RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526269.2

SENCR-201, smooth muscle and endothelial cell enriched migration/differentiation-associated lncRNA, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SENCR, Length 1,298 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENCR-201ENST00000526269 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.97■■■■■ 6.55
SENCR-201ENST00000526269 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.13■■■■■ 5.62
SENCR-201ENST00000526269 ABCC9O60706 1549 aa49.72■■■■■ 5.55
SENCR-201ENST00000526269 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.54■■■■■ 5.2
SENCR-201ENST00000526269 NACADO15069 1562 aa47.28■■■■■ 5.16
SENCR-201ENST00000526269 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.14■■■■■ 5.14
SENCR-201ENST00000526269 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.73■■■■■ 5.07
SENCR-201ENST00000526269 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.49■■■■■ 5.03
SENCR-201ENST00000526269 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.4■■■■■ 5.02
SENCR-201ENST00000526269 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.31■■■■■ 5
SENCR-201ENST00000526269 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.27■■■■■ 5
SENCR-201ENST00000526269 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.16■■■■■ 4.98
SENCR-201ENST00000526269 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.03■■■■■ 4.96
SENCR-201ENST00000526269 SCRIBQ14160 1630 aa45.7■■■■■ 4.91
SENCR-201ENST00000526269 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.56■■■■■ 4.88
SENCR-201ENST00000526269 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.94■■■■■ 4.78
SENCR-201ENST00000526269 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.93■■■■■ 4.78
SENCR-201ENST00000526269 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.76■■■■■ 4.76
SENCR-201ENST00000526269 SMARCA4P51532 1647 aa43.61■■■■■ 4.57
SENCR-201ENST00000526269 NCAPD3P42695 1498 aa43.6■■■■■ 4.57
SENCR-201ENST00000526269 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.52■■■■■ 4.56
SENCR-201ENST00000526269 SMARCA2P51531 1590 aa43.49■■■■■ 4.55
SENCR-201ENST00000526269 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.48■■■■■ 4.55
SENCR-201ENST00000526269 HMGXB3Q12766 1538 aa43.36■■■■■ 4.53
SENCR-201ENST00000526269 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.19■■■■■ 4.51
SENCR-201ENST00000526269 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.16■■■■■ 4.5
SENCR-201ENST00000526269 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.12■■■■■ 4.49
SENCR-201ENST00000526269 ERCC6Q03468 1493 aa42.98■■■■■ 4.47
SENCR-201ENST00000526269 NESP48681 1621 aa42.79■■■■■ 4.44
SENCR-201ENST00000526269 CUX2O14529 1486 aa42.73■■■■■ 4.43
SENCR-201ENST00000526269 WIZO95785 1651 aa42.64■■■■■ 4.42
SENCR-201ENST00000526269 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.61■■■■■ 4.41
SENCR-201ENST00000526269 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.37■■■■■ 4.37
SENCR-201ENST00000526269 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.36■■■■■ 4.37
SENCR-201ENST00000526269 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.31■■■■■ 4.36
SENCR-201ENST00000526269 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.31■■■■■ 4.36
SENCR-201ENST00000526269 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.28■■■■■ 4.36
SENCR-201ENST00000526269 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.19■■■■■ 4.34
SENCR-201ENST00000526269 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.16■■■■■ 4.34
SENCR-201ENST00000526269 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.97■■■■■ 4.31
SENCR-201ENST00000526269 CFTRP13569 1480 aa41.9■■■■■ 4.3
SENCR-201ENST00000526269 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.9■■■■■ 4.3
SENCR-201ENST00000526269 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.85■■■■■ 4.29
SENCR-201ENST00000526269 WDR62O43379 1518 aa41.83■■■■■ 4.29
SENCR-201ENST00000526269 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.63■■■■■ 4.25
SENCR-201ENST00000526269 PRDM2Q13029 1718 aa41.58■■■■■ 4.25
SENCR-201ENST00000526269 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.44■■■■■ 4.23
SENCR-201ENST00000526269 TOPBP1Q92547 1522 aa41.09■■■■■ 4.17
SENCR-201ENST00000526269 ABCC8Q09428 1581 aa41.08■■■■■ 4.17
SENCR-201ENST00000526269 IFT140Q96RY7 1462 aa41.03■■■■■ 4.16
SENCR-201ENST00000526269 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41■■■■■ 4.15
SENCR-201ENST00000526269 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.87■■■■■ 4.13
SENCR-201ENST00000526269 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.84■■■■■ 4.13
SENCR-201ENST00000526269 OSCARQ8IYS5 282 aa40.82■■■■■ 4.13
SENCR-201ENST00000526269 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.73■■■■■ 4.11
SENCR-201ENST00000526269 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.69■■■■■ 4.1
SENCR-201ENST00000526269 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.67■■■■■ 4.1
SENCR-201ENST00000526269 TRIM41Q8WV44 630 aa40.59■■■■■ 4.09
SENCR-201ENST00000526269 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.55■■■■■ 4.08
SENCR-201ENST00000526269 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.52■■■■■ 4.08
SENCR-201ENST00000526269 SOGA1O94964 1423 aa40.52■■■■■ 4.08
SENCR-201ENST00000526269 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.51■■■■■ 4.08
SENCR-201ENST00000526269 CUX1P39880 1505 aa40.5■■■■■ 4.07
SENCR-201ENST00000526269 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.38■■■■■ 4.06
SENCR-201ENST00000526269 WDR97A6NE52 1622 aa40.37■■■■■ 4.05
SENCR-201ENST00000526269 CHD1O14646 1710 aa40.35■■■■■ 4.05
SENCR-201ENST00000526269 FBLN2P98095 1184 aa40.29■■■■■ 4.04
SENCR-201ENST00000526269 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.25■■■■■ 4.03
SENCR-201ENST00000526269 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.25■■■■■ 4.03
SENCR-201ENST00000526269 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.25■■■■■ 4.03
SENCR-201ENST00000526269 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.2■■■■■ 4.03
SENCR-201ENST00000526269 ARHGEF11O15085 1522 aa40.16■■■■■ 4.02
SENCR-201ENST00000526269 GRIN2BQ13224 1484 aa40.15■■■■■ 4.02
SENCR-201ENST00000526269 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.13■■■■■ 4.01
SENCR-201ENST00000526269 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.06■■■■■ 4
SENCR-201ENST00000526269 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.06■■■■■ 4
SENCR-201ENST00000526269 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.05■■■■■ 4
SENCR-201ENST00000526269 PBRM1Q86U86 1689 aa40.04■■■■■ 4
SENCR-201ENST00000526269 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.02■■■■■ 4
SENCR-201ENST00000526269 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.99■■■■□ 3.99
SENCR-201ENST00000526269 TOP2BQ02880 1626 aa39.98■■■■□ 3.99
SENCR-201ENST00000526269 SYNJ2O15056 1496 aa39.97■■■■□ 3.99
SENCR-201ENST00000526269 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.97■■■■□ 3.99
SENCR-201ENST00000526269 SYNJ1O43426 1573 aa39.95■■■■□ 3.99
SENCR-201ENST00000526269 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.86■■■■□ 3.97
SENCR-201ENST00000526269 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.83■■■■□ 3.97
SENCR-201ENST00000526269 ARAP1Q96P48 1450 aa39.78■■■■□ 3.96
SENCR-201ENST00000526269 ADAMTS12P58397 1594 aa39.67■■■■□ 3.94
SENCR-201ENST00000526269 GRIN2AQ12879 1464 aa39.62■■■■□ 3.93
SENCR-201ENST00000526269 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.59■■■■□ 3.93
SENCR-201ENST00000526269 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.57■■■■□ 3.92
SENCR-201ENST00000526269 NUP160Q12769 1436 aa39.45■■■■□ 3.91
SENCR-201ENST00000526269 CEP170Q5SW79 1584 aa39.44■■■■□ 3.9
SENCR-201ENST00000526269 TRHP20396 242 aaPredicted RBP39.34■■■■□ 3.89
SENCR-201ENST00000526269 KIF27Q86VH2 1401 aa39.25■■■■□ 3.87
SENCR-201ENST00000526269 SHROOM2Q13796 1616 aa39.24■■■■□ 3.87
SENCR-201ENST00000526269 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.23■■■■□ 3.87
SENCR-201ENST00000526269 CUL7Q14999 1698 aa39.13■■■■□ 3.85
SENCR-201ENST00000526269 IGF1RP08069 1367 aa39.1■■■■□ 3.85
SENCR-201ENST00000526269 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.09■■■■□ 3.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.3 ms