Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
TNNQ9UQP3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
TNNQ9UQP3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
TNNQ9UQP3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
TNNQ9UQP3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
TNNQ9UQP3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC35.58■■■■□ 3.29
TNNQ9UQP3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
TNNQ9UQP3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
TNNQ9UQP3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
TNNQ9UQP3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
TNNQ9UQP3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
TNNQ9UQP3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
TNNQ9UQP3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
TNNQ9UQP3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC35.5■■■■□ 3.27
TNNQ9UQP3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
TNNQ9UQP3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
TNNQ9UQP3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
TNNQ9UQP3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
TNNQ9UQP3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
TNNQ9UQP3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
TNNQ9UQP3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC35.44■■■■□ 3.26
TNNQ9UQP3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
TNNQ9UQP3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
TNNQ9UQP3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
TNNQ9UQP3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
TNNQ9UQP3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
TNNQ9UQP3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
TNNQ9UQP3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC35.39■■■■□ 3.26
TNNQ9UQP3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
TNNQ9UQP3 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
TNNQ9UQP3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
TNNQ9UQP3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
TNNQ9UQP3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
TNNQ9UQP3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
TNNQ9UQP3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC35.34■■■■□ 3.25
TNNQ9UQP3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
TNNQ9UQP3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
TNNQ9UQP3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
TNNQ9UQP3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
TNNQ9UQP3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
TNNQ9UQP3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.23
TNNQ9UQP3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
TNNQ9UQP3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
TNNQ9UQP3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
TNNQ9UQP3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
TNNQ9UQP3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
TNNQ9UQP3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
TNNQ9UQP3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
TNNQ9UQP3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
TNNQ9UQP3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
TNNQ9UQP3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
TNNQ9UQP3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
TNNQ9UQP3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.22
TNNQ9UQP3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
TNNQ9UQP3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
TNNQ9UQP3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
TNNQ9UQP3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
TNNQ9UQP3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
TNNQ9UQP3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
TNNQ9UQP3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
TNNQ9UQP3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
TNNQ9UQP3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
TNNQ9UQP3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
TNNQ9UQP3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
TNNQ9UQP3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
TNNQ9UQP3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
TNNQ9UQP3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
TNNQ9UQP3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
TNNQ9UQP3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
TNNQ9UQP3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
TNNQ9UQP3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
TNNQ9UQP3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
TNNQ9UQP3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
TNNQ9UQP3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
TNNQ9UQP3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC35.05■■■■□ 3.2
TNNQ9UQP3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC35.02■■■■□ 3.2
TNNQ9UQP3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
TNNQ9UQP3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
TNNQ9UQP3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
TNNQ9UQP3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
TNNQ9UQP3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
TNNQ9UQP3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
TNNQ9UQP3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
TNNQ9UQP3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
TNNQ9UQP3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
TNNQ9UQP3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
TNNQ9UQP3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
TNNQ9UQP3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
TNNQ9UQP3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
TNNQ9UQP3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
TNNQ9UQP3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
TNNQ9UQP3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
TNNQ9UQP3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
TNNQ9UQP3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
TNNQ9UQP3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
TNNQ9UQP3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
TNNQ9UQP3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
TNNQ9UQP3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
TNNQ9UQP3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
TNNQ9UQP3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms