RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423717.1

EPDR1-202, Transcript of ependymin related 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene EPDR1, Length 638 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPDR1-202ENST00000423717 NISCHQ9Y2I1 1504 aa54.38■■■■■ 6.3
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EPDR1-202ENST00000423717 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.64■■■■■ 4.9
EPDR1-202ENST00000423717 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.34■■■■■ 4.85
EPDR1-202ENST00000423717 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.31■■■■■ 4.84
EPDR1-202ENST00000423717 NACADO15069 1562 aa45.28■■■■■ 4.84
EPDR1-202ENST00000423717 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.97■■■■■ 4.79
EPDR1-202ENST00000423717 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa44.9■■■■■ 4.78
EPDR1-202ENST00000423717 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.35■■■■■ 4.69
EPDR1-202ENST00000423717 SCRIBQ14160 1630 aa44.17■■■■■ 4.66
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EPDR1-202ENST00000423717 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.57■■■■■ 4.41
EPDR1-202ENST00000423717 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.38■■■■■ 4.38
EPDR1-202ENST00000423717 SMARCA4P51532 1647 aa42.17■■■■■ 4.34
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EPDR1-202ENST00000423717 SMARCA2P51531 1590 aa41.83■■■■■ 4.29
EPDR1-202ENST00000423717 NCAPD3P42695 1498 aa41.75■■■■■ 4.27
EPDR1-202ENST00000423717 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.64■■■■■ 4.26
EPDR1-202ENST00000423717 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.6■■■■■ 4.25
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EPDR1-202ENST00000423717 WIZO95785 1651 aa41.57■■■■■ 4.25
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EPDR1-202ENST00000423717 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.67■■■■■ 4.1
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EPDR1-202ENST00000423717 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.35■■■■■ 4.05
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EPDR1-202ENST00000423717 ABCC8Q09428 1581 aa39.53■■■■□ 3.92
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EPDR1-202ENST00000423717 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.6■■■■□ 3.77
EPDR1-202ENST00000423717 PBRM1Q86U86 1689 aa38.59■■■■□ 3.77
EPDR1-202ENST00000423717 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.55■■■■□ 3.76
EPDR1-202ENST00000423717 FBLN2P98095 1184 aa38.54■■■■□ 3.76
EPDR1-202ENST00000423717 TRIM41Q8WV44 630 aa38.54■■■■□ 3.76
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EPDR1-202ENST00000423717 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP37.84■■■■□ 3.65
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EPDR1-202ENST00000423717 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.79■■■■□ 3.64
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EPDR1-202ENST00000423717 CSRNP3Q8WYN3 585 aa37.74■■■■□ 3.63
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