Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBL6

CPNE7, Copine-7, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE7Q9UBL6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CPNE7Q9UBL6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CPNE7Q9UBL6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CPNE7Q9UBL6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CPNE7Q9UBL6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CPNE7Q9UBL6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CPNE7Q9UBL6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CPNE7Q9UBL6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CPNE7Q9UBL6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CPNE7Q9UBL6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CPNE7Q9UBL6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CPNE7Q9UBL6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CPNE7Q9UBL6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CPNE7Q9UBL6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CPNE7Q9UBL6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CPNE7Q9UBL6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CPNE7Q9UBL6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CPNE7Q9UBL6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CPNE7Q9UBL6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CPNE7Q9UBL6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CPNE7Q9UBL6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CPNE7Q9UBL6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CPNE7Q9UBL6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CPNE7Q9UBL6 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CPNE7Q9UBL6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CPNE7Q9UBL6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CPNE7Q9UBL6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CPNE7Q9UBL6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CPNE7Q9UBL6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CPNE7Q9UBL6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CPNE7Q9UBL6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CPNE7Q9UBL6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CPNE7Q9UBL6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CPNE7Q9UBL6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CPNE7Q9UBL6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CPNE7Q9UBL6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CPNE7Q9UBL6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CPNE7Q9UBL6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CPNE7Q9UBL6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CPNE7Q9UBL6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CPNE7Q9UBL6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CPNE7Q9UBL6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CPNE7Q9UBL6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CPNE7Q9UBL6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CPNE7Q9UBL6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CPNE7Q9UBL6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CPNE7Q9UBL6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CPNE7Q9UBL6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CPNE7Q9UBL6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CPNE7Q9UBL6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CPNE7Q9UBL6 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CPNE7Q9UBL6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CPNE7Q9UBL6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CPNE7Q9UBL6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CPNE7Q9UBL6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CPNE7Q9UBL6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CPNE7Q9UBL6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CPNE7Q9UBL6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
CPNE7Q9UBL6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CPNE7Q9UBL6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CPNE7Q9UBL6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CPNE7Q9UBL6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CPNE7Q9UBL6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CPNE7Q9UBL6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CPNE7Q9UBL6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CPNE7Q9UBL6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CPNE7Q9UBL6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CPNE7Q9UBL6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CPNE7Q9UBL6 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CPNE7Q9UBL6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CPNE7Q9UBL6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CPNE7Q9UBL6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CPNE7Q9UBL6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CPNE7Q9UBL6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CPNE7Q9UBL6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CPNE7Q9UBL6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CPNE7Q9UBL6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CPNE7Q9UBL6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CPNE7Q9UBL6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CPNE7Q9UBL6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CPNE7Q9UBL6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CPNE7Q9UBL6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CPNE7Q9UBL6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CPNE7Q9UBL6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CPNE7Q9UBL6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CPNE7Q9UBL6 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CPNE7Q9UBL6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CPNE7Q9UBL6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CPNE7Q9UBL6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CPNE7Q9UBL6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CPNE7Q9UBL6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CPNE7Q9UBL6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CPNE7Q9UBL6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CPNE7Q9UBL6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CPNE7Q9UBL6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CPNE7Q9UBL6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CPNE7Q9UBL6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CPNE7Q9UBL6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CPNE7Q9UBL6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CPNE7Q9UBL6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms