RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000371964.4

SURF2-201, Transcript of surfeit 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SURF2, Length 842 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF2-201ENST00000371964 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.98■■■■■ 6.55
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SURF2-201ENST00000371964 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.23■■■■■ 5.15
SURF2-201ENST00000371964 NACADO15069 1562 aa47.08■■■■■ 5.13
SURF2-201ENST00000371964 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.99■■■■■ 5.11
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SURF2-201ENST00000371964 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.28■■■■■ 5
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SURF2-201ENST00000371964 SCRIBQ14160 1630 aa45.49■■■■■ 4.87
SURF2-201ENST00000371964 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.29■■■■■ 4.84
SURF2-201ENST00000371964 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.68■■■■■ 4.74
SURF2-201ENST00000371964 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.62■■■■■ 4.73
SURF2-201ENST00000371964 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.42■■■■■ 4.7
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SURF2-201ENST00000371964 SMARCA4P51532 1647 aa43.49■■■■■ 4.55
SURF2-201ENST00000371964 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.45■■■■■ 4.55
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SURF2-201ENST00000371964 SMARCA2P51531 1590 aa43.3■■■■■ 4.52
SURF2-201ENST00000371964 HMGXB3Q12766 1538 aa43.18■■■■■ 4.5
SURF2-201ENST00000371964 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.15■■■■■ 4.5
SURF2-201ENST00000371964 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.12■■■■■ 4.49
SURF2-201ENST00000371964 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43■■■■■ 4.47
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SURF2-201ENST00000371964 NESP48681 1621 aa42.6■■■■■ 4.41
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SURF2-201ENST00000371964 CUX2O14529 1486 aa42.31■■■■■ 4.36
SURF2-201ENST00000371964 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.23■■■■■ 4.35
SURF2-201ENST00000371964 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.13■■■■■ 4.34
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SURF2-201ENST00000371964 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.01■■■■■ 4.32
SURF2-201ENST00000371964 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.99■■■■■ 4.31
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SURF2-201ENST00000371964 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.72■■■■■ 4.27
SURF2-201ENST00000371964 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.71■■■■■ 4.27
SURF2-201ENST00000371964 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.7■■■■■ 4.27
SURF2-201ENST00000371964 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.69■■■■■ 4.26
SURF2-201ENST00000371964 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.65■■■■■ 4.26
SURF2-201ENST00000371964 WDR62O43379 1518 aa41.59■■■■■ 4.25
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SURF2-201ENST00000371964 PRDM2Q13029 1718 aa41.32■■■■■ 4.21
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SURF2-201ENST00000371964 TOPBP1Q92547 1522 aa40.98■■■■■ 4.15
SURF2-201ENST00000371964 ABCC8Q09428 1581 aa40.92■■■■■ 4.14
SURF2-201ENST00000371964 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.84■■■■■ 4.13
SURF2-201ENST00000371964 IFT140Q96RY7 1462 aa40.83■■■■■ 4.13
SURF2-201ENST00000371964 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.72■■■■■ 4.11
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SURF2-201ENST00000371964 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.41■■■■■ 4.06
SURF2-201ENST00000371964 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.3■■■■■ 4.04
SURF2-201ENST00000371964 WDR97A6NE52 1622 aa40.15■■■■■ 4.02
SURF2-201ENST00000371964 TRIM41Q8WV44 630 aa40.04■■■■■ 4
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SURF2-201ENST00000371964 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.01■■■■■ 4
SURF2-201ENST00000371964 CHD1O14646 1710 aa40.01■■■■■ 4
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SURF2-201ENST00000371964 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40■■■■□ 3.99
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SURF2-201ENST00000371964 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.94■■■■□ 3.99
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SURF2-201ENST00000371964 SYNJ1O43426 1573 aa39.94■■■■□ 3.98
SURF2-201ENST00000371964 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.93■■■■□ 3.98
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SURF2-201ENST00000371964 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.86■■■■□ 3.97
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SURF2-201ENST00000371964 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.86■■■■□ 3.97
SURF2-201ENST00000371964 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.85■■■■□ 3.97
SURF2-201ENST00000371964 ARHGEF11O15085 1522 aa39.82■■■■□ 3.97
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SURF2-201ENST00000371964 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.5■■■■□ 3.91
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SURF2-201ENST00000371964 JPH4Q96JJ6 628 aa39■■■■□ 3.83
SURF2-201ENST00000371964 CUL7Q14999 1698 aa38.98■■■■□ 3.83
SURF2-201ENST00000371964 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa38.94■■■■□ 3.82
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