Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5G5

PCDHGA8, Protocadherin gamma-A8, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHGA8Q9Y5G5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PCDHGA8Q9Y5G5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PCDHGA8Q9Y5G5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PCDHGA8Q9Y5G5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PCDHGA8Q9Y5G5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PCDHGA8Q9Y5G5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PCDHGA8Q9Y5G5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PCDHGA8Q9Y5G5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCDHGA8Q9Y5G5 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCDHGA8Q9Y5G5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCDHGA8Q9Y5G5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PCDHGA8Q9Y5G5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PCDHGA8Q9Y5G5 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PCDHGA8Q9Y5G5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PCDHGA8Q9Y5G5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PCDHGA8Q9Y5G5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PCDHGA8Q9Y5G5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PCDHGA8Q9Y5G5 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCDHGA8Q9Y5G5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCDHGA8Q9Y5G5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCDHGA8Q9Y5G5 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCDHGA8Q9Y5G5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCDHGA8Q9Y5G5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCDHGA8Q9Y5G5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCDHGA8Q9Y5G5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCDHGA8Q9Y5G5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCDHGA8Q9Y5G5 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PCDHGA8Q9Y5G5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PCDHGA8Q9Y5G5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCDHGA8Q9Y5G5 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCDHGA8Q9Y5G5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PCDHGA8Q9Y5G5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PCDHGA8Q9Y5G5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PCDHGA8Q9Y5G5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCDHGA8Q9Y5G5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PCDHGA8Q9Y5G5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCDHGA8Q9Y5G5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCDHGA8Q9Y5G5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCDHGA8Q9Y5G5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PCDHGA8Q9Y5G5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PCDHGA8Q9Y5G5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCDHGA8Q9Y5G5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PCDHGA8Q9Y5G5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCDHGA8Q9Y5G5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PCDHGA8Q9Y5G5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PCDHGA8Q9Y5G5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PCDHGA8Q9Y5G5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PCDHGA8Q9Y5G5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PCDHGA8Q9Y5G5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PCDHGA8Q9Y5G5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PCDHGA8Q9Y5G5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCDHGA8Q9Y5G5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PCDHGA8Q9Y5G5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCDHGA8Q9Y5G5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCDHGA8Q9Y5G5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCDHGA8Q9Y5G5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCDHGA8Q9Y5G5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCDHGA8Q9Y5G5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCDHGA8Q9Y5G5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PCDHGA8Q9Y5G5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCDHGA8Q9Y5G5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCDHGA8Q9Y5G5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCDHGA8Q9Y5G5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PCDHGA8Q9Y5G5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCDHGA8Q9Y5G5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCDHGA8Q9Y5G5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCDHGA8Q9Y5G5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCDHGA8Q9Y5G5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCDHGA8Q9Y5G5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCDHGA8Q9Y5G5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCDHGA8Q9Y5G5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCDHGA8Q9Y5G5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCDHGA8Q9Y5G5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCDHGA8Q9Y5G5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCDHGA8Q9Y5G5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCDHGA8Q9Y5G5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCDHGA8Q9Y5G5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCDHGA8Q9Y5G5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PCDHGA8Q9Y5G5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PCDHGA8Q9Y5G5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PCDHGA8Q9Y5G5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PCDHGA8Q9Y5G5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PCDHGA8Q9Y5G5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PCDHGA8Q9Y5G5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PCDHGA8Q9Y5G5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PCDHGA8Q9Y5G5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PCDHGA8Q9Y5G5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PCDHGA8Q9Y5G5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PCDHGA8Q9Y5G5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PCDHGA8Q9Y5G5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PCDHGA8Q9Y5G5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PCDHGA8Q9Y5G5 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PCDHGA8Q9Y5G5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PCDHGA8Q9Y5G5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PCDHGA8Q9Y5G5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PCDHGA8Q9Y5G5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PCDHGA8Q9Y5G5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PCDHGA8Q9Y5G5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PCDHGA8Q9Y5G5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PCDHGA8Q9Y5G5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms