Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y385

UBE2J1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J1Q9Y385 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE2J1Q9Y385 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE2J1Q9Y385 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE2J1Q9Y385 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE2J1Q9Y385 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE2J1Q9Y385 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE2J1Q9Y385 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE2J1Q9Y385 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE2J1Q9Y385 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE2J1Q9Y385 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE2J1Q9Y385 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE2J1Q9Y385 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE2J1Q9Y385 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE2J1Q9Y385 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE2J1Q9Y385 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE2J1Q9Y385 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE2J1Q9Y385 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE2J1Q9Y385 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE2J1Q9Y385 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE2J1Q9Y385 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE2J1Q9Y385 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE2J1Q9Y385 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE2J1Q9Y385 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE2J1Q9Y385 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE2J1Q9Y385 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE2J1Q9Y385 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE2J1Q9Y385 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE2J1Q9Y385 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE2J1Q9Y385 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE2J1Q9Y385 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE2J1Q9Y385 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE2J1Q9Y385 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE2J1Q9Y385 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE2J1Q9Y385 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE2J1Q9Y385 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE2J1Q9Y385 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE2J1Q9Y385 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE2J1Q9Y385 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE2J1Q9Y385 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE2J1Q9Y385 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE2J1Q9Y385 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE2J1Q9Y385 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE2J1Q9Y385 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE2J1Q9Y385 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE2J1Q9Y385 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE2J1Q9Y385 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE2J1Q9Y385 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE2J1Q9Y385 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE2J1Q9Y385 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UBE2J1Q9Y385 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE2J1Q9Y385 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE2J1Q9Y385 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE2J1Q9Y385 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE2J1Q9Y385 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE2J1Q9Y385 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE2J1Q9Y385 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE2J1Q9Y385 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE2J1Q9Y385 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE2J1Q9Y385 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE2J1Q9Y385 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
UBE2J1Q9Y385 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
UBE2J1Q9Y385 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE2J1Q9Y385 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE2J1Q9Y385 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE2J1Q9Y385 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE2J1Q9Y385 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE2J1Q9Y385 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE2J1Q9Y385 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE2J1Q9Y385 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE2J1Q9Y385 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE2J1Q9Y385 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE2J1Q9Y385 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE2J1Q9Y385 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBE2J1Q9Y385 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE2J1Q9Y385 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE2J1Q9Y385 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE2J1Q9Y385 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE2J1Q9Y385 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
UBE2J1Q9Y385 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE2J1Q9Y385 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE2J1Q9Y385 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE2J1Q9Y385 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE2J1Q9Y385 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE2J1Q9Y385 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE2J1Q9Y385 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE2J1Q9Y385 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE2J1Q9Y385 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE2J1Q9Y385 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE2J1Q9Y385 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE2J1Q9Y385 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE2J1Q9Y385 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE2J1Q9Y385 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE2J1Q9Y385 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE2J1Q9Y385 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE2J1Q9Y385 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE2J1Q9Y385 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE2J1Q9Y385 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE2J1Q9Y385 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE2J1Q9Y385 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE2J1Q9Y385 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms