Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKZ1

CNOT11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT11Q9UKZ1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CNOT11Q9UKZ1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CNOT11Q9UKZ1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CNOT11Q9UKZ1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CNOT11Q9UKZ1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CNOT11Q9UKZ1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CNOT11Q9UKZ1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CNOT11Q9UKZ1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNOT11Q9UKZ1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CNOT11Q9UKZ1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CNOT11Q9UKZ1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CNOT11Q9UKZ1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CNOT11Q9UKZ1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CNOT11Q9UKZ1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CNOT11Q9UKZ1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CNOT11Q9UKZ1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CNOT11Q9UKZ1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CNOT11Q9UKZ1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CNOT11Q9UKZ1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CNOT11Q9UKZ1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CNOT11Q9UKZ1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNOT11Q9UKZ1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNOT11Q9UKZ1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CNOT11Q9UKZ1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CNOT11Q9UKZ1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CNOT11Q9UKZ1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CNOT11Q9UKZ1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CNOT11Q9UKZ1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNOT11Q9UKZ1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNOT11Q9UKZ1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNOT11Q9UKZ1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNOT11Q9UKZ1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNOT11Q9UKZ1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CNOT11Q9UKZ1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNOT11Q9UKZ1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNOT11Q9UKZ1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNOT11Q9UKZ1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNOT11Q9UKZ1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNOT11Q9UKZ1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CNOT11Q9UKZ1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CNOT11Q9UKZ1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CNOT11Q9UKZ1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CNOT11Q9UKZ1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CNOT11Q9UKZ1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CNOT11Q9UKZ1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CNOT11Q9UKZ1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CNOT11Q9UKZ1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CNOT11Q9UKZ1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CNOT11Q9UKZ1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CNOT11Q9UKZ1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CNOT11Q9UKZ1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CNOT11Q9UKZ1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CNOT11Q9UKZ1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CNOT11Q9UKZ1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CNOT11Q9UKZ1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CNOT11Q9UKZ1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CNOT11Q9UKZ1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CNOT11Q9UKZ1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CNOT11Q9UKZ1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CNOT11Q9UKZ1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CNOT11Q9UKZ1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CNOT11Q9UKZ1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CNOT11Q9UKZ1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CNOT11Q9UKZ1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CNOT11Q9UKZ1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CNOT11Q9UKZ1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNOT11Q9UKZ1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNOT11Q9UKZ1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CNOT11Q9UKZ1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNOT11Q9UKZ1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CNOT11Q9UKZ1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CNOT11Q9UKZ1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNOT11Q9UKZ1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNOT11Q9UKZ1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNOT11Q9UKZ1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNOT11Q9UKZ1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNOT11Q9UKZ1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNOT11Q9UKZ1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNOT11Q9UKZ1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNOT11Q9UKZ1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CNOT11Q9UKZ1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CNOT11Q9UKZ1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CNOT11Q9UKZ1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CNOT11Q9UKZ1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNOT11Q9UKZ1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNOT11Q9UKZ1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNOT11Q9UKZ1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNOT11Q9UKZ1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNOT11Q9UKZ1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNOT11Q9UKZ1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNOT11Q9UKZ1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNOT11Q9UKZ1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNOT11Q9UKZ1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNOT11Q9UKZ1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNOT11Q9UKZ1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNOT11Q9UKZ1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNOT11Q9UKZ1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNOT11Q9UKZ1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNOT11Q9UKZ1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNOT11Q9UKZ1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms