Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHA4

LAMTOR3, Ragulator complex protein LAMTOR3, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMTOR3Q9UHA4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LAMTOR3Q9UHA4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LAMTOR3Q9UHA4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LAMTOR3Q9UHA4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LAMTOR3Q9UHA4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LAMTOR3Q9UHA4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LAMTOR3Q9UHA4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LAMTOR3Q9UHA4 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMTOR3Q9UHA4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMTOR3Q9UHA4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMTOR3Q9UHA4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMTOR3Q9UHA4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMTOR3Q9UHA4 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LAMTOR3Q9UHA4 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LAMTOR3Q9UHA4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LAMTOR3Q9UHA4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LAMTOR3Q9UHA4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LAMTOR3Q9UHA4 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LAMTOR3Q9UHA4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LAMTOR3Q9UHA4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LAMTOR3Q9UHA4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LAMTOR3Q9UHA4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LAMTOR3Q9UHA4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LAMTOR3Q9UHA4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LAMTOR3Q9UHA4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LAMTOR3Q9UHA4 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LAMTOR3Q9UHA4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LAMTOR3Q9UHA4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LAMTOR3Q9UHA4 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LAMTOR3Q9UHA4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LAMTOR3Q9UHA4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LAMTOR3Q9UHA4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LAMTOR3Q9UHA4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LAMTOR3Q9UHA4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LAMTOR3Q9UHA4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LAMTOR3Q9UHA4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LAMTOR3Q9UHA4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
LAMTOR3Q9UHA4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LAMTOR3Q9UHA4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LAMTOR3Q9UHA4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LAMTOR3Q9UHA4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAMTOR3Q9UHA4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAMTOR3Q9UHA4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAMTOR3Q9UHA4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LAMTOR3Q9UHA4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LAMTOR3Q9UHA4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LAMTOR3Q9UHA4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LAMTOR3Q9UHA4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LAMTOR3Q9UHA4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LAMTOR3Q9UHA4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LAMTOR3Q9UHA4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LAMTOR3Q9UHA4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LAMTOR3Q9UHA4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LAMTOR3Q9UHA4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LAMTOR3Q9UHA4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LAMTOR3Q9UHA4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LAMTOR3Q9UHA4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LAMTOR3Q9UHA4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LAMTOR3Q9UHA4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LAMTOR3Q9UHA4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LAMTOR3Q9UHA4 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LAMTOR3Q9UHA4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LAMTOR3Q9UHA4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LAMTOR3Q9UHA4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LAMTOR3Q9UHA4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LAMTOR3Q9UHA4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAMTOR3Q9UHA4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAMTOR3Q9UHA4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAMTOR3Q9UHA4 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAMTOR3Q9UHA4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LAMTOR3Q9UHA4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LAMTOR3Q9UHA4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LAMTOR3Q9UHA4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LAMTOR3Q9UHA4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAMTOR3Q9UHA4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAMTOR3Q9UHA4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAMTOR3Q9UHA4 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LAMTOR3Q9UHA4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LAMTOR3Q9UHA4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LAMTOR3Q9UHA4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAMTOR3Q9UHA4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMTOR3Q9UHA4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMTOR3Q9UHA4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAMTOR3Q9UHA4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LAMTOR3Q9UHA4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAMTOR3Q9UHA4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAMTOR3Q9UHA4 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAMTOR3Q9UHA4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAMTOR3Q9UHA4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LAMTOR3Q9UHA4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LAMTOR3Q9UHA4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LAMTOR3Q9UHA4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LAMTOR3Q9UHA4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
LAMTOR3Q9UHA4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LAMTOR3Q9UHA4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LAMTOR3Q9UHA4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LAMTOR3Q9UHA4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LAMTOR3Q9UHA4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LAMTOR3Q9UHA4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAMTOR3Q9UHA4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms