Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M0

FAN1, Fanconi-associated nuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAN1Q9Y2M0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
FAN1Q9Y2M0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
FAN1Q9Y2M0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
FAN1Q9Y2M0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
FAN1Q9Y2M0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
FAN1Q9Y2M0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
FAN1Q9Y2M0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
FAN1Q9Y2M0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
FAN1Q9Y2M0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
FAN1Q9Y2M0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
FAN1Q9Y2M0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
FAN1Q9Y2M0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
FAN1Q9Y2M0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
FAN1Q9Y2M0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
FAN1Q9Y2M0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
FAN1Q9Y2M0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
FAN1Q9Y2M0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
FAN1Q9Y2M0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
FAN1Q9Y2M0 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
FAN1Q9Y2M0 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
FAN1Q9Y2M0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
FAN1Q9Y2M0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
FAN1Q9Y2M0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
FAN1Q9Y2M0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
FAN1Q9Y2M0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
FAN1Q9Y2M0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
FAN1Q9Y2M0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
FAN1Q9Y2M0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
FAN1Q9Y2M0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
FAN1Q9Y2M0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
FAN1Q9Y2M0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
FAN1Q9Y2M0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
FAN1Q9Y2M0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
FAN1Q9Y2M0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
FAN1Q9Y2M0 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
FAN1Q9Y2M0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
FAN1Q9Y2M0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
FAN1Q9Y2M0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
FAN1Q9Y2M0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
FAN1Q9Y2M0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
FAN1Q9Y2M0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
FAN1Q9Y2M0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
FAN1Q9Y2M0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
FAN1Q9Y2M0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
FAN1Q9Y2M0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
FAN1Q9Y2M0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
FAN1Q9Y2M0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
FAN1Q9Y2M0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
FAN1Q9Y2M0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
FAN1Q9Y2M0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
FAN1Q9Y2M0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
FAN1Q9Y2M0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
FAN1Q9Y2M0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
FAN1Q9Y2M0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
FAN1Q9Y2M0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
FAN1Q9Y2M0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
FAN1Q9Y2M0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
FAN1Q9Y2M0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
FAN1Q9Y2M0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
FAN1Q9Y2M0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
FAN1Q9Y2M0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
FAN1Q9Y2M0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
FAN1Q9Y2M0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
FAN1Q9Y2M0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
FAN1Q9Y2M0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
FAN1Q9Y2M0 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
FAN1Q9Y2M0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
FAN1Q9Y2M0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.41
FAN1Q9Y2M0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
FAN1Q9Y2M0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
FAN1Q9Y2M0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
FAN1Q9Y2M0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
FAN1Q9Y2M0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
FAN1Q9Y2M0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
FAN1Q9Y2M0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
FAN1Q9Y2M0 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
FAN1Q9Y2M0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
FAN1Q9Y2M0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
FAN1Q9Y2M0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
FAN1Q9Y2M0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
FAN1Q9Y2M0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
FAN1Q9Y2M0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
FAN1Q9Y2M0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
FAN1Q9Y2M0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
FAN1Q9Y2M0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
FAN1Q9Y2M0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
FAN1Q9Y2M0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
FAN1Q9Y2M0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
FAN1Q9Y2M0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
FAN1Q9Y2M0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
FAN1Q9Y2M0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
FAN1Q9Y2M0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
FAN1Q9Y2M0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
FAN1Q9Y2M0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
FAN1Q9Y2M0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
FAN1Q9Y2M0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
FAN1Q9Y2M0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
FAN1Q9Y2M0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
FAN1Q9Y2M0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
FAN1Q9Y2M0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms