Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5G0

PCDHGB5, Protocadherin gamma-B5, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHGB5Q9Y5G0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCDHGB5Q9Y5G0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCDHGB5Q9Y5G0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCDHGB5Q9Y5G0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCDHGB5Q9Y5G0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCDHGB5Q9Y5G0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCDHGB5Q9Y5G0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCDHGB5Q9Y5G0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCDHGB5Q9Y5G0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCDHGB5Q9Y5G0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCDHGB5Q9Y5G0 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCDHGB5Q9Y5G0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCDHGB5Q9Y5G0 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PCDHGB5Q9Y5G0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PCDHGB5Q9Y5G0 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PCDHGB5Q9Y5G0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PCDHGB5Q9Y5G0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PCDHGB5Q9Y5G0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCDHGB5Q9Y5G0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCDHGB5Q9Y5G0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PCDHGB5Q9Y5G0 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCDHGB5Q9Y5G0 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCDHGB5Q9Y5G0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCDHGB5Q9Y5G0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCDHGB5Q9Y5G0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCDHGB5Q9Y5G0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCDHGB5Q9Y5G0 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCDHGB5Q9Y5G0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCDHGB5Q9Y5G0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCDHGB5Q9Y5G0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PCDHGB5Q9Y5G0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PCDHGB5Q9Y5G0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCDHGB5Q9Y5G0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCDHGB5Q9Y5G0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCDHGB5Q9Y5G0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCDHGB5Q9Y5G0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCDHGB5Q9Y5G0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCDHGB5Q9Y5G0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCDHGB5Q9Y5G0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCDHGB5Q9Y5G0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCDHGB5Q9Y5G0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCDHGB5Q9Y5G0 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCDHGB5Q9Y5G0 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCDHGB5Q9Y5G0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCDHGB5Q9Y5G0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCDHGB5Q9Y5G0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCDHGB5Q9Y5G0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCDHGB5Q9Y5G0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCDHGB5Q9Y5G0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCDHGB5Q9Y5G0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCDHGB5Q9Y5G0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCDHGB5Q9Y5G0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCDHGB5Q9Y5G0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCDHGB5Q9Y5G0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCDHGB5Q9Y5G0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCDHGB5Q9Y5G0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCDHGB5Q9Y5G0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCDHGB5Q9Y5G0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCDHGB5Q9Y5G0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCDHGB5Q9Y5G0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCDHGB5Q9Y5G0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PCDHGB5Q9Y5G0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PCDHGB5Q9Y5G0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PCDHGB5Q9Y5G0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PCDHGB5Q9Y5G0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PCDHGB5Q9Y5G0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCDHGB5Q9Y5G0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCDHGB5Q9Y5G0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCDHGB5Q9Y5G0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCDHGB5Q9Y5G0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCDHGB5Q9Y5G0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCDHGB5Q9Y5G0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCDHGB5Q9Y5G0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCDHGB5Q9Y5G0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCDHGB5Q9Y5G0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCDHGB5Q9Y5G0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCDHGB5Q9Y5G0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCDHGB5Q9Y5G0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCDHGB5Q9Y5G0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCDHGB5Q9Y5G0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCDHGB5Q9Y5G0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCDHGB5Q9Y5G0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCDHGB5Q9Y5G0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCDHGB5Q9Y5G0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCDHGB5Q9Y5G0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCDHGB5Q9Y5G0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCDHGB5Q9Y5G0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCDHGB5Q9Y5G0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCDHGB5Q9Y5G0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCDHGB5Q9Y5G0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCDHGB5Q9Y5G0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCDHGB5Q9Y5G0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCDHGB5Q9Y5G0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCDHGB5Q9Y5G0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PCDHGB5Q9Y5G0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PCDHGB5Q9Y5G0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCDHGB5Q9Y5G0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCDHGB5Q9Y5G0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCDHGB5Q9Y5G0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCDHGB5Q9Y5G0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms