Protein–RNA interactions for Protein: U3KQE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQE9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
U3KQE9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
U3KQE9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
U3KQE9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
U3KQE9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
U3KQE9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
U3KQE9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
U3KQE9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
U3KQE9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
U3KQE9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
U3KQE9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
U3KQE9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
U3KQE9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
U3KQE9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
U3KQE9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
U3KQE9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
U3KQE9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
U3KQE9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
U3KQE9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
U3KQE9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
U3KQE9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
U3KQE9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
U3KQE9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
U3KQE9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
U3KQE9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
U3KQE9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
U3KQE9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
U3KQE9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
U3KQE9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
U3KQE9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
U3KQE9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
U3KQE9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
U3KQE9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
U3KQE9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
U3KQE9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
U3KQE9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
U3KQE9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
U3KQE9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
U3KQE9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
U3KQE9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
U3KQE9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
U3KQE9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
U3KQE9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
U3KQE9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
U3KQE9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
U3KQE9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
U3KQE9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
U3KQE9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
U3KQE9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
U3KQE9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
U3KQE9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
U3KQE9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
U3KQE9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
U3KQE9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
U3KQE9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
U3KQE9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
U3KQE9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
U3KQE9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
U3KQE9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
U3KQE9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
U3KQE9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
U3KQE9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
U3KQE9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
U3KQE9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
U3KQE9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
U3KQE9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
U3KQE9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
U3KQE9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
U3KQE9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
U3KQE9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
U3KQE9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
U3KQE9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
U3KQE9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
U3KQE9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
U3KQE9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
U3KQE9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
U3KQE9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
U3KQE9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
U3KQE9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
U3KQE9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
U3KQE9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
U3KQE9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
U3KQE9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
U3KQE9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
U3KQE9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
U3KQE9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
U3KQE9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
U3KQE9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
U3KQE9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
U3KQE9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
U3KQE9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
U3KQE9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
U3KQE9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
U3KQE9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
U3KQE9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
U3KQE9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
U3KQE9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
U3KQE9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
U3KQE9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
U3KQE9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms