Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULW0

TPX2, Targeting protein for Xklp2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPX2Q9ULW0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TPX2Q9ULW0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
TPX2Q9ULW0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TPX2Q9ULW0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TPX2Q9ULW0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TPX2Q9ULW0 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TPX2Q9ULW0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TPX2Q9ULW0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TPX2Q9ULW0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TPX2Q9ULW0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TPX2Q9ULW0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TPX2Q9ULW0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TPX2Q9ULW0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TPX2Q9ULW0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TPX2Q9ULW0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TPX2Q9ULW0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TPX2Q9ULW0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TPX2Q9ULW0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TPX2Q9ULW0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TPX2Q9ULW0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TPX2Q9ULW0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
TPX2Q9ULW0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
TPX2Q9ULW0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TPX2Q9ULW0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TPX2Q9ULW0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TPX2Q9ULW0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TPX2Q9ULW0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TPX2Q9ULW0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TPX2Q9ULW0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TPX2Q9ULW0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TPX2Q9ULW0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TPX2Q9ULW0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TPX2Q9ULW0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TPX2Q9ULW0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TPX2Q9ULW0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TPX2Q9ULW0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TPX2Q9ULW0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TPX2Q9ULW0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TPX2Q9ULW0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TPX2Q9ULW0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TPX2Q9ULW0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.2
TPX2Q9ULW0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TPX2Q9ULW0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TPX2Q9ULW0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TPX2Q9ULW0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TPX2Q9ULW0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TPX2Q9ULW0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TPX2Q9ULW0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TPX2Q9ULW0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TPX2Q9ULW0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TPX2Q9ULW0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TPX2Q9ULW0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TPX2Q9ULW0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TPX2Q9ULW0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TPX2Q9ULW0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TPX2Q9ULW0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TPX2Q9ULW0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TPX2Q9ULW0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TPX2Q9ULW0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TPX2Q9ULW0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TPX2Q9ULW0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TPX2Q9ULW0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TPX2Q9ULW0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
TPX2Q9ULW0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TPX2Q9ULW0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TPX2Q9ULW0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TPX2Q9ULW0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TPX2Q9ULW0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TPX2Q9ULW0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
TPX2Q9ULW0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TPX2Q9ULW0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TPX2Q9ULW0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TPX2Q9ULW0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TPX2Q9ULW0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TPX2Q9ULW0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TPX2Q9ULW0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TPX2Q9ULW0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TPX2Q9ULW0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TPX2Q9ULW0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TPX2Q9ULW0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TPX2Q9ULW0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TPX2Q9ULW0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TPX2Q9ULW0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TPX2Q9ULW0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TPX2Q9ULW0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TPX2Q9ULW0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TPX2Q9ULW0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TPX2Q9ULW0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TPX2Q9ULW0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TPX2Q9ULW0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TPX2Q9ULW0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TPX2Q9ULW0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TPX2Q9ULW0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TPX2Q9ULW0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TPX2Q9ULW0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TPX2Q9ULW0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TPX2Q9ULW0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TPX2Q9ULW0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TPX2Q9ULW0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TPX2Q9ULW0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms