Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC42.4■■■■■ 4.38
CHIC2Q9UKJ5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC42.39■■■■■ 4.38
CHIC2Q9UKJ5 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC42.39■■■■■ 4.38
CHIC2Q9UKJ5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
CHIC2Q9UKJ5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC42.35■■■■■ 4.37
CHIC2Q9UKJ5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
CHIC2Q9UKJ5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
CHIC2Q9UKJ5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
CHIC2Q9UKJ5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.31■■■■■ 4.36
CHIC2Q9UKJ5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC42.31■■■■■ 4.36
CHIC2Q9UKJ5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC42.31■■■■■ 4.36
CHIC2Q9UKJ5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC42.3■■■■■ 4.36
CHIC2Q9UKJ5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
CHIC2Q9UKJ5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
CHIC2Q9UKJ5 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
CHIC2Q9UKJ5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
CHIC2Q9UKJ5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC42.26■■■■■ 4.36
CHIC2Q9UKJ5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
CHIC2Q9UKJ5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
CHIC2Q9UKJ5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.2■■■■■ 4.35
CHIC2Q9UKJ5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.19■■■■■ 4.34
CHIC2Q9UKJ5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
CHIC2Q9UKJ5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC42.1■■■■■ 4.33
CHIC2Q9UKJ5 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
CHIC2Q9UKJ5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC42.09■■■■■ 4.33
CHIC2Q9UKJ5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC42.06■■■■■ 4.32
CHIC2Q9UKJ5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
CHIC2Q9UKJ5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
CHIC2Q9UKJ5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
CHIC2Q9UKJ5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC41.98■■■■■ 4.31
CHIC2Q9UKJ5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
CHIC2Q9UKJ5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
CHIC2Q9UKJ5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.93■■■■■ 4.3
CHIC2Q9UKJ5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC41.92■■■■■ 4.3
CHIC2Q9UKJ5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC41.89■■■■■ 4.3
CHIC2Q9UKJ5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.88■■■■■ 4.29
CHIC2Q9UKJ5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.88■■■■■ 4.29
CHIC2Q9UKJ5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
CHIC2Q9UKJ5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
CHIC2Q9UKJ5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.87■■■■■ 4.29
CHIC2Q9UKJ5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC41.85■■■■■ 4.29
CHIC2Q9UKJ5 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC41.83■■■■■ 4.29
CHIC2Q9UKJ5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC41.82■■■■■ 4.29
CHIC2Q9UKJ5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC41.82■■■■■ 4.29
CHIC2Q9UKJ5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC41.79■■■■■ 4.28
CHIC2Q9UKJ5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC41.79■■■■■ 4.28
CHIC2Q9UKJ5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
CHIC2Q9UKJ5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
CHIC2Q9UKJ5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
CHIC2Q9UKJ5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
CHIC2Q9UKJ5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
CHIC2Q9UKJ5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
CHIC2Q9UKJ5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC41.72■■■■■ 4.27
CHIC2Q9UKJ5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC41.72■■■■■ 4.27
CHIC2Q9UKJ5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
CHIC2Q9UKJ5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
CHIC2Q9UKJ5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
CHIC2Q9UKJ5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC41.69■■■■■ 4.27
CHIC2Q9UKJ5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC41.69■■■■■ 4.26
CHIC2Q9UKJ5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
CHIC2Q9UKJ5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
CHIC2Q9UKJ5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
CHIC2Q9UKJ5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC41.65■■■■■ 4.26
CHIC2Q9UKJ5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC41.63■■■■■ 4.26
CHIC2Q9UKJ5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
CHIC2Q9UKJ5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
CHIC2Q9UKJ5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC41.62■■■■■ 4.25
CHIC2Q9UKJ5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
CHIC2Q9UKJ5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC41.59■■■■■ 4.25
CHIC2Q9UKJ5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.24
CHIC2Q9UKJ5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
CHIC2Q9UKJ5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
CHIC2Q9UKJ5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
CHIC2Q9UKJ5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
CHIC2Q9UKJ5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.5■■■■■ 4.23
CHIC2Q9UKJ5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC41.49■■■■■ 4.23
CHIC2Q9UKJ5 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
CHIC2Q9UKJ5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC41.48■■■■■ 4.23
CHIC2Q9UKJ5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
CHIC2Q9UKJ5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.46■■■■■ 4.23
CHIC2Q9UKJ5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
CHIC2Q9UKJ5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
CHIC2Q9UKJ5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.45■■■■■ 4.23
CHIC2Q9UKJ5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
CHIC2Q9UKJ5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
CHIC2Q9UKJ5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC41.43■■■■■ 4.22
CHIC2Q9UKJ5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC41.42■■■■■ 4.22
CHIC2Q9UKJ5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC41.41■■■■■ 4.22
CHIC2Q9UKJ5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC41.39■■■■■ 4.22
CHIC2Q9UKJ5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
CHIC2Q9UKJ5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
CHIC2Q9UKJ5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC41.37■■■■■ 4.21
CHIC2Q9UKJ5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC41.36■■■■■ 4.21
CHIC2Q9UKJ5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC41.36■■■■■ 4.21
CHIC2Q9UKJ5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
CHIC2Q9UKJ5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC41.35■■■■■ 4.21
CHIC2Q9UKJ5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
CHIC2Q9UKJ5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC41.33■■■■■ 4.21
CHIC2Q9UKJ5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.21
CHIC2Q9UKJ5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms