Protein–RNA interactions for Protein: Q9UID6

ZNF639, Zinc finger protein 639, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF639Q9UID6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
ZNF639Q9UID6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZNF639Q9UID6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZNF639Q9UID6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZNF639Q9UID6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
ZNF639Q9UID6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
ZNF639Q9UID6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNF639Q9UID6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNF639Q9UID6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNF639Q9UID6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF639Q9UID6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF639Q9UID6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF639Q9UID6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF639Q9UID6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF639Q9UID6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF639Q9UID6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNF639Q9UID6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNF639Q9UID6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNF639Q9UID6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNF639Q9UID6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF639Q9UID6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF639Q9UID6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF639Q9UID6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNF639Q9UID6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZNF639Q9UID6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZNF639Q9UID6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZNF639Q9UID6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZNF639Q9UID6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ZNF639Q9UID6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNF639Q9UID6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF639Q9UID6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF639Q9UID6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF639Q9UID6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF639Q9UID6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZNF639Q9UID6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZNF639Q9UID6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZNF639Q9UID6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZNF639Q9UID6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZNF639Q9UID6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZNF639Q9UID6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZNF639Q9UID6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZNF639Q9UID6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZNF639Q9UID6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNF639Q9UID6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF639Q9UID6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF639Q9UID6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF639Q9UID6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF639Q9UID6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF639Q9UID6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF639Q9UID6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF639Q9UID6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF639Q9UID6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF639Q9UID6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF639Q9UID6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF639Q9UID6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZNF639Q9UID6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF639Q9UID6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF639Q9UID6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF639Q9UID6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF639Q9UID6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF639Q9UID6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF639Q9UID6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNF639Q9UID6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNF639Q9UID6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF639Q9UID6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF639Q9UID6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF639Q9UID6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF639Q9UID6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF639Q9UID6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF639Q9UID6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF639Q9UID6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF639Q9UID6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF639Q9UID6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF639Q9UID6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF639Q9UID6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF639Q9UID6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF639Q9UID6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF639Q9UID6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF639Q9UID6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF639Q9UID6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF639Q9UID6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF639Q9UID6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF639Q9UID6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF639Q9UID6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF639Q9UID6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF639Q9UID6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF639Q9UID6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF639Q9UID6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
ZNF639Q9UID6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF639Q9UID6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF639Q9UID6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF639Q9UID6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF639Q9UID6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF639Q9UID6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF639Q9UID6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF639Q9UID6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF639Q9UID6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF639Q9UID6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF639Q9UID6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF639Q9UID6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms