Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC2LQ9UL33 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC2LQ9UL33 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC2LQ9UL33 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC2LQ9UL33 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC2LQ9UL33 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC2LQ9UL33 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC2LQ9UL33 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC2LQ9UL33 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC2LQ9UL33 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC2LQ9UL33 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC2LQ9UL33 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAPPC2LQ9UL33 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAPPC2LQ9UL33 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC2LQ9UL33 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC2LQ9UL33 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC2LQ9UL33 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC2LQ9UL33 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC2LQ9UL33 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC2LQ9UL33 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRAPPC2LQ9UL33 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRAPPC2LQ9UL33 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRAPPC2LQ9UL33 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAPPC2LQ9UL33 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAPPC2LQ9UL33 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAPPC2LQ9UL33 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC2LQ9UL33 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC2LQ9UL33 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC2LQ9UL33 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC2LQ9UL33 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC2LQ9UL33 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAPPC2LQ9UL33 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC2LQ9UL33 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAPPC2LQ9UL33 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAPPC2LQ9UL33 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC2LQ9UL33 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC2LQ9UL33 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC2LQ9UL33 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC2LQ9UL33 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC2LQ9UL33 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC2LQ9UL33 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAPPC2LQ9UL33 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAPPC2LQ9UL33 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAPPC2LQ9UL33 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAPPC2LQ9UL33 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAPPC2LQ9UL33 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAPPC2LQ9UL33 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC2LQ9UL33 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC2LQ9UL33 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAPPC2LQ9UL33 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAPPC2LQ9UL33 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAPPC2LQ9UL33 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC2LQ9UL33 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC2LQ9UL33 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC2LQ9UL33 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC2LQ9UL33 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC2LQ9UL33 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC2LQ9UL33 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC2LQ9UL33 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC2LQ9UL33 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC2LQ9UL33 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC2LQ9UL33 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC2LQ9UL33 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC2LQ9UL33 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC2LQ9UL33 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC2LQ9UL33 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC2LQ9UL33 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC2LQ9UL33 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC2LQ9UL33 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC2LQ9UL33 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC2LQ9UL33 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAPPC2LQ9UL33 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAPPC2LQ9UL33 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC2LQ9UL33 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC2LQ9UL33 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC2LQ9UL33 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC2LQ9UL33 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC2LQ9UL33 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAPPC2LQ9UL33 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC2LQ9UL33 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC2LQ9UL33 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC2LQ9UL33 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC2LQ9UL33 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAPPC2LQ9UL33 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC2LQ9UL33 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC2LQ9UL33 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC2LQ9UL33 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC2LQ9UL33 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC2LQ9UL33 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC2LQ9UL33 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAPPC2LQ9UL33 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAPPC2LQ9UL33 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAPPC2LQ9UL33 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAPPC2LQ9UL33 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC2LQ9UL33 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC2LQ9UL33 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC2LQ9UL33 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC2LQ9UL33 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms