Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULN7

PNMA8B, Paraneoplastic antigen-like protein 8B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8BQ9ULN7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PNMA8BQ9ULN7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PNMA8BQ9ULN7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PNMA8BQ9ULN7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PNMA8BQ9ULN7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PNMA8BQ9ULN7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PNMA8BQ9ULN7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PNMA8BQ9ULN7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PNMA8BQ9ULN7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PNMA8BQ9ULN7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PNMA8BQ9ULN7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PNMA8BQ9ULN7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PNMA8BQ9ULN7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PNMA8BQ9ULN7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PNMA8BQ9ULN7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PNMA8BQ9ULN7 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PNMA8BQ9ULN7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PNMA8BQ9ULN7 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PNMA8BQ9ULN7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PNMA8BQ9ULN7 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PNMA8BQ9ULN7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PNMA8BQ9ULN7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PNMA8BQ9ULN7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PNMA8BQ9ULN7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PNMA8BQ9ULN7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PNMA8BQ9ULN7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PNMA8BQ9ULN7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PNMA8BQ9ULN7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PNMA8BQ9ULN7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PNMA8BQ9ULN7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PNMA8BQ9ULN7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PNMA8BQ9ULN7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PNMA8BQ9ULN7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
PNMA8BQ9ULN7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PNMA8BQ9ULN7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PNMA8BQ9ULN7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PNMA8BQ9ULN7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PNMA8BQ9ULN7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PNMA8BQ9ULN7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PNMA8BQ9ULN7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PNMA8BQ9ULN7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PNMA8BQ9ULN7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PNMA8BQ9ULN7 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PNMA8BQ9ULN7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PNMA8BQ9ULN7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PNMA8BQ9ULN7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PNMA8BQ9ULN7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PNMA8BQ9ULN7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PNMA8BQ9ULN7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PNMA8BQ9ULN7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PNMA8BQ9ULN7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PNMA8BQ9ULN7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PNMA8BQ9ULN7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PNMA8BQ9ULN7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PNMA8BQ9ULN7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PNMA8BQ9ULN7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PNMA8BQ9ULN7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PNMA8BQ9ULN7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PNMA8BQ9ULN7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PNMA8BQ9ULN7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PNMA8BQ9ULN7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PNMA8BQ9ULN7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PNMA8BQ9ULN7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PNMA8BQ9ULN7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PNMA8BQ9ULN7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PNMA8BQ9ULN7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PNMA8BQ9ULN7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PNMA8BQ9ULN7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PNMA8BQ9ULN7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PNMA8BQ9ULN7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PNMA8BQ9ULN7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PNMA8BQ9ULN7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PNMA8BQ9ULN7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PNMA8BQ9ULN7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PNMA8BQ9ULN7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PNMA8BQ9ULN7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PNMA8BQ9ULN7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PNMA8BQ9ULN7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PNMA8BQ9ULN7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PNMA8BQ9ULN7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PNMA8BQ9ULN7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PNMA8BQ9ULN7 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PNMA8BQ9ULN7 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PNMA8BQ9ULN7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PNMA8BQ9ULN7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PNMA8BQ9ULN7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PNMA8BQ9ULN7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PNMA8BQ9ULN7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PNMA8BQ9ULN7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PNMA8BQ9ULN7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PNMA8BQ9ULN7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PNMA8BQ9ULN7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PNMA8BQ9ULN7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PNMA8BQ9ULN7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PNMA8BQ9ULN7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PNMA8BQ9ULN7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PNMA8BQ9ULN7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PNMA8BQ9ULN7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PNMA8BQ9ULN7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PNMA8BQ9ULN7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.8 ms