■■■□ 3.21
SLC25A47-202ENST00000557052 EHMT2Q96KQ7 1210 aa35.05■■■■□ 3.2
SLC25A47-202ENST00000557052 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa34.99■■■■□ 3.19
SLC25A47-202ENST00000557052 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP34.98■■■■□ 3.19
SLC25A47-202ENST00000557052 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.96■■■■□ 3.19
SLC25A47-202ENST00000557052 PRXQ9BXM0 1461 aa34.95■■■■□ 3.19
SLC25A47-202ENST00000557052 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP34.93■■■■□ 3.18
SLC25A47-202ENST00000557052 CUX2O14529 1486 aa34.92■■■■□ 3.18
SLC25A47-202ENST00000557052 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.88■■■■□ 3.17
SLC25A47-202ENST00000557052 CEP162Q5TB80 1403 aa34.88■■■■□ 3.17
SLC25A47-202ENST00000557052 UBTFP17480 764 aaKnown RBP34.87■■■■□ 3.17
SLC25A47-202ENST00000557052 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa34.86■■■■□ 3.17
SLC25A47-202ENST00000557052 MRC2Q9UBG0 1479 aa34.76■■■■□ 3.16
SLC25A47-202ENST00000557052 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.76■■■■□ 3.15
SLC25A47-202ENST00000557052 IGF1RP08069 1367 aa34.76■■■■□ 3.15
SLC25A47-202ENST00000557052 WDR97A6NE52 1622 aa34.75■■■■□ 3.15
SLC25A47-202ENST00000557052 WDR62O43379 1518 aa34.59■■■■□ 3.13
SLC25A47-202ENST00000557052 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa34.58■■■■□ 3.13
SLC25A47-202ENST00000557052 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP34.57■■■■□ 3.12
SLC25A47-202ENST00000557052 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.57■■■■□ 3.12
SLC25A47-202ENST00000557052 CLIP1P30622 1438 aa34.56■■■■□ 3.12
SLC25A47-202ENST00000557052 CUL7Q14999 1698 aa34.54■■■■□ 3.12
SLC25A47-202ENST00000557052 ERCC6Q03468 1493 aa34.47■■■■□ 3.11
SLC25A47-202ENST00000557052 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP34.45■■■■□ 3.1
SLC25A47-202ENST00000557052 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.44■■■■□ 3.1
SLC25A47-202ENST00000557052 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP34.41■■■■□ 3.1
SLC25A47-202ENST00000557052 IFT140Q96RY7 1462 aa34.39■■■■□ 3.1
SLC25A47-202ENST00000557052 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.38■■■■□ 3.09
SLC25A47-202ENST00000557052 PCGF6Q9BYE7 350 aa34.35■■■■□ 3.09
SLC25A47-202ENST00000557052 VPS8Q8N3P4 1428 aa34.33■■■■□ 3.09
SLC25A47-202ENST00000557052 PBRM1Q86U86 1689 aa34.24■■■■□ 3.07
SLC25A47-202ENST00000557052 ARAP1Q96P48 1450 aa34.21■■■■□ 3.07
SLC25A47-202ENST00000557052 GRIN2BQ13224 1484 aa34.18■■■■□ 3.06
SLC25A47-202ENST00000557052 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa34.17■■■■□ 3.06
SLC25A47-202ENST00000557052 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa34.14■■■■□ 3.06
SLC25A47-202ENST00000557052 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.13■■■■□ 3.05
SLC25A47-202ENST00000557052 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.12■■■■□ 3.05
SLC25A47-202ENST00000557052 ADAMTS12P58397 1594 aa34.09■■■■□ 3.05
SLC25A47-202ENST00000557052 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP34.08■■■■□ 3.05
SLC25A47-202ENST00000557052 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP34.07■■■■□ 3.05
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